Q13487  SNPC2_HUMAN

Gene name: SNAPC2   Description: snRNA-activating protein complex subunit 2

Length: 334    GTS: 1.1e-06   GTS percentile: 0.268     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 265      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKPPPRRRAAPARYLGEVTGPATWSAREKRQLVRLLQARQGQPEPDATELARELRGRSEAEIRVFLQQLKGRVAREAIQKVHPGGLQGPRRREAQPPAPI 100
gnomAD_SAV:    R S##SW  SL L  S    LV  R       LL#   W S  QT TA  T     G    VWFL  P  DCLPQ   E MYLR F  L HWK      V
Conservation:  4434120401201000001100041005220530453111001132011511022032005710251074023330511112212111110022103374
SS_PSIPRED:                             HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HH      H
SS_SPIDER3:                             HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   H
SS_PSSPRED:                             HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH      H
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDD                                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDD DDD                                                              DDDDDDDDDDDDDDDD     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVWTDLAEKITGPLEEALAVAFSQVLTIAATEPVTLLHSKPPKPTQARGKPLLLSAPGGQEDPAPEIPSSAPAAPSSAPRTPDPAPEKPSESSAGPSTEE 200
BenignSAV:                      V                                                                                  
gnomAD_SAV:     D*#E   N   L K PV  VYLHMII VDRKR IV DC #AE MRSH  L  R PR  R  SD V A F   SS FT GASHSVL R F TLVS F  #
Conservation:  5192254214430252232268463525444881341341511100112212211130010010212100000010100110021202410111010010
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     HHH                                                               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        H                                                                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                                                                         
DO_DISOPRED3:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:                  DDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DFAVDFEKIYKYLSSVSRSGRSPELSAAESAVVLDLLMSLPEELPLLPCTALVEHMTETYLRLTAPQPIPAGGSLGPAAEGDGAGSKAPEETPPATEKAE 300
gnomAD_SAV:    N V E#  MCR* FF C#  H  K LVV FTLAFNVP  H#   AF  SR#  GRVMDMN HP DS#L STA #PR    #NW # E#S DPST IK TK
Conservation:  1104674578257401112000319542745548376246434511732116014502140142231111100011102000110100010010111031
SS_PSIPRED:      EE HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH   HHH    HHHHHHHHHHHHHH                                      
SS_SPIDER3:         HHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH                                        
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH                                     
DO_DISOPRED3:                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D                   DDDDDDDDD   D              DD        D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30    
AA:            HSELKSPWQAAGICPLNPFLVPLELLGRAATPAR 334
gnomAD_SAV:     RKP LLS*    #L  LL  T K P WSV #  
Conservation:  1122111411222457555139314512110110
SS_PSIPRED:          HHHH          HHHHHHH       
SS_SPIDER3:          HHHH          HHHHHH        
SS_PSSPRED:          HHHHH           HHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD                      DDDDD
DO_SPOTD:      DDDD                        DDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD                            D D