Q13136  LIPA1_HUMAN

Gene name: PPFIA1   Description: Liprin-alpha-1

Length: 1202    GTS: 1.537e-06   GTS percentile: 0.464     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 622      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMCEVMPTISEAEGPPGGGGGHGSGSPSQPDADSHFEQLMVSMLEERDRLLDTLRETQETLALTQGKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVC 100
BenignSAV:                                                                           I                             
gnomAD_SAV:      SK      K  #SA R  DR  S A H NT   S   #  V A   #P N#      M     R  QQI Y   C      M#  R  TTV# D SI 
Conservation:  2333334354522222421301221232112123213222234323435444355224434222323333213564154443222331556464447624
SS_PSIPRED:           EEE                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            E                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        EE                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              D          D D                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            REQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRVALERCSLLEEELGATH 200
gnomAD_SAV:        F  G  F         I    G   W      W     LAE  T CS  MA   G  R      G           Q Q T A RN   K   V  
Conservation:  7757677979646745565546666677767666665665557456432544574656666557567646556444535236424635221554341030
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:        DDD   DDDDD                        D          DDDDDDDD  DD DD  D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             DD    D                        DDDDDD DD                                                  
MODRES_P:                                                       S                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSSDGSLSHEEDLAKVIELQEIISKQSREQSQMKERLASLSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEEM 300
gnomAD_SAV:           Q    ERI  E AP#  RG   #TGM   S    FSRYKK     T    LV   PG       #  F P YM  P     M GRYP RF  #
Conservation:  2421124441112400032014001103011111318472131111230121045531455520731424642215222336571362246524233451
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH                         E       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD DD         D      D     DDDDDDDDDD  DDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDD DDD D  DDD DD DD DDD DDD  DDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                   T        S  S S                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NTKLQRDVREAMAQKEDMEERITTLEKRYLAAQREATSVHDLNDKLENEIANKDSMHRQTEDKNRQLQERLELAEQKLQQTLRKAETLPEVEAELAQRVA 400
gnomAD_SAV:    D#E  QV C  T   G T         C  D  C V      #V  #    S G V Q   G DC  R H     R      G  DA L GVV   R   
Conservation:  3151465337224644645485455534562473533343414758445442433222627652634333532544363543433434533474443532
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D  D  D  DD              DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD     D                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALSKAEERHGNIEERLRQMEAQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEDKNSLLREVESAKKQLEETQHDKDQL 500
gnomAD_SAV:       #V    S      # T V  K       Q      L   R  #           C    R#  IK  V   H  CIV  A #   R        NH 
Conservation:  5545554464445443264613446538571644333334323326323553334233255537563563333224226336332154145403326244
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDD  DDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                     S                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLNIEALRAELDHMRLRGASLHHGRPHLGSVPDFRFPMADGHTDSYSTSAVLRRPQKGRLAALRDEPSKVQTLNEQDWERAQQASVLANVAQAFESDADV 600
gnomAD_SAV:    I I#DVVK   ELV  G S VRDSQL  V  A    L# E# R   N R#  #H  RRQ  TVQ KT     #K     C    IA VSG R SKG   M
Conservation:  2124434416242150330222231211232153243121221423222112112125313212332122111012232011112122123213223241
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH                              HHHH       HHHHH  HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH                                           HHHH  H       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH                                         HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:     D DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD        DDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD      D     DDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SDGEDDRDTLLSSVDLLSPSGQADAHTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKENTEQRAEEIESRVGSGSLDNLGRFRSMSSIPPYPASSLASSSPPGSGRS 700
gnomAD_SAV:     NS     P#V  I QQL  E  NT    T    R ET IEQ  F       R  WT    RQ # R  GS  CCS V F SHN#P PIDG F#L   CC
Conservation:  2413432312112121267343553236424234453344333533233544524645343154232323133302021333211322323145404613
SS_PSIPRED:                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH                                     
SS_SPIDER3:                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                      
SS_PSSPRED:                             HHHHHHHHHHHHHHHH H          HHHHHHHHH                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                       S S                        S       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPRRIPHSPAREVDRLGVMTLLPPSREEVRDDKTTIKCETSPPSSPRALRLDRLHKGALHTVSHEDIRDIRNSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHKAPKK 800
BenignSAV:                                                              V                                          
gnomAD_SAV:     SQ F  GAVWQ  #P II    S      EN        FSAF   VV#  WP  RVP  I  KA  #M   I   # SMN  G G G R#L Y  S R
Conservation:  3311012320221222342422201243031433231342244334212342211122223112341220122221230112124411332534443124
SS_PSIPRED:                             HHHH                                    HH                                 
SS_SPIDER3:                      EE       H                         H                                              
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                  T S                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGIKSSIGRLFGKKEKGRPGQTGKEALGQAGVSETDNSSQDALGLSKLGGQAEKNRKLQKKHELLEEARRQGLPFAQWDGPTVVVWLELWVGMPAWYVAA 900
gnomAD_SAV:                     Q   PVR T   D  PKMG    H      WEE T  SHE           G  D   T  N  M #I   VR    #  A  
Conservation:  4645454534544344261210212100121113050110422232343332643551433446443534452665257564533353564668566698
SS_PSIPRED:          HHHH                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_SPIDER3:             H                                           HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   HHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:          HHH                                            HHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEEHHH    HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D   DD                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEIMSLTSPSAPPTSRTTLAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKK 1000
gnomAD_SAV:     Q       VLL   N  L #A   TI Q K       RD T # G# #L   GMIPTCWY   K  S D  L    #E   C   Y   SGT NN  ##
Conservation:  5546535465352435324244463435554434243543223432434422343466568455556774694454423423265467766656435656
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHH   HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHH         HHHHHHHHHH HHHHH   HH
SS_SPIDER3:    HHHH           HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHH        HHHHHHHH   HHHH H  HH
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHH   HHHHHHHH        HHHHHHHHHHH                      HHHHH          HHHHHHHHH HHHHHHH  HH
DO_DISOPRED3:                                             DDDDDDDDDDDDD                                            
DO_SPOTD:                                                   DDDDDDDDD                                              
DO_IUPRED2A:                                                       DDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLRGQLKMVDSFHRNSFQCGIMCLRRLNYDRKELERKREESQSEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLIESGVHGALLALDETFDFSALALLLQIP 1100
BenignSAV:                                                                            F                            
gnomAD_SAV:    GF#      NN RGD  HR  #Y  W SC WN P G K      R NL L G  GM H V  T    F DS #K      F     ILN  VV       
Conservation:  5562455465455526666755396555875666634650330213224355975641832157846432460654546454464434422234825542
SS_PSIPRED:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       HHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH               HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH      EEEE  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    EEEEEE     HHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH        EEE  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH   HHHEEE     HHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        D                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TQNTQARAVLEREFNNLLVMGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDIRGLAAGSAETLPANFRVTSSMSSPSMQPKKMQMDGNVSGTQRLDSATVRTY 1200
gnomAD_SAV:    M     CT  # *    WAVR#GT#          K  L  RM G  N H    E      EDCW       RYV   # #I  H   I S    A#   
Conservation:  1222235324223211342153241123121113233444442242331131013312124121211222211111120000122221000000022222
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHH                                                      EEE 
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHH        HH                                   EE                              EEEE
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHH                                                                              EE  
DO_DISOPRED3:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:                               D       DD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
MODRES_P:                                      S                         T                                         

                 
AA:            SC 1202
Conservation:  02
SS_PSIPRED:      
SS_SPIDER3:    EE
SS_PSSPRED:      
DO_DISOPRED3:   D
DO_SPOTD:        
DO_IUPRED2A: