Q05940  VMAT2_HUMAN

Gene name: SLC18A2   Description: Synaptic vesicular amine transporter

Length: 514    GTS: 1.674e-06   GTS percentile: 0.525     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 241      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MALSELALVRWLQESRRSRKLILFIVFLALLLDNMLLTVVVPIIPSYLYSIKHEKNATEIQTARPVHTASISDSFQSIFSYYDNSTMVTGNATRDLTLHQ 100
BenignSAV:                                                                        I                                
gnomAD_SAV:     V  KM#   #QR R CWQ  M    V #         A   VN G      R Q   K  M KL PIVFV #G  C  FC  T  VISR    Y I  H
Conservation:  2222022220230022131142512433343343233333363464564122210002000001101200000110112534331310100000002220
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                           
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  HH      HHHHHHH                                              HHH
SS_SPIDER3:      H H  HHHHH      HHHHHHHHHHHHH       E      HHHHH        H                   E                HHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHEE     HHHHHHH                                              HHH
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    
DO_SPOTD:      DDDDDD                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDD  DDDDDDDDDD 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                         N      N         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TATQHMVTNASAVPSDCPSEDKDLLNENVQVGLLFASKATVQLITNPFIGLLTNRIGYPIPIFAGFCIMFVSTIMFAFSSSYAFLLIARSLQGIGSSCSS 200
gnomAD_SAV:     #I  T  KV T A N  NK  H     A LC    L VII   PH YT I I I  CL TM V S V  I  TI SS  # G     SL    DL   F
Conservation:  0101111200000111611111191297336948868972488338824835686597449692883546384445565145144534445434554455
STMI:                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    H    HH           HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH          HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH  HHHHH
SS_PSSPRED:                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      D DDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:               D                                                                                       
DISULFID:                      C                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAGMGMLASVYTDDEERGNVMGIALGGLAMGVLVGPPFGSVLYEFVGKTAPFLVLAALVLLDGAIQLFVLQPSRVQPESQKGTPLTTLLKDPYILIAAGS 300
PathogenicSAV:                                     H                                                             R 
BenignSAV:                                  L                                                                      
gnomAD_SAV:    L    V  #          I  TT     TR  M THLR M#CK    MPL  L  TV V           TCQL SK #E  A  M    R VRV   T
Conservation:  3587676544624816682769466674657654877886548263542499649836454684585457385532743225454117447877646884
STMI:          MMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHH  HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHEHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE               HHHHH  HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE              HHHHHH HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                              DDD DDDDD               
DO_SPOTD:                                                                                DDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:                                                                                    D                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ICFANMGIAMLEPALPIWMMETMCSRKWQLGVAFLPASISYLIGTNIFGILAHKMGRWLCALLGMIIVGVSILCIPFAKNIYGLIAPNFGVGFAIGMVDS 400
PathogenicSAV:                A                                                                      L             
gnomAD_SAV:    VS      TKV  T    L K#   QRS#  I    T T         R         I P M LTM  I   Y    R     K L   I    A  AL
Conservation:  6655856464664488686446674336479456475546884775485165364977675649523472545467481463686483364645488785
STMI:          MMMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                             C                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SMMPIMGYLVDLRHVSVYGSVYAIADVAFCMGYAIGPSAGGAIAKAIGFPWLMTIIGIIDILFAPLCFFLRSPPAKEEKMAILMDHNCPIKTKMYTQNNI 500
gnomAD_SAV:     V   V     RQRMPI     TVV     V    VS    TV N VE  RV#   RTT   L       Q     V     #     L    IC   IT
Conservation:  8557456589976938686556985958794978555724634412696524642462455265955225445232355364332123332222422210
STMI:          MMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      
SS_PSIPRED:    H HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH         EEEE    
SS_SPIDER3:     HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH           EE    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH        EEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10    
AA:            QSYPIGEDEESESD 514
gnomAD_SAV:     PHLT *H    R 
Conservation:  11322131222531
SS_PSIPRED:                  
SS_SPIDER3:                  
SS_PSSPRED:                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DDDDDDDDDD
MODRES_P:                S S