Q06547  GABP1_HUMAN

Gene name: GABPB1   Description: GA-binding protein subunit beta-1

Length: 395    GTS: 5.201e-07   GTS percentile: 0.050     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 91      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSLVDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTTEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAASEGHASIVEVLLKHGADVNAK 100
gnomAD_SAV:           R         R    S               I       R S    A                      V          D            
Conservation:  9442334343524121815558313323644245347945464545557736764976477557777767768777666558620654685558967997
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH             HHHHHHHH  HHHHHHHHH              HHHHHHHH  HHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:         H HHHHHHHHH  HHHHHHHHH             HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:            HHHHHHHH   HHHHHHHHH            HHHHHHHH   HHHHHHHHH             HHHHHHHH  HHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                         DDDDD                         
MODRES_A:                                                                          K                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQIAMQNQINTNPESPDTVTIHAATPQFIIGPGGVVNLTGLVSSE 200
gnomAD_SAV:                 QS  Q  K    C  E  MRNR            RSA#      TS  K  SS    # I  V     E    RR M     R# A 
Conservation:  9885558866645315114333746254544328682834648737222153204572365273312331413121211144535242343364343221
SS_PSIPRED:          HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH                  HHHHH     EEEHHHHH   
SS_SPIDER3:          HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH              HHHE HHHH     EE HHHH    
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH             HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH              EEEE  EE     EEEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                          D                               
DO_IUPRED2A:          D                                                  D DDDDDDDDDDDDDDD DD                  D DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSSKATDETGVSAVQFGNSSTSVLATLAALAEASAPLSNSSETPVVATEEVVTAESVDGAIQQVVSSGGQQVITIVTDGIQLGNLHSIPTSGIGQPIIVT 300
gnomAD_SAV:        V G A I  A                    P V H     LM    I A  Y G TT     L A           P    P L A     RT   
Conservation:  2142121310034113344368596586674548342232122423127522222343333424432247665655543333326432423333444354
SS_PSIPRED:                  HHH     HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH    HHHHHHHH      EEE         HH          EEEE
SS_SPIDER3:               EHHHH      HHHHHHHHH             HHHHHHHHHH    HHHHHHHH     EEEE      H HHHHHHH      EEEE
SS_PSSPRED:                 EE       HHHHHHHHHHH              HHHHHHHH   HHHHHHHHH    EEE           EE         EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDD DDDDDDD                        DDDDDDDDDDDDDDD                                 D      DDDDD D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPDGQQVLTVPATDIAEETVISEEPPAKRQCIEIIENRVESAEIEEREALQKQLDEANREAQKYRQQLLKKEQEAEAYRQKLEAMTRLQTNKEAV 395
gnomAD_SAV:      H                 VG  L P  RR      Q       G      R         N             VC       S P       
Conservation:  52463445345333345533125143265242200020021021024217234626532274243258245928652352333432102121110
SS_PSIPRED:         EEEEEEHHHH EEEE       HHHEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:         EEEEEE     EEE           EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H     
SS_PSSPRED:         EEEEEE      EE             EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                      D                                                  DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                            DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      D   DDD D  DDDDDDDDDD  DD  DDD         D DDDDDDDDDDDDD     DDDDD            DDDDD    DDD DDD
MODRES_A:                                                         K                            K