Q13286  CLN3_HUMAN

Gene name: CLN3   Description: Battenin

Length: 438    GTS: 2.468e-06   GTS percentile: 0.798     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 19      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 260      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGGCAGSRRRFSDSEGEETVPEPRLPLLDHQGAHWKNAVGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILSHKRTSGNQSHVDPGPTPIPHNSSSRFDCNSVSTAAV 100
PathogenicSAV: #                                                                                                   
gnomAD_SAV:    V D T     SLN   K I L SQI   N R  #*  TA  *  C   S F M #V  T NV  RR  PE # #   D SL LN   #QLGWH # MV  
Conservation:  5000122300011132311141211211010011355014554987798658676875848692231231416043110020112326156843366668
STMI:                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                          
SS_PSIPRED:                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                HHHH
SS_SPIDER3:                                     HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH                             HHHHH
SS_PSSPRED:                                     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH                             HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                      DDDDDDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                         DDDDDDDDDDDDD                   
MODRES_P:                 S S                                                                                      
CARBOHYD:                                                                            N             N               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLADILPTLVIKLLAPLGLHLLPYSPRVLVSGICAAGSFVLVAFSHSVGTSLCGVVFASISSGLGEVTFLSLTAFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYL 200
PathogenicSAV: P                       N        R                       P      E    P                A R           
BenignSAV:         V                                                                                               
gnomAD_SAV:      T V SI I R#    DFNV  CN Q  #N VG#  TSI   IPRC  I  YAGF PT    V   AV FV  L  S M     L  R    P VV *V
Conservation:  9896668572693268433624985277224422423874487351231274196664836595995798465337141463376988766953975464
STMI:                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH  H  HHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHE   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH    EEEEEE     HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                      DDDDDD                                                                      
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLTQAGLSPQQTLLSMLGIPALLLASYFLLLTSPEAQDPGGEEEAESAARQPLIRTEAPESKPGSSSSLSLRERWTVFKGLLWYIVPLVVVYFAEYFINQ 300
PathogenicSAV:                                                                                               K     
gnomAD_SAV:    # I  SF L *NPPYKM  STP    C FF I   V   R Q    NT WPSVMK KVL L   F  RF  Q T* L#R   CH# SVIILC #KN TK 
Conservation:  5754555584148327434922622584166114221273410111111333732001120010100044204610524582244249345665768888
STMI:          MMM                                                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHH                     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:                                          DDDDDDDDDDDDDDD D                                            
MOTIF:                                                  EEE        LI                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLFELLFFWNTSLSHAQQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRFTWALALLQCLNLVFLLADVWFGFLPSIYLVFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALET 400
PathogenicSAV:                              F   #Y                H                                                
BenignSAV:                                             H                                                           
gnomAD_SAV:         F    A PN TR CC   V     ILVCCCF HWYCNH P V    *         EM  R      FI P #    F   TT M    KVTV*I
Conservation:  6846856631216363486476954993994486686172254144366165136335822350406564324462453698669844869684265272
STMI:                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                 
SS_PSIPRED:    HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:     HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H H H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  
SS_PSSPRED:    HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:               N                                                                                          

                       10        20        30        
AA:            SDEHREFAMAATCISDTLGISLSGLLALPLHDFLCQLS 438
PathogenicSAV:     W          G                      
BenignSAV:        R                                  
gnomAD_SAV:    R  NGVI VV   VAG V MF L#  V   #   W   
Conservation:  11233554423323333265235522333362379233
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                        
DO_SPOTD:                                            
DO_IUPRED2A:                                         
PROPEP:                                           QLS
MOTIF:                 MAATCISDTLG                   
LIPID:                                           C