Q13077  TRAF1_HUMAN

Gene name: TRAF1   Description: TNF receptor-associated factor 1

Length: 416    GTS: 1.779e-06   GTS percentile: 0.570     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 210      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASSSGSSPRPAPDENEFPFGCPPTVCQDPKEPRALCCAGCLSENPRNGEDQICPKCRGEDLQSISPGSRLRTQEKAHPEVAEAGIGCPFAGVGCSFKGS 100
gnomAD_SAV:             PL   DH  L A S  IY  SE   T        QK#  AK  N  RST#K  H     NHPQ  K SYSKAS VE   S    SR   AG
Conservation:  5101100210212111103272312331102203224700520022121220261231043111022204131110314632231408160149800211
SS_PSIPRED:                                                  HH                    HHHHHHHHH HHHHH              EE 
SS_SPIDER3:                                   EEEEE  HHH    HH                        HHHHH   HH    E              
SS_PSSPRED:                                         HHHH                            HHHHHHHH HHHHHH           EEEE 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                         DDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD      DD                            DD          DDDDDDDDDDDDD D                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PQSVQEHEVTSQTSHLNLLLGFMKQWKARLGCGLESGPMALEQNLSDLQLQAAVEVAGDLEVDCYRAPCSESQEELALQHFMKEKLLAELEGKLRVFENI 200
BenignSAV:                                           T                                                             
gnomAD_SAV:       A   KIN  N  I M  EL# H  TP     K  ST     V*  K L  M  E HP  N# W#  PK   K  V#     E     D R H    T
Conservation:  1212039500120165155410310110011010011111101021121100110000012242201110001100120110111111153072044757
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHH HHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                    DDD DDDD                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DDDDDD                                                                                           
SITE:                                                                        DC                                    
MODRES_P:                                                   S                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAVLNKEVEASHLALATSIHQSQLDRERILSLEQRVVELQQTLAQKDQALGKLEQSLRLMEEASFDGTFLWKITNVTRRCHESACGRTVSLFSPAFYTAK 300
gnomAD_SAV:      A   VMD  Y    A V H    H C        M P #  VR     C PD  WH  V   LN  C     SIN Q   LV  K II   L     E
Conservation:  5455545451211112400362133531411821560353313216621422231041133135578583966245337226723731153374465536
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHH     EEE        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE     HHHHHHHHH    EEEE        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE  HHHHHHHHH    EEEEE       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YGYKLCLRLYLNGDGTGKRTHLSLFIVIMRGEYDALLPWPFRNKVTFMLLDQNNREHAIDAFRPDLSSASFQRPQSETNVASGCPLFFPLSKLQSPKHAY 400
gnomAD_SAV:        #  W *    D   GS   P  MV KR   V  L*# W    SV  N H HKQTS S QT    V  R   G  S#     F   # R K    T 
Conservation:  6823354633526763533353455533448024347165623256735555334453233458942414544813534242424363332331125327
SS_PSIPRED:       EEEEEEEE         EEEEEEEEE    HH        EEEEEEE       EEEEEE    HHHH               EEEHHH        
SS_SPIDER3:     EEEEEEEEEE        EEEEEEEEEEE             EEEEEEEE      EEEEE      H                 E EHHH       E
SS_PSSPRED:       EEEEEEEE        EEEEEEEEEE              EEEEEEE      HHHEE                            HHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10      
AA:            VKDDTMFLKCIVETST 416
gnomAD_SAV:    M EN I    TA    
Conservation:  3446347656455231
SS_PSIPRED:    EE  EEEEEEEEE   
SS_SPIDER3:    EE  EEEEEEEE    
SS_PSSPRED:        EEEEEEEEEE  
DO_DISOPRED3:                  
DO_SPOTD:                     D
DO_IUPRED2A: