Q13488  VPP3_HUMAN

Gene name: TCIRG1   Description: V-type proton ATPase 116 kDa subunit a3

Length: 830    GTS: 2.587e-06   GTS percentile: 0.826     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 497      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEELEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEE 100
BenignSAV:                                                        L   W                          E        W        
gnomAD_SAV:     SFVL#N* GTVI   #  VTV   MCG  K S L     KT   T   HSL#  WH        A   V EQQ#  A LL E   L  LLWE  HN   
Conservation:  1111111311201111111111102211232122111114532343555543244558455453515613741241122221221515723423514474
SS_PSIPRED:            EEEEEEEEE HHHHHHHHHHHHH   EEEEE      HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             EEEEEEEE HHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                 DDDDDDDD DDDDDDDDDD D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TERLAQELRDVRGNQQALRAQLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAPALERLLWRACRGFLIASFRE 200
PathogenicSAV:                                         P                                                           
BenignSAV:       C                                  S                     EL                                       
gnomAD_SAV:    M C     QGEQS  *# W H R    QVVM H SP S P  T IN S   #S FRG REL   RT    V    H            D HS     L  
Conservation:  4436326525532633262144236145115712101111111122112711323322122423355454584622163165754667685632433415
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH                       EEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH                        EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH                      EEEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE  
DO_DISOPRED3:                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       
DO_SPOTD:                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       
DO_IUPRED2A:        DDDD                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDD D                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMK 300
BenignSAV:        L                                                                                                
gnomAD_SAV:       L   # MCK  M   # M H  KR E*  #QVM G  YRILL   #  PCFR               FRG AQ       Q     L  #LE    M
Conservation:  3220411312441212149579589335627637642765633524321023501231261152355116304441561644034311331313454836
SS_PSIPRED:                   EEEEEEEE HHHHHHHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         E      EEEEEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                  EEEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLF 400
BenignSAV:                          T                                                                              
gnomAD_SAV:     M  T S   M  MY   V AT  C *E  T R   WG LV# R   M RHN RWN S   VH SG M  L* TM V SM HF#   S    VTI S R 
Conservation:  5652487586364635895564884212621541461242342242342325341135654334645535883666589751837456434334555635
STMI:                                                                                               MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH         EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE                HHHHHHHHHHH     EE      HHHHH HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH         EEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH     EEEE               HHHHHHHHHHHH   EEEEE     E H HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH        EEEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE                 HHHH EE EE              EEEH HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTL 500
PathogenicSAV:     R                                      L                                                        
gnomAD_SAV:    V I R    #     LT  T  #  QL ME#T* K  * SL VH V  #RS     IS  H Q   #TA T SWS* M TT S* V         #T PV
Conservation:  5456653688356333542452063122211223743134619984686884895979579979865422352939441362100061001310401327
STMI:          MMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHH HHHHHHHH HHHHHHH HHHH              EE          HHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH    H HH     HEEEH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HE    EE  
SS_PSSPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEE          HHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARA 600
PathogenicSAV:                 N                                                                                   
BenignSAV:                                                              L             L                            
gnomAD_SAV:      SIIS     *AI  N   R V    TLPTC  K T I   IM VT   A   L  LY D   W    M LG I  PR  S F   I     #I VV  
Conservation:  6834269713587687875644515463668658565564485276389526515542753202242643496438643489584366367840314015
STMI:                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:                     HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:          E    E E   HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRRRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLD 700
gnomAD_SAV:    TLVR  P YS   LIY    R K# S # VAIRDM  G S  TM     D    R YSQ#HH W  LTEPRK    RF    HPCGK  RPN    RA Y
Conservation:  1089878648747655212121006702800461264244334564664857333111311110111111112310122001111121110104011001
STMI:                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                             
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH         HHHH               HHHH     
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHH HHHH H HHHHHHHH HHH         HH H                         
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHH                         
DO_DISOPRED3:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                    DDD                       DDDDDD  D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEEEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHA 800
PathogenicSAV:                                                                           R                         
gnomAD_SAV:     D # KFIS KMF   V   NK     A SSTF       N    H C     TL#CV  R R#D# MV   PF   VT  M# M  V    R#PV   T
Conservation:  0031112323433629388558689886998796989665785563455597165440641101101122335444222742685377856676677975
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHH    HHHHHHH  HH HHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHH HHHHHHH      HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  

                       10        20        30
AA:            LRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD 830
BenignSAV:                              T    
gnomAD_SAV:     Q      H N    M  R# S   T IG 
Conservation:  588665666466618282361672511000
STMI:          MMMMMMM                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHH                EE HH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    E    E        H   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH                      
DO_DISOPRED3:                                
DO_SPOTD:                                 DDD
DO_IUPRED2A: