Q07065  CKAP4_HUMAN

Gene name: CKAP4   Description: Cytoskeleton-associated protein 4

Length: 602    GTS: 8.014e-07   GTS percentile: 0.140     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 262      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPSAKQRGSKGGHGAASPSEKGAHPSGGADDVAKKPPPAPQQPPPPPAPHPQQHPQQHPQNQAHGKGGHRGGGGGGGKSSSSSSASAAAAAAAASSSASC 100
gnomAD_SAV:                                                    QQ     E    H         C           F  A        LF    
Conservation:  5122203121111100011111111111111111111111111111111111111111111111111111111100111111110121111021010111
SS_PSIPRED:                                                                                        HHHHHHHHHHH   HH
SS_SPIDER3:                                                                                         HHHHHHH       H
SS_PSSPRED:       HHH                                                                              HHHHHHHHHHH   HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
LIPID:                                                                                                            C
MODRES_P:        S             S S                                                                                 
MODRES_A:                          K                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRRLGRALNFLFYLALVAAAAFSGWCVHHVLEEVQQVRRSHQDFSRQREELGQGLQGVEQKVQSLQATFGTFESILRSSQHKQDLTEKAVKQGESEVSRI 200
gnomAD_SAV:       #    S   HV VLS  V     A  D   A       R L  R       W      A    GI    K     P        R   R GR   # 
Conservation:  1212110110212212111221231122131121131101111111111110001002112413320232255324322614441222333348164354
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD                                                                                     D  DD   D   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                                                 
DO_IUPRED2A:                                       DDDDDDDDDDDDDDDDD DD                             DDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEVLQKLQNEILKDLSDGIHVVKDARERDFTSLENTVEERLTELTKSINDNIAIFTEVQKRSQKEINDMKAKVASLEESEGNKQDLKALKEAVKEIQTSA 300
gnomAD_SAV:    N   RQV S      L        SQ Q  M    MMG # M   E  SN  #    A  S    M YV P F   Q       Y E    D E T    
Conservation:  4448556855673676365248745642853466265646639553762455236523823261553246245222322111426513421241334231
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                D  D       D                           DDDDDDDDDD  DD DD DDDD          
MODRES_P:                                     S                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSREWDMEALRSTLQTMESDIYTEVRELVSLKQEQQAFKEAADTERLALQALTEKLLRSEESVSRLPEEIRRLEEELRQLKSDSHGPKEDGGFRHSEAFE 400
BenignSAV:                                                    T                                                    
gnomAD_SAV:         NV V  RAV  # F T  K CK  N   D# V   V NM Q P R VM RFH C D IFCF#  VW     FHP  A  YE#   RSLKYL   Q
Conservation:  1023122235314403543543443374343346322452333143233326222331351121141221124222313221111015110131111222
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                           D  D D D                   
DO_SPOTD:                                                                 DDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:         DDDD                         D                               DD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                 S                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALQQKSQGLDSRLQHVEDGVLSMQVASARQTESLESLLSKSQEHEQRLAALQGRLEGLGSSEADQDGLASTVRSLGETQLVLYGDVEELKRSVGELPSTV 500
gnomAD_SAV:     F  #    #P   RMQ AL  V MT VHLS# MQ       K KRC ST  WC  S R     RYS TGA KRV VI*   CSNM #   R  K   IM
Conservation:  1222213234265302732112311212211222424214122242152131123112110303112412242352535244213432461141464421
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD   D  D   DD D DDDD DD  D  DDD DDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                
DO_IUPRED2A:   D  DD   DD  DD        DDDDD    DDDDDDDDDD       DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDD                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESLQKVQEQVHTLLSQDQAQAARLPPQDFLDRLSSLDNLKASVSQVEADLKMLRTAVDSLVAYSVKIETNENNLESAKGLLDDLRNDLDRLFVKVEKIHE 600
BenignSAV:                                                                                    V                    
gnomAD_SAV:       #     LRK  G G    TC   K   H  Y IHI  D      V  NTF A   G    L  M  KK S QL  DV G  K   NT V    #  #
Conservation:  1340124133121211111221101123254333142121321223334541322253353234333612313413430243332124313111021123
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                               DD D BB
DO_SPOTD:                  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                              DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D             DDD      D                                                    DDD                    

                 
AA:            KV 602
gnomAD_SAV:     I
Conservation:  12
SS_PSIPRED:    H 
SS_SPIDER3:      
SS_PSSPRED:    H 
DO_DISOPRED3:  BB
DO_SPOTD:      DD
DO_IUPRED2A: