Q13507  TRPC3_HUMAN

Gene name: TRPC3   Description: Short transient receptor potential channel 3

Length: 836    GTS: 1.125e-06   GTS percentile: 0.279     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 258      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISK 100
gnomAD_SAV:     QGN G    K   LI SAH S   T#  #   V  F      C T   F   KI  M        H   D       #   Q D  ECV E        
Conservation:  1201135242444444521221345127628847766885837466645211556947755767499898458767635489131144659979878969
SS_PSIPRED:                             HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH               HHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:         H H                 HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH               HHHHHHH   HHHHHHHH      EHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                             HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH      EE      HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD D DD                                                                                 
DO_IUPRED2A:   DDDD                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSR 200
gnomAD_SAV:    A    L    KY   S R     RLY  Q   #   S   # K        #  S     *  G      DVKVKLL  C F  RY L    Q      C
Conservation:  9545869468382461220664044242421354776595586597267795597678347866539725853833995559190191235118485985
SS_PSIPRED:      HHHHHHHH    HHHHH                               HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHHHHH     HHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHH    H            H         E     E      HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH   HHHHHHH    HHHH                     HHHHHHHH  HHHHHHHHHH             HHHHHHH     HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                         DDDDDDDDDDDDD                                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLA 300
gnomAD_SAV:    L#   #    IR  F     YL        I  TT T  #   #   W   K            FQ         S  R       IRG   L  CL  V
Conservation:  6864685698964886854468543683575885268558488656922992997675987996986749947766940110000000015245265555
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH                  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH        HHHH      HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH                 HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGIT 400
gnomAD_SAV:    V                P M    K  #    NT V Y IL  MV   L   F   N#         #   #R   REG  M   D      LN  K   
Conservation:  8886597568988888684458855653756622546243743633758475214434734537336357846864743572375357435545772932
STMI:                                                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          
SS_PSIPRED:    HHH HH HH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHH HH    HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSE 500
gnomAD_SAV:    M  # I   H   #  #   E        IF      *    DF        S   R    I L          TS      M  #R   N F #N    
Conservation:  2354231112224549345615576846842663966837763591554488325598499866855935672575563246108904651311003401
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            
SS_PSIPRED:         EE    HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:        EEEE    HEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:         N                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFT 600
gnomAD_SAV:         Q L  AF            T      V     S W   VF     L       V      S       T          V  A *  #       
Conservation:  3382144196435621828696865886877777957757655678767567997777997677766977695677697739674969472745141554
STMI:                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:        HHHH    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:         HHH HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPS 700
PathogenicSAV:                                                                             H                       
gnomAD_SAV:         #  I          S    R       S  *I     SIA  I                  G  GA     C*    Y  GY    L  L   L 
Conservation:  5499999796769777777367554337797795776777676665766976666675657679973879999977779795569526246657674485
STMI:                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                          
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHH       EE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:     HHHHHH  H HE    EEEE E     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHH      EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDIS 800
PathogenicSAV:                                                              H                                      
gnomAD_SAV:      *    FTLV D  R     F   MKT  D   FG     *          LSN  SR  H*K L    T            K             G  
Conservation:  6342212221300111011000014164210000002222012212012010012111134356245335566674445244433445657654655887
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH             HH      HHHHH         HHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHH                   HHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH           HHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                BBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDBBBBBBB DD     
DO_SPOTD:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 DDDDDDD                
DO_IUPRED2A:                                                                                         DD  D         
REGION:                                                                        QIMKRLIKRYVLKAQVDKEND               

                       10        20        30      
AA:            SLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE 836
BenignSAV:               G                         
gnomAD_SAV:              GH PDK       F  T  L      
Conservation:  686578763331222232044126221100000000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                     DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                  DD DDDDD  DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: