Q08289  CACB2_HUMAN

Gene name: CACNB2   Description: Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2

Length: 660    GTS: 1.49e-06   GTS percentile: 0.444     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 398      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVQRDMSKSPPTAAAAVAQEIQMELLENVAPAGALGAAAQSYGKGARRKNRFKGSDGSTSSDTTSNSFVRQGSADSYTSRPSDSDVSLEEDREAVRREAE 100
gnomAD_SAV:    VF     *L T  TV  VH# # KV  KM    EP T T  DEE  KKR KL   G TA      DG  C AL V * C   Y         QT L  G#
Conservation:  1111111111111111111101111111111111111111111111000000000001011100011111134443123363454323242233232324
SS_PSIPRED:                HHHHHHHHH HHHHH         HHHH                           EEE            HH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 HHHHH H  HHHH                                         EEE                 HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHH                                        EE                    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RQAQAQLEKAKTKPVAFAVRTNVSYSAAHEDDVPVPGMAISFEAKDFLHVKEKFNNDWWIGRLVKEGCEIGFIPSPVKLENMRLQHEQRAKQGKFYSSKS 200
gnomAD_SAV:     R  T   RP   #I  V QK IG #GT#  NAAL DTTMLLK  H   I    S    M Q    SY  V T        V      I  L    F   
Conservation:  2232135343316455755445226233133347325255365465645455545456666548454235484656337522422353416344133331
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     EEEEE                 EEEEEE     EEEHHH    EEEEEEE      EE  HHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH      EEEEE                  EEEEE    EEEEEE    EEEEEEEE   E      HHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH     EEEEE                  EEEEE     HHHHH     EEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  DDDDD D                                                                               DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                               DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD DDD               DDDD    D                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGNSSSSLGDIVPSSRKSTPPSSAIDIDATGLDAEENDIPANHRSPKPSANSVTSPHSKEKRMPFFKKTEHTPPYDVVPSMRPVVLVGPSLKGYEVTDMM 300
gnomAD_SAV:    E    P    VL #  RT #LL  V T #S   E    TA   H       GI P R    I   LR    ALLCA         VL  C #VC      
Conservation:  2233123224224222422131111111111111111111111111111111111112202111113223334555555544646558767585845655
SS_PSIPRED:                                                             HHH             HHHH      EEEE      HHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                                                        EE        HHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                        EE           HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_IUPRED2A:   D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD                    
MODRES_P:         S  S          S                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QKALFDFLKHRFEGRISITRVTADISLAKRSVLNNPSKHAIIERSNTRSSLAEVQSEIERIFELARTLQLVVLDADTINHPAQLSKTSLAPIIVYVKISS 400
gnomAD_SAV:      V        L RWL  A#  T TLFV CLL   L   T T  F I TT VQ RN  G     T    S GF V      T  T  F #  TI LTM  
Conservation:  5656665454484574568645666568666575564842445555364435556474767979765679767977979792962869888644456535
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH   EEEEEEEE  HHHHHHHH         HH       HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHHHH      EEEEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHH       EEEEEEEE  HHHHHHH          E        HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE      HHHH       EEEEEE   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    EEEEEEE  HHHHHH          EE       HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE      HHHHH      EEEEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        DDD  DDDD                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKVLQRLIKSRGKSQAKHLNVQMVAADKLAQCPPELFDVILDENQLEDACEHLADYLEAYWKATHPPSSSLPNPLLSRTLATSSLPLSPTLASNSQGSQG 500
PathogenicSAV:                                     L                                                               
gnomAD_SAV:    L I H     Q    T YP IEL  T#  VH RQ  LNMT          *NF NH D  G VN AS    T R   H# PA   R   PV       #D
Conservation:  5568468555885444555566448375927833436774767777467769546765267656822111232222221222332312422121021111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHH   HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH     H HH EH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH HHHH        EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH                                     
DO_DISOPRED3:                    DD                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                  D   DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQRTDRSAPIRSASQAEEEPSVEPVKKSQHRSSSSAPHHNHRSGTSRGLSRQETFDSETQESRDSAYVEPKEDYSHDHVDHYASHRDHNHRDETHGSSDH 600
PathogenicSAV:                                   L                                                                 
BenignSAV:                      A                            H         L     Q                                     
gnomAD_SAV:    # TIHCYT VH     AA*T AQ#L T#  CC  LP D  N#  I CS F  #I  W  RK * FTCL A KAD    GGDCV*D#   N E S W    
Conservation:  1111111111111111111111100210111111111111111111122111221112112211111110011102121101111021112011111111
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                       S   T                                              

                       10        20        30        40        50        60
AA:            RHRESRHRSRDVDREQDHNECNKQRSRHKSKDRYCEKDGEVISKKRNEAGEWNRDVYIRQ 660
BenignSAV:          G                                                E   C 
gnomAD_SAV:     QS FQ H QNMA*#EE HKYH  PNH   E#H S  Y K TP NQ  V   H EI VH 
Conservation:  121212111121111121122111111111111111121211221311122312414111
SS_PSIPRED:                                  HHHH                          
SS_SPIDER3:        H                                                   E   
SS_PSSPRED:                                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    B
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD  DD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD