Q13492  PICAL_HUMAN

Gene name: PICALM   Description: Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein

Length: 652    GTS: 6.288e-07   GTS percentile: 0.080     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 260      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSGQSLTDRITAAQHSVTGSAVSKTVCKATTHEIMGPKKKHLDYLIQCTNEMNVNIPQLADSLFERTTNSSWVVVFKSLITTHHLMVYGNERFIQYLASR 100
gnomAD_SAV:          R          ID     #      D MT  NR  V   V Y H VT S  HM        #       L   # A Y     S          
Conservation:  1323232444344321226422243333434541223332322394246444677785566474664252797686757454645642645552554566
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH          HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH           H  HHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHH       EEEEE          HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    EEEEHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                     S   S                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NTLFNLSNFLDKSGLQGYDMSTFIRRYSRYLNEKAVSYRQVAFDFTKVKRGADGVMRTMNTEKLLKTVPIIQNQMDALLDFNVNSNELTNGVINAAFMLL 200
BenignSAV:                                                              P                                          
gnomAD_SAV:     A      S                           A K    N  E   AG      V P      I  VR     FP   ID S   SRI  V  TPM
Conservation:  4489463875874633343543674545366447424662243642534581452572413556564353663636488694434369273774339465
SS_PSIPRED:         HHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE        HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        E HH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE            HHHHH  HHHHHHHHHHHH      HHH  HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       EE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FKDAIRLFAAYNEGIINLLEKYFDMKKNQCKEGLDIYKKFLTRMTRISEFLKVAEQVGIDRGDIPDLSQAPSSLLDALEQHLASLEGKKIKDSTAASRAT 300
gnomAD_SAV:        V  L   S         H #T     R   VM              IR       EGS    F   SN            S RR  R         
Conservation:  9563465775997775668664625471576659639648816444555665364459774484756453512553242363236323313301111430
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHH          HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           E   HHHHHHHHHHH           H  HH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                  DDD     DDDDD            DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLSNAVSSLASTGLSLTKVDEREKQAALEEEQARLKALKEQRLKELAKKPHTSLTTAASPVSTSAGGIMTAPAIDIFSTPSSSNSTSKLPNDLLDLQQPT 400
BenignSAV:                                                                                       F                 
gnomAD_SAV:      Y    C  NA   P     W E  T     T  R    KH R  G N  IY    PF    L  EKLAVLVV     LC        #SG PG  HS 
Conservation:  2120232332231141301121111122112111111234124433110101112211321222011012200010111110221112222316322342
SS_PSIPRED:           HHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHH                        
SS_SPIDER3:                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                     
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD      DDDDD          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                      DDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDD D              DDD  D DDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:        S           S                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FHPSVHPMSTASQVASTWGDPFSATVDAVDDAIPSLNPFLTKSSGDVHLSISSDVSTFTTRTPTHEMFVGFTPSPVAQPHPSAGLNVDFESVFGNKSTNV 500
gnomAD_SAV:      Q  N VTAP R T   R L# V     #  T G    FI  T V    L  H  ALAAMA AR   LA  S  A KS#  PA     KT   S   DI
Conservation:  2011111122112221225213132122111412125341102112202211122111111121111111412231124111112122543234112000
SS_PSIPRED:                                                                                              HH        
SS_SPIDER3:                                                                                              H         
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD                                     DD            DDDDDDDD DDDDDD D DDD           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVDSGGFDELGGLLKPTVASQNQNLPVAKLPPSKLVSDDLDSSLANLVGNLGIGNGTTKNDVNWSQPGEKKLTGGSNWQPKVAPTTAWNAATMAPPVMAY 600
BenignSAV:                                                                                  CE                     
gnomAD_SAV:    T    A   P      A  CH  K    R Q G F  EG      SH   FSVR     SG DC ELS        K  R   QAA#C TT V #A   C
Conservation:  0001112102423315100010000010001104132134323634433441311110314117242274434771253131112216232331110100
SS_PSIPRED:                                              HHHHHH                                                    
SS_SPIDER3:                                              HHHH                                                      
SS_PSSPRED:                                               HHHHH                                                    
DO_DISOPRED3:  DDDD        D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:               DD D DD DDDDDDDDDDDDD  D           D  D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D           

                       10        20        30        40        50  
AA:            PATTPTGMIGYGIPPQMGSVPVMTQPTLIYSQPVMRPPNPFGPVSGAQIQFM 652
BenignSAV:                                             L           
gnomAD_SAV:        A S## C T     NI   MRSN T G S  K RDTL S     MECL
Conservation:  2012222221302121122213313313332622222113232133311020
SS_PSIPRED:                                                        
SS_SPIDER3:                                                        
SS_PSSPRED:                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             D            D   DDDD DDDD   DDDD DDD