Q13426  XRCC4_HUMAN

Gene name: XRCC4   Description: DNA repair protein XRCC4

Length: 336    GTS: 1.439e-06   GTS percentile: 0.420     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 158      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MERKISRIHLVSEPSITHFLQVSWEKTLESGFVITLTDGHSAWTGTVSESEISQEADDMAMEKGKYVGELRKALLSGAGPADVYTFNFSKESCYFFFEKN 100
PathogenicSAV:                                           R                                      E                  
BenignSAV:                C                                           T                  S                         
gnomAD_SAV:    T SNRC     C   T Y   I  K I #        # Q  RIA          T   ST    CISKPT  FS RV S E HK #        ILK  
Conservation:  8111523513232711257747253235419714394881158384734226326816455124475267247831111111172805313111835572
SS_PSIPRED:      EEEEEEEE      EEEEEEEE       EEEEEE      EEEEEHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   EEEEEEEE 
SS_SPIDER3:       EEEEEEE      EEEEEEEEE       EEEEE     EEEEE HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   EEEEEEEE 
SS_PSSPRED:       EEEEEE       EEEEEEEE       EEEEEE    EEEEEE HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH      EEEEE    EEEEEEEE 
DO_DISOPRED3:  DDDDD  DDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                 DD     DD                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKDVSFRLGSFNLEKVENPAEVIRELICYCLDTIAENQAKNEHLQKENERLLRDWNDVQGRFEKCVSAKEALETDLYKRFILVLNEKKTKIRSLHNKLLN 200
PathogenicSAV:                                                             Q                                       
BenignSAV:       N                              T  K    Q                                                          
gnomAD_SAV:      N     VPL  QE  IT   V * T    H TP D   SQ    GS*K P  *KA R *      ST   V  F# QL        I #I  Q  *  
Conservation:  3352342463317224237344442551346212113312621835593482243223213532340255257137827755688699397818312152
SS_PSIPRED:        EEEEEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                           DD DD DDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                           DD D DD                                               DD D  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAQEREKDIKQEGETAICSEMTADRDPVYDESTDEESENQTDLSGLASAAVSKDDSIISSLDVTDIAPSRKRRQRMQRNLGTEPKMAPQENQLQEKENSR 300
BenignSAV:                                            P      S                                                     
gnomAD_SAV:      H Q THVR  EK #VG   A GQN  C   #  K   RSG FE SLG    N   V I G   NS   E    #P  F  #       S  P    C 
Conservation:  1332011100011000000111111111342436430110003001012111112420121421522534433230110223112122131101121112
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH                                                    HHHHHHHH            HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHH HHH                                                            HHHHHH           H HHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHH                                                       HHHHHH                 HHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                  Y   T   S                  S   S                                        

                       10        20        30      
AA:            PDSSLPETSKKEHISAENMSLETLRNSSPEDLFDEI 336
gnomAD_SAV:       LPSGMPTT   * KSR S  M HG      #KT
Conservation:  111111101211100110012111112123343331
SS_PSIPRED:                        HHHH    HHHHH   
SS_SPIDER3:                   H H  HHH       H     
SS_PSSPRED:                                HHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:         S               S  T   SS