Q13002  GRIK2_HUMAN

Gene name: GRIK2   Description: Glutamate receptor ionotropic, kainate 2

Length: 908    GTS: 1.528e-06   GTS percentile: 0.460     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 321      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKIIFPILSNPVFRRTVKLLLCLLWIGYSQGTTHVLRFGGIFEYVESGPMGAEELAFRFAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLS 100
gnomAD_SAV:       T R  TH  L C LQ   YS  T       R     S     DT  IED AR          G  A  R         RV I       RR    M 
Conservation:  4333333333033330000000000000000010000359889237346242594687764549965566465358788485442464545443375665
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                     
SS_PSIPRED:        HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHH H
SS_PSSPRED:        HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDD       DD DDD                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                                                     C    
CARBOHYD:                                                                        N     N                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGVAAIFGPSHSSSANAVQSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLYPDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDDSTGLIRLQELIKAPSRYNLRLK 200
gnomAD_SAV:    FV          L  ST   V DG   S # IC   #L EH      RH      F HT          E IM          H    V        Q  
Conservation:  6853455554446535554555554468545448684336239285465696535464667557345394338658564577686898535944345546
SS_PSIPRED:        EEE    HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE          EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE  HHHHHHHHHHH HHH   EEE
SS_SPIDER3:       EEEE    HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE           EEEEE   HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE    HHHHHHHHHHHHH    EEE
SS_PSSPRED:       EEEE    HHHHHHHHHHHHHH   EEEE            EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE    HHHHHHHHHHHH     EEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGILKQALAMGMMTEYYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSMER 300
gnomAD_SAV:     H  S  I    R    I  D   R     G KI  DVS     V  I  F Y T I   P  FV# A QH A  T    LS  K  P   V#   L  #
Conservation:  5566324316368988769645763577893413441543544358969877955887785456874375559786767755645532835534694374
SS_PSIPRED:    EEE        HHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH        EEEEE         HHH      EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE       HHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH       EEEEE  HHHHH   HHHH     EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEE    HHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH H   EEEEEE                    EEEE     HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                N                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRHKPWRFGTRFMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLE 400
gnomAD_SAV:     R SSI N # V    M N   T  TM MGPMTI # A VA       G      R H    VRQ R   F     V EISDW   I  H  G    SP 
Conservation:  4723352426533736553686366684344332634263566876968856875935752334433848579452454548553575665655583722
SS_PSIPRED:    H                HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH                 HHHHHHHHHH      EEEEE          EEEEEEEE   EE
SS_SPIDER3:    H               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH      EEEEEEE     EEEEEEEEEEEE    E
SS_PSSPRED:    H                HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H                HHHHHHHHHHHH      EEEEE          EEEEEE      E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                    C                                                     
CARBOHYD:                                                                                   N                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIGTWDPASGLNMTESQKGKPANITDSLSNRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDANGQWNG 500
gnomAD_SAV:     T M  L    D    RER  V M#   T           K   I        H S Q            PI  D ICKV         VRN  # R*  
Conservation:  6563743117865651031321676587496582647568586753566653928537886665887487715999185538529757833562355889
SS_PSIPRED:    EEEEEE                         EEEEEEE     EEE               HHHHHHHHHHHHH   EEEEE                 H
SS_SPIDER3:     EEEE     EE                   EEEEEEE    EEEEE             HHHHHHHHHHHHHH    EEEE     EE  E     E H
SS_PSSPRED:    EEEEE                          EEEEEEE     EEE               HHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE                H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            DD DDDDD DDDDD                                                                             
CARBOHYD:                 N          N      N                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYILLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYNPHPCNPDSD 600
gnomAD_SAV:    I C    L         S S A GT  N              C #S S S I        AGT                       F  *   S  T   
Conservation:  6659856845886668777553654466868875447569855654444355777746666779467997767777679467655657645444956354
STMI:                                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    EEE         HHH       EE  EEEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH  HHE   EEE   EHHHE      EE EEEEEEE         H       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H   HHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  EEE   HHH        HHH EEEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:                                                                                                   DD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                             R                                                                             
REGION:                       PLA                                                                                  
CARBOHYD:                                                   N                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKIS 700
PathogenicSAV:                                                         T  K                                        
gnomAD_SAV:        Y    S          H     # TV     A         TF   *  K        H      Y   V   #E          NT      E  
Conservation:  4446666856757765666544654666595666657669979999777988776565865455564446597576987858945257686499655554
STMI:                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                            
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH        HHHHHH    EEEEE   HHHHHHH    H
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH     EEEEE   HHHHHHH    H
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH       E     HHHHHHH   H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                                                AT          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR 800
BenignSAV:                                                                      I                                  
gnomAD_SAV:    M       T#N       R#      Q                  A W     KT S   A A  I  TL  A Q    V          #  #      
Conservation:  5656674654553263344222375365534575454766355644344535644733344444433663655555465886845585635924575895
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH    EEEEHHHHHHHH      EEE                 HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHH   EEEEEEEEHHHHHH      EEE         E       HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH  EEEEEEE  HHHHHH    EEEE                  HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                            E                                                              
CARBOHYD:                                                        N                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GNGCPEEESKEASALGVQNIGGIFIVLAAGLVLSVFVAVGEFLYKSKKNAQLEKRSFCSAMVEELRMSLKCQRRLKHKPQAPVIVKTEEVINMHTFNDRR 900
BenignSAV:                                                                       I                                 
gnomAD_SAV:    D      DN   T  A             S     S       *QY#RTT    S LFC V    TIFPRW CWF   SR   T   GQ   L #CKN  
Conservation:  6358547334765777745498685576489557546635654655463432344321121312111121100111111022112111212111211122
STMI:                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                            
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH                    HH         
SS_SPIDER3:            HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH      HHHHHHHHHHHH                                
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH                              
DO_DISOPRED3:        DDDDDDDDDD                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:           DDDDDDDD                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                  D    
MODRES_P:                                                   S                     S                                

                       
AA:            LPGKETMA 908
gnomAD_SAV:          T#
Conservation:  12211013
SS_PSIPRED:            
SS_SPIDER3:            
SS_PSSPRED:            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDD DD