Q13099  IFT88_HUMAN

Gene name: IFT88   Description: Intraflagellar transport protein 88 homolog

Length: 833    GTS: 1.62e-06   GTS percentile: 0.501     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 405      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKFTNTKVQMMQNVHLAPETDEDDLYSGYNDYNPIYDIEELENDAAFQQAVRTSHGRRPPITAKISSTAVTRPIATGYGSKTSLASSIGRPMTGAIQDGV 100
gnomAD_SAV:    I    A   V   MQ  S  A      S     R C TKQ    T L   M   Y   T  A     K  A  #       I  G  #V R#A  L V L
Conservation:  3333333337422333234146787969696665464145656824864846754464332554343733383325424252151532796286234462
SS_PSIPRED:         HHHHH   EE                      HHHHH  HHHHHHHH                                                
SS_SPIDER3:          HHEHHH E                       HHHHH  HHHHHHHHH                                               
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHEE                      HHHHH  HHHHHHHHH                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             DDDDDDDD  D  D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DD   DDD D  DDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRPMTAVRAAGFTKAALRGSAFDPLSQSRGPASPLEAKKKDSPEEKIKQLEKEVNELVEESCIANSCGDLKLALEKAKDAGRKERVLVRQREQVTTPENI 200
gnomAD_SAV:    #  V       V R      T   R RLS  T SF V E V   K V*   RD  D L #    S   A            S          HI #  DT
Conservation:  4996667298975531166527847784676566790621532775464797265496568739331643544836575936386184675642012323
SS_PSIPRED:        HHHHH   HHH                  HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:        HHHH   H H                   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:        HHH                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDD   D      D         DDDDDD D                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD  D                  DD  D  DD                    
DO_IUPRED2A:   D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                DDDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLDLTYSVLFNLASQYSVNEMYAEALNTYQVIVKNKMFSNAGILKMNMGNIYLKQRNYSKAIKFYRMALDQVPSVNKQMRIKIMQNIGVTFIQAGQYSDA 300
BenignSAV:                  G                                                                                      
gnomAD_SAV:          A VSS TGR AI  I VKT    #I# QH T  ST V    V  TC            C*  S *  T K  I  E     R      S  LG 
Conservation:  6488565544569389426675399643553555454624372566697996456367257676977979574423444657935697349513969186
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            INSYEHIMSMAPNLKAGYNLTICYFAIGDREKMKKAFQKLITVPLEIDEDKYISPSDDPHTNLVTEAIKNDHLRQMERERKAMAEKYIMTSAKLIAPVIE 400
BenignSAV:                                                                                       I                 
gnomAD_SAV:    VSL D VTTVSLS  SAC#  V  # VE Q     T   WV#LA # N #   L#N   YAD     K  NQ  RTAH    I#   F I    #T    
Conservation:  5266535931286355679946746926616299358549516562345578542478114565365568916355524361157457457797979766
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH       HHH          HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH        H H         HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH      HHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                      D           DD D D     D                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSFAAGYDWCVEVVKASQYVELANDLEINKAVTYLRQKDYNQAVEILKVLEKKDSRVKSAAATNLSALYYMGKDFAQASSYADIAVNSDRYNPAALTNKG 500
BenignSAV:                                                           N                                             
gnomAD_SAV:    I   #  E  M  M GF   * GS       IK         V# LI   A  HN M RV  AS  V  C          C V# L  N        ST 
Conservation:  2676265675773692736445749964276354455446135246783668586537647556953536634621492087739424868794673699
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NTVFANGDYEKAAEFYKEALRNDSSCTEALYNIGLTYEKLNRLDEALDCFLKLHAILRNSAEVLYQIANIYELMENPSQAIEWLMQVVSVIPTDPQVLSK 600
BenignSAV:                                                V                                                        
gnomAD_SAV:      F   S H   T  CE PV     R     S DVAC E YWPE V N    PLTT QH  K   HMTDT   K    # M     # I T PN  LF E
Conservation:  8334421735764977797957966698595859533445333134663658545574552465397613532535306634662455432645214535
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGELYDREGDKSQAFQYYYESYRYFPCNIEVIEWLGAYYIDTQFWEKAIQYFERASLIQPTQVKWQLMVASCFRRSGNYQKALDTYKDTHRKFPENVECL 700
BenignSAV:                                                                           GS                            
gnomAD_SAV:        #GH E    S    C LC *LS  VK T**  SC    #  DT VE L   F #RL    CH   PGS G    * R  N     #  S       
Conservation:  5518430385546653352586844863426549965643334447565256465166481263846438575656796655824560681379553499
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RFLVRLCTDLGLKDAQEYARKLKRLEKMKEIREQRIKSGRDGSGGSRGKREGSASGDSGQNYSASSKGERLSARLRALPGTNEPYESSSNKEIDASYVDP 800
gnomAD_SAV:    C   HF AHV      #H        QL  R  *HL  S   N   #   QE VID  S SCN GT A *VG     FR I   C  GNDR    C#   
Conservation:  3595665455473726672269664762363476425534444412433564322234412112124443534233242321456634113344425256
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH                             HHHHHHHHHH         HHH            
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH   H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHH                     E   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30   
AA:            LGPQIERPKTAAKKRIDEDDFADEELGDDLLPE 833
gnomAD_SAV:      R LGQT  S   K#AKE       #VN   Q
Conservation:  563102374444432033326444556535665
SS_PSIPRED:                           HH        
SS_SPIDER3:                          HH H       
SS_PSSPRED:                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD