Q00597  FANCC_HUMAN

Gene name: FANCC   Description: Fanconi anemia group C protein

Length: 558    GTS: 1.439e-06   GTS percentile: 0.420     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 313      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQDSVDLSCDYQFWMQKLSVWDQASTLETQQDTCLHVAQFQEFLRKMYEALKEMDSNTVIERFPTIGQLLAKACWNPFILAYDESQKILIWCLCCLINK 100
BenignSAV:          A                   F                                                     T                    
gnomAD_SAV:    I H  AAPFG #R  LK  TE*   FI  S    SVQL L *K  K  C     IVP II   C I R RMT G   H T  C G  Q  VRY  F    
Conservation:  1211101101131486174106332130234274325512512552243106302331233213713343535262432535132331253375127332
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH   HHHHHHHH    EEEE HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H H     HHHHHHHH    EEEE  HHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHH   EEEE HHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EPQNSGQSKLNSWIQGVLSHILSALRFDKEVALFTQGLGYAPIDYYPGLLKNMVLSLASELRENHLNGFNTQRRMAPERVASLSRVCVPLITLTDVDPLV 200
PathogenicSAV:                                                                                               V     
BenignSAV:                                           E                                      Q           F          
gnomAD_SAV:             P# * *RI P TF E   G # G   #V E   M H L  P YII  SP     DRR   S # #VP#KQMV  L#IY A T   HFE PL
Conservation:  2613335243526431463353423211122003120343331474115635361243234112212102111232111312271253455343521774
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH     HHH HHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH       HHHH
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH HH             HHHHHHHHHH   H      HHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EALLICHGREPQEILQPEFFEAVNEAILLKKISLPMSAVVCLWLRHLPSLEKAMLHLFEKLISSERNCLRRIECFIKDSSLPQAACHPAIFRVVDEMFRC 300
gnomAD_SAV:     P  V LRC R G F  V    A QV  R  T   #  IA P  Q  SGI   VPRP  Q M G  SSV*KMQ LV ETL   V  P V LQ I   #S 
Conservation:  2489142102124172128533443414111425312342379344435771735144225241000142141013115483435133356323434451
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHH HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HHH  HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHH HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALLETDGALEIIATIQVFTQCFVEALEKASKQLRFALKTYFPYTSPSLAMVLLQDPQDIPRGHWLQTLKHISELLREAVEDQTHGSCGGPFESWFLFIHF 400
BenignSAV:                V            T                                                                           
gnomAD_SAV:    EF   N   KVVP  *  MR   AT    RRPPQ SF SCLA  F    VM   HHEG L#V R  A  RV          E REPR* H Q     # V
Conservation:  3632233211411234285136212201111402246525861112164116331604341013122802430154112421002210026418555345
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEHH        HHHHHH  HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE     HHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEHHH      HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGWAEMVAEQLLMSAAEPPTALLWLLAFYYGPRDGRQQRAQTMVQVKAVLGHLLAMSRSSSLSAQDLQTVAGQGTDTDLRAPAQQLIRHLLLNFLLWAPG 500
PathogenicSAV:                                                                                                R    
BenignSAV:                                                     M               R                                   
gnomAD_SAV:    R   DI  K   TLVTKL#MTVQG    N   CN    K   I  M  M ARH ST S N    R   MA R   GI      K*#    V KL  SV E
Conservation:  5283325243732111212125877638441902204242223313324212610421011122115112210010011022010621292335334321
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                       D   DD                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      D     DD                         

                       10        20        30        40        50        
AA:            GHTIAWDVITLMAHTAEITHEIIGFLDQTLYRWNRLGIESPRSEKLARELLKELRTQV 558
PathogenicSAV:                                                      P    
gnomAD_SAV:    D M T    N   YS     K  DL    S K*DHPV     # R  *   R P* EF
Conservation:  1201313131032011210022102501210322002021102121311151120110
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                            
DO_SPOTD:                                                                
DO_IUPRED2A: