Q03518  TAP1_HUMAN

Gene name: TAP1   Description: Antigen peptide transporter 1

Length: 808    GTS: 9.458e-07   GTS percentile: 0.201     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 21      gnomAD_SAV: 344      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAELLASAGSACSWDFPRAPPSFPPPAASRGGLGGTRSFRPHRGAESPRPGRDRDGVRVPMASSRCPAPRGCRCLPGASLAWLGTVLLLLADWVLLRTAL 100
BenignSAV:                                                          Q            S         R                       
gnomAD_SAV:    V#   V     SF     STA  ASS S KREVDR P   HRP  K STARQ Q #  L VTTF  SP C      R   S        P      P S 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111116111111111111000011110112012221211220100
STMI:                                                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:     HHHHH                                                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                             E                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH                                                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                
DO_IUPRED2A:                           DDDD DD  DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRIFSLLVPTALPLLRVWAVGLSRWAVLWLGACGVLRATVGSKSENAGAQGWLAALKPLAAALGLALPGLALFRELISWGAPGSADSTRLLHWGSHPTAF 200
BenignSAV:                                                                          V                    P         
gnomAD_SAV:    S         VV   Q #T    # S     #G    G     R      D  TVFT  VV VA  VQAVV LG    #EVAE     K P   G S  L
Conservation:  0002200010001211363134241135012101210111111111101011010101122224421233132203211101111000011021111112
STMI:                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH      HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH  HH HHHHHHHHHH          HH       HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH                    HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVSYAAALPAAALWHKLGSLWVPGGQGGSGNPVRRLLGCLGSETRRLSLFLVLVVLSSLGEMAIPFFTGRLTDWILQDGSADTFTRNLTLMSILTIASAV 300
BenignSAV:          V               M                                                                              
gnomAD_SAV:    A    VS          RR  M  S  V  I  H     V  QM# F  L   GG     KR V   MVH      R    Y  IQ   #    S# NE 
Conservation:  2221233234122601111111111111211130554031123001412422352244245333523292347333010001050025104232132332
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  H          HHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                        DDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:                            DDDDDD                                                                        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEFVGDGIYNNTMGHVHSHLQGEVFGAVLRQETEFFQQNQTGNIMSRVTEDTSTLSDSLSENLSLFLWYLVRGLCLLGIMLWGSVSLTMVTLITLPLLFL 400
BenignSAV:        L                                         F                                              V       
gnomAD_SAV:    R  L EEFC   V  #Q   P  G A   H  MK          VFQ    M I N T     N      L*  SF RF    * Y  #   V       
Conservation:  3342332341031222102440067125414541473121452624563175115313730247435533232232212731293185353241464223
STMI:          MMMMMMMM                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH          H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                            DDD                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPKKVGKWYQLLEVQVRESLAKSSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEAQKFREKLQEIKTLNQKEAVAYAVNSWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGAVS 500
BenignSAV:                                T V                                                C                     
gnomAD_SAV:     L   R R     M* Q     Y   TT V LTIL  *  V K  KD   S  M     FK  #  G    P   RT SV P         K  A  V T
Conservation:  3320131213131032322161321380644235256446337116112611261111162121312132113201221633342571172146113058
STMI:          MMMMMMMMM                                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGNLVTFVLYQMQFTQAVEVLLSIYPRVQKAVGSSEKIFEYLDRTPRCPPSGLLTPLHLEGLVQFQDVSFAYPNRPDVLVLQGLTFTLRPGEVTALVGPN 600
BenignSAV:                      L                                                           I                      
gnomAD_SAV:      K       HV     L                       M C  H   RD   L      F   N    C KLL IFM *E   S C  KLMV    S
Conservation:  1828647455401420252153113414323543526541554423010117021410116040512726262122201595344626058344555723
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EEEEEEEEE         EE EEEEE    EEEEE   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH                 E EEEEEEEEEE       HHH   EEEE    EEEEE   
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH                EEEEEE  EEE               EEE   EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                     D 
NP_BIND:                                                                                                        GPN

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHRQVAAVGQEPQVFGRSLQENIAYGLTQKPTMEEITAAAVKSGAHSFISGLPQGYDTEVDEAG 700
BenignSAV:                                                                                                     G   
gnomAD_SAV:      R  I        H SARE #V       RC  #      D  R K  I   RVR   S   SR   IG   T    P       ER  S  A IG TR
Conservation:  6496664516533641511825565312700321145513653524441553354229724710011202141156114171186015123517346324
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHH      EEEEE  EEHHH  HHHHHH EEEE          HHHHHH        HHHHHHHHHH   HHHHH              
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHH     EEEEE  EEHHH  HHHHHHHHEE     EEE  EHHHHHH        HHHHHHHHHH   HHHHH              
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHH      EEEE         HHHHHHHHHH     E     HHHHHHH       HHHHHHHHHHH  HHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                  DDDDD
NP_BIND:       GSGKS                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SQLSGGQRQAVALARALIRKPCVLILDDATSALDANSQLQVEQLLYESPERYSRSVLLITQHLSLVEQADHILFLEGGAIREGGTHQQLMEKKGCYWAMV 800
BenignSAV:            Q          Q                               Q                R                   K            
gnomAD_SAV:    C    # Q   VM #   W  R    G    VM T R    GR   #   W TC    V  # RP  *  D VL Q* TMQ R S  K       *    
Conservation:  1233144342532454343151454562243055122300511110000001122344553221233042243231140303221101331014031021
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHH HHH   EEEEEE  HHHHH   EEEEEE  EEEEEE HHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHH    EEE         HHHHHHHHHHHHH   H   EEEEEE     HHH  EEEEEE  EEEEEE HHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEHHHHHHHH  EEEEE   EEEEE  HHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                               D                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   

                       
AA:            QAPADAPE 808
gnomAD_SAV:    PP  V S 
Conservation:  00000010
SS_PSIPRED:    HHHH    
SS_SPIDER3:    HHHH    
SS_PSSPRED:    HH      
DO_DISOPRED3:       DDD
DO_SPOTD:          DDDD
DO_IUPRED2A:          D