Q12908  NTCP2_HUMAN

Gene name: SLC10A2   Description: Ileal sodium/bile acid cotransporter

Length: 348    GTS: 4.268e-06   GTS percentile: 0.985     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 301      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLGHIKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVV 100
BenignSAV:                                                                    W                                 I  
gnomAD_SAV:    I #TSR#MH     C  #  #LD S D    M I M  AV  VFM#V  R*IMKL EL EYV QL*D  IS F   ETV F R  PLL S  FS RT#LG
Conservation:  9100003011321112122111033120152234332443543465766994442055305454977625945895859953553842262415255356
STMI:                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:                       E     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E  HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHEE
SS_PSSPRED:                     EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:               N                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIIGCCPGGTASNILAYWVDGDMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVSLVVPVSIGMFVNHKWPQKAKIILKIGSIA 200
BenignSAV:                                                               I           A                             
gnomAD_SAV:    FVTAR* R IV D  VS# NSNVEV LI II  IMPTFEIKL FPVN#  IR E  #VITRH  TVI# IFPIF I TER LHR**SPRP V#      V
Conservation:  5549789993299544673699888752653444333463453553344116111115146612553463344494327433525560154253438332
STMI:          MMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                 MMMMM
SS_PSIPRED:    HH        HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEE    HHHHHHHHHH   E HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH HHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH      HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                  D DD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GAILIVLIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYSLGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLAF 300
PathogenicSAV:                                           P                  M                                      
BenignSAV:                                                                                              S     L    
gnomAD_SAV:    VTMFM FT  A EMF  RT    # # T     A VVHY W PMSTVGDR  HM QM    # VR M  # NTI  A SA KFS GLI#L T G L#VTL
Conservation:  8225443334341362322613221453552447238322872462333656167787549892993356254456773122311442565283356331
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                       MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH   H H EEEEEE  H  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH H HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH EEEEEEE   HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:   DDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        
AA:            AAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK 348
gnomAD_SAV:    PTVC E NL C RRR   Q#  S  E D M    *   VK R   HK 
Conservation:  332243230243300110101001101000000100001212410130
STMI:          MMMMM                                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH         HHH         HHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH         H H        HHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                                  
DO_DISOPRED3:                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBB
DO_SPOTD:                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                        DDDDDD   D     D          D
MODRES_P:                                        S