Q13435  SF3B2_HUMAN

Gene name: SF3B2   Description: Splicing factor 3B subunit 2

Length: 895    GTS: 6.572e-07   GTS percentile: 0.089     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 292      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATEHPEPPKAELQLPPPPPPGHYGAWAAQELQAKLAEIGAPIQGNREELVERLQSYTRQTGIVLNRPVLRGEDGDKAAPPPMSAQLPGIPMPPPPLGLP 100
BenignSAV:                              S                                                                          
gnomAD_SAV:     VR# ##L RT# P #L S A PC S    D  #    T GANH#H K  M     CS     M       R   E VPLT L  P    S  LLA    
Conservation:  4412124234021443121212133462114533364244341162555334233142242434334312125243524622211533448434464525
SS_PSIPRED:                                HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH  EEE                                   
SS_SPIDER3:                                HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH     EEEE                                  
SS_PSSPRED:                                HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    EE                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            D                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 DD  DDDD           DD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLQPPPPPPPPPPGLGLGFPMAHPPNLGPPPPLRVGEPVALSEEERLKLAQQQAALLMQQEERAKQQGDHSLKEHELLEQQKRAAVLLEQERQQEIAKMG 200
gnomAD_SAV:    #M  AL   SL  R        P A    L   H   TMG  KQ Q    R  E     H  H      YL      S    W        QR      S
Conservation:  2357754323764432222316464222444324433532533333123321212344434412231234244526885462566364764644344544
SS_PSIPRED:                                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPVPRPPQDMGQIGVRTPLGPRVAAPVGPVGPTPTVLPMGAPVPRPRGPPPPPGDENREMDDPSVGPKIPQALEKILQLKESRQEEMNSQQEEEEMETDA 300
gnomAD_SAV:        #ALR V    MCIS DL A    RA    #A   T  A AWH#  LL        L AH L         T       H           GV    
Conservation:  2333441131141224322102122222413322332331222254533343866533504523268466749555968652586541110233214240
SS_PSIPRED:                                                                          HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                                          HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                          HHHHHHHHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                              S        T  
MODRES_M:                           R                      R R                                                     
MODRES_A:                                                                                K                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSSLGQSASETEEDTVSVSKKEKNRKRRNRKKKKKPQRVRGVSSESSGDREKDSTRSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEIYEPNFIFFKRIFEAFKLTDDVK 400
gnomAD_SAV:    #LCVDK      A#   I     SW C  Q R EEH Q Q        YQK    P C    LTG  GTDCM Q     K #                  
Conservation:  0111102244246421035585676777667763422111100102331324211212101020225779975677475466776776795697665565
SS_PSIPRED:    HHHH             HHHHHHHHHHHHHHH   HHHH                            EEEE         HHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:    H          H                                                       EEEEE        H HHHHHHHHHH    HHHH
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHHH                                   EEEEE         HHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  D
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDD
MODRES_P:            S S T     S                                          S S                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KEKEKEPEKLDKLENSAAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDVTAQDPKLLVHLKATRNSVPV 500
gnomAD_SAV:    R RQ  L   H P      E N    K           K  E     R      CQV HL            N M      V      I  R  Q   S 
Conservation:  8665886551431322112386845441466654664853145153685598677565964645559774757577775755477649555564474679
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHH    HH                HHHH         HHHHHHHH   HHHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHH HHHHHHHHHH                       HH         HHHHHH     HHHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHH     E 
SS_PSSPRED:                HHH                      HHHH        HHHHHHHHH   HHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDD  D     DDDD DDD       
MODRES_P:                                    S   SS                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETR 600
gnomAD_SAV:           G C            #    V C           *R         V Q        T            M       S   Y  C R  L I#
Conservation:  9979679579779999599775477577547999997999597745455545757597774975779797779775999499997799999957797997
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHH              HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH HH     EEE EEEE     HHHH
SS_SPIDER3:      HHH  HHH               HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH       EEE  EEE    HHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHH             HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH            EE     HHHHH
DO_DISOPRED3:                                              D DDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                        D     D      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                                        
MODRES_M:             R      R                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPWLIAMQRYGPPPSYPNLKIPGLNSPIPESCSFGYHAGGWGKPPVDETGKPLYGDVFGTNAAEFQTKTEE 700
PathogenicSAV:                                                                  P                                 G
gnomAD_SAV:        Q    C #   F  I    H           V      LL         K                     N IR          S     I    
Conservation:  7799997497599746969948442434446657574544756759575759744774444336465567757847746546496779456246447377
SS_PSIPRED:    H         HHHHHHH             HHHHHHHHH                                                    HHH      
SS_SPIDER3:    H         HHHHHH              HHHHHHHHH         E                         E     E         HHH       
SS_PSSPRED:    HHH       HHHHHHH             HHHHHHHHH                                                             
DO_DISOPRED3:                                                                                            DDD D DDDD
DO_SPOTD:                                                                 DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDD DDD DDDDDDDDDDD   DDD DDDDDDDDDD    DDDDDDDDDD     D    D DDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEIDRTPWGELEPSDEESSEEEEEEESDEDKPDETGFITPADSGLITPGGFSSVPAGMETPELIELRKKKIEEAMDGSETPQLFTVLPEKRTATVGGAMM 800
gnomAD_SAV:     D  W S              D    G    S      S                G             M   V  RN ISR L     R  V       
Conservation:  9659425775774795675576554434654355577567774653476555445594667477654435466544225664764665977654474647
SS_PSIPRED:                       HHHHH                                       HHHHH                EE    EE        
SS_SPIDER3:                                                                   HHH     HH          EE    EEEE       
SS_PSSPRED:                                                                   HHHHHH                     EE        
DO_DISOPRED3:  DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD                         D    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                     T                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSTHIYDMSTVMSRKGPAPELQGVEVALAPEELELDPMAMTQKYEEHVREQQAQVEKEDFSDMVAEHAAKQKQKKRKAQPQDSRGGSKKYKEFKF 895
gnomAD_SAV:           T#M I Q  L   V     V V            R     MW   S   E          T    H NG V*  E HE     Q#   
Conservation:  79775654623146563324246555566666675552768999776666666795969865366566767746575264454327447565546
SS_PSIPRED:      EEEEE                EEEE  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
SS_SPIDER3:    E EEEEE  H             EEE   HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHHHHH                  
SS_PSSPRED:        EEE                EEEE  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDD       DD DDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     
MODRES_P:                                                                  S