Q13003  GRIK3_HUMAN

Gene name: GRIK3   Description: Glutamate receptor ionotropic, kainate 3

Length: 919    GTS: 1.764e-06   GTS percentile: 0.565     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 387      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTAPWRRLRSLVWEYWAGLLVCAFWIPDSRGMPHVIRIGGIFEYADGPNAQVMNAEEHAFRFSANIINRNRTLLPNTTLTYDIQRIHFHDSFEATKKACD 100
BenignSAV:                                E                                                                        
gnomAD_SAV:     IP GG        H        L   E   R     F V    V S ST L   K Q  Q    # D                      N KV #    
Conservation:  0333333333333333330300000000000010000339889237363333242594677764549965566465358677485442464445443375
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                     
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEE      HH  HHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEE     HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH     EEEEEEEE E     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEE    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEEE    HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                                                        C 
CARBOHYD:                                                                           N     N                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLALGVVAIFGPSQGSCTNAVQSICNALEVPHIQLRWKHHPLDNKDTFYVNLYPDYASLSHAILDLVQYLKWRSATVVYDDSTGLIRLQELIMAPSRYNI 200
gnomAD_SAV:      S  M    S  RCF   VI              H  D L    N        N VL  R#V#N  R    W  IMLCEN A   Q R   #     ST
Conservation:  6656853455554446535554555554468545448684336239285465696535464667547345394338658564577686898535944345
SS_PSIPRED:    HHH    EEE    HHHHHHHHHHHHH    EEEEE           EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE    HHHHHHHHH HHHH  
SS_SPIDER3:    HHH  EEEEE    HHHHHHHHHHHHH    EEEE            EEEEE   HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHH   EEEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEE            EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE   HHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLKIRQLPIDSDDSRPLLKEMKRGREFRIIFDCSHTMAAQILKQAMAMGMMTEYYHFIFTTLDLYALDLEPYRYSGVNLTGFRILNVDNPHVSAIVEKWS 300
gnomAD_SAV:    H    HV VN  NLCSF   T QSQAYC     G ATV  TVM    V       QV Y   G HT EMD  H   M        Y   A I  T     
Conservation:  5465566324316368988769645763577893403441543544358969877955887785456864375559786767755645532835534694
SS_PSIPRED:    EEEEEE        HHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH       EEEEE          HHH      EEEEEEE    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEE        HHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH       EEEEEE                EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEEE       HHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH      EEEEE                  EEEEEEEE    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                   N                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MERLQAAPRSESGLLDGVMMTDAALLYDAVHIVSVCYQRAPQMTVNSLQCHRHKAWRFGGRFMNFIKEAQWEGLTGRIVFNKTSGLRTDFDLDIISLKED 400
BenignSAV:              A                                                                                          
gnomAD_SAV:    VDQ    AWAA D RN   TN V  V   I    M   W    N          V H  DC I     S         A D I   WME    VVR  # 
Conservation:  3744723352426533737553686366684344332634263566876968856875935752334433848579452454548553575665655583
SS_PSIPRED:    HHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHH     EEEEE          EEEEEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHH      EEEEEEE     EEEEEEEEEEEE  
SS_PSSPRED:    HHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE          EEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                       C                                                  
CARBOHYD:                                                                                      N                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLEKVGVWSPADGLNITEVAKGRGPNVTDSLTNRSLIVTTVLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQW 500
gnomAD_SAV:        A L    #R  N  A E Q A GSN  R     I     K  I  Q   SM #E  G K    N   # T      CD QV   S   #  Y D  
Conservation:  7226562743117865651031321676586496582647568586653566653928537886665887486715999185538529757833562558
SS_PSIPRED:      EEEEEEE    EEE                  EEEEEE     EEEEE              HHHHHHHHHHHHH   EEEEE               
SS_SPIDER3:      EEEEEE     EEEE          EE    EEEEEEEE    EEEE              HHHHHHHHHHHHHH  E EEEE     E  E     E
SS_PSSPRED:      EEEEEE      EEE                 EEEEEEE    EEEEE              HHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE              
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                    N          N      N                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKPNGTNPSVFSFLNPLSPDIWMYVLLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYDAHPCNPG 600
gnomAD_SAV:     SI  # VN R    M  M    I   TVN      I  M V  Q  SDIK NI            I IF T   F Y   ITTS     C N QT    
Conservation:  8966598568458866687775536544668688654475698556544443557777466667794679977677776794675556576454449563
STMI:                                                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHH   HH          HHH        EEEEEEEE                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH         
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE  EEE     EE EEEEEE          HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H   HH          
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH   E    HHHHHH     HHH EEEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                          T    R                                                                           
CARBOHYD:                                                     N  N                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEVVENNFTLLNSFWFGMGSLMQQGSELMPKALSTRIIGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSK 700
gnomAD_SAV:     KMA  Y   H      TRC               C            V    M K     IL CID S #           #  SI   T L SL   R
Conservation:  5444466668567577656665436546665956666576699799997779887765658654555644465975769878589452576864996555
STMI:                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                           
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH        HHHHHH    EEEEE   HHHHHHH   
SS_SPIDER3:       E      H HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH     EEEEE   HHHHHHHH  
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH       EE    HHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                                                 GAT        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRALTADYALLMESTTIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWW 800
gnomAD_SAV:        K         #       #   R   # NF P       D IM  K    H R#   T D S  R K         VT    H   R YVL QE  
Conservation:  5456566746545532334422237536553457545476535564434453564473334444443366365555546588684558563592457589
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH   EEEEEHHHHHHHH      EEE                 HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHH   H    HHHHHHHHH    EEEEEEHHHHHHH     EEEE         E        HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH  EEEEEEHHHHHHHHH    EEE                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                             E                                                             
CARBOHYD:                                                         N                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RGSGCPEEENKEASALGIQKIGGIFIVLAAGLVLSVLVAVGEFVYKLRKTAEREQRSFCSTVADEIRFSLTCQRRVKHKPQPPMMVKTDAVINMHTFNDR 900
gnomAD_SAV:    Q  R   K K   TG   R      V   #  GV     M    C  C# T  K C  #R MT  FHSF IRHCQ  R    TV # I TI  IY  S #
Conservation:  5635854733466577774549868557648955744663565465546343234432113331211012110011111102111211121211121102
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                           
SS_PSIPRED:                 HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH                    HH        
SS_SPIDER3:            H H HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH      HHHHHHHHHHHHH                     H        
SS_PSSPRED:                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHHHHHHHHHHHHH                   EE        
DO_DISOPRED3:     DDDDDDDDDDDDD                                                          DDDDBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                 D D D                 
MODRES_P:                                                                          S                               

                       10        2
AA:            RLPGKDSMACSTSLAPVFP 919
gnomAD_SAV:    #PAS G I Y IPVDR  S
Conservation:  2122110103333333333
SS_PSIPRED:                       
SS_SPIDER3:                       
SS_PSSPRED:                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: