Q13421  MSLN_HUMAN

Gene name: MSLN   Description: Mesothelin

Length: 630    GTS: 1.977e-06   GTS percentile: 0.645     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 495      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MALPTARPLLGSCGTPALGSLLFLLFSLGWVQPSRTLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQ 100
BenignSAV:                                                                            V                            
gnomAD_SAV:    T# SM QT S  S S PVCI  L     R     M  V   R*  T    I    LDN T# LCR    L#V A SP KKC QD V V    I RP#IKK
Conservation:  1401200000000000000000000012102011001221210000000000000000002411351452601321420124115422200217293221
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                
SS_PSIPRED:                   HHHHHHHHHHHH     HHH         HHHHHHHHH    HHH  HHHH    HHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHH
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHHHHH      H        HHHHHHHHHH     HHH  HHHH     HHHHH  HHHHHHHHHHHHH      HHH
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH          HHHH    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDD                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDD            D        DDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:                                           DD  DDDDDD                                                  
CARBOHYD:                                                              N                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAES 200
gnomAD_SAV:     H   YW  KT#K  EVVA N       GT L S T  H Y H M    #  LSETSK**Q   V     SMG P   KVG W MA  V NP EC   KL
Conservation:  0000000000000000001100036113000011117216211352521422102210210420132150010000000003013314250322014114
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    HHHHHH  HHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHH  HHH     HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    HH HH   HHHHHH   H    HHHHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH      HHH  HHHHHHH HH      HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                                                                         S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKT 300
BenignSAV:                                                             H                                           
gnomAD_SAV:     DG  SQ  N L R  * E  TT VV  VR AR  LSP    PMT TPLVV #M  HSVFHG LRD M T W C  WG F Q A#QP  PLL WWKG T 
Conservation:  1203420610401032014113220250211413412119310361172032124311042022112200011000001100001111102100011000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHH HHHH  HHHHHH  HHHHHHHHHH          HHHH            
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHH HHHH  HHHHH   HHHHHHHHHH                          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH  HHHHHH  HHHHHHHHHHH        HHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                     DDDDDDDDDDDD  D  
DO_SPOTD:                                                                                                DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  D  DDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD                                        DDD  D             D
REGION:                                                                     SIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPER              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLE 400
BenignSAV:             #                   V                                                                       
gnomAD_SAV:      L    PHKTEK FT#H   QP T*MEVV  P #L CMKT SY  K   I T  #G   # V  K G *  AHFV R #L  FCTC MM      PSP 
Conservation:  0510200002321040331003510152102312241040103220212034402612232024531261062142102201451230321124611551
SS_PSIPRED:                       HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHH        HHHHHH   HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHH      HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  HHHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DD                                                                                               
DISULFID:       C                       C                                                                          
CARBOHYD:                                                                                             N            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNKGHEMSPQAPRRPLPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEY 500
BenignSAV:                                                                                                    DE   
gnomAD_SAV:    I#  #K N#HVSLW#        HH  R  S* #RH  H R T  L N  F GL*    L#  #TRV  A  P M   KKVEIF  QDHF   KVDRT* 
Conservation:  0103000010000000011124411431012000001213611512115603121151061101420411324216210231154036003400010112
SS_PSIPRED:    H              HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH         HHHHH   HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH     HHH
SS_SPIDER3:    H              HHHHHHHHHHHH     E HHHHHHHHH    HH    HHHHH   HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH      HHH
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH          HHH     HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH      HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:           DDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:         DDDDDD DD                                                                                     
CARBOHYD:                                                                                                     N    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLS 600
BenignSAV:                                                                     H                                   
gnomAD_SAV:    LL  EFSV  #HM*NM VPGL* G VESTR#VN PM E  L   PQG*  VRLYM    TQGQYHL#QG*  Q Q* NP # R   R S LSS  LV F 
Conservation:  5014122546321023206401132323124215211442142303611666144127210211314004301413138203143102112110012101
SS_PSIPRED:    HHHHHHH     HHHHHHHHH      HHHHH   HHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHH  HHHHHHHHH HHHHHH             EEE   
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     HHHHHH  H      HHHH    HHH     HHHHHHH HHHHH   HHHH    HHHHH H HHHHHH     E      EEEEE  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHH    HHHHHHHHHHHHHHH            EEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                     D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                          D                                            
CARBOHYD:                            N                                                                             

                       10        20        30
AA:            MQEALSGTPCLLGPGPVLTVLALLLASTLA 630
BenignSAV:     V              L   I          
gnomAD_SAV:    V D# L ML F R ESI SIMV R V  VP
Conservation:  000000000000000001011001100101
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:                   HHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                DDDD
DO_IUPRED2A:                                 
PROPEP:              GTPCLLGPGPVLTVLALLLASTLA
LIPID:              S