Q13596  SNX1_HUMAN

Gene name: SNX1   Description: Sorting nexin-1

Length: 522    GTS: 2.095e-06   GTS percentile: 0.687     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 250      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASGGGGCSASERLPPPFPGLEPESEGAAGGSEPEAGDSDTEGEDIFTGAAVVSKHQSPKITTSLLPINNGSKENGIHEEQDQEPQDLFADATVELSLDS 100
gnomAD_SAV:       SSS  #D K  LSL RR   V ##TVRE  R G       K   A       PR ATV  A  TFK  CE  A##            E   Q    R
Conservation:  2222222200000011100200022222222222222220112220110022212200022220000001012256211322231145536533644343
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                   HH     HH            
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D
MODRES_P:                                     S      S T      T         S             S                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TQNNQKKVLAKTLISLPPQEATNSSKPQPTYEELEEEEQEDQFDLTVGITDPEKIGDGMNAYVAYKVTTQTSLPLFRSKQFAVKRRFSDFLGLYEKLSEK 200
BenignSAV:                   Y                                                                                     
gnomAD_SAV:      I P RM      F  L     CL   LA#        GE C    S   AQ T N    *I      # RS      R#     YN  #  H    K 
Conservation:  3121012001131220221010111201111363454312504540625438885845535452646364433248112133448868888885344425
SS_PSIPRED:                                  HHHH HHHH    EEEEEE  HHH        EEEEEEE          EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHH H                      HHHHHHH     EEEEEE   H      E EEEEEEEEE         EEEEE E HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                   HHHHHH       EEEE            EEEEEEEEEE         EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:   DDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DD                                       
BINDING:                                                                                            R S            
MODRES_P:                                                                                             S            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HSQNGFIVPPPPEKSLIGMTKVKVGKEDSSSAEFLEKRRAALERYLQRIVNHPTMLQDPDVREFLEKEELPRAVGTQTLSGAGLLKMFNKATDAVSKMTI 300
gnomAD_SAV:      PS    L  L  NF  #    IWMKVC Y    KRQ VSF   IH TI    V   AEI #       T# M   A    # F        GI     
Conservation:  5242627574465654464565679567376368266773596775284525626569567449994466456345544645533444355435445445
SS_PSIPRED:         EEE            EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH    HHHHH     HHHH   HH   HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:        EEE               EE       HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   HHHHHH      HH         HHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:         EE               E        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH       HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                 DD  DDDDD  D         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDD      DDDDDD                                     DD    DD                                
BINDING:                    K                       R                                                              
REGION:                                                                                        GAGLLKMFNKATDAVSKM  
MODRES_P:                                                                                     S                    
MODRES_A:                                          K                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KMNESDIWFEEKLQEVECEEQRLRKLHAVVETLVNHRKELALNTAQFAKSLAMLGSSEDNTALSRALSQLAEVEEKIEQLHQEQANNDFFLLAELLSDYI 400
gnomAD_SAV:       QL F  G  V*   R   C Q VP  LAA    K    R I              NSM   W  C   D    M   YK EVSTG  F#       N
Conservation:  5444351776483744533644565542234266145676515641666836686548654696866588696546473455554229542544444965
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                D                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLLAIVRAAFDQRMKTWQRWQDAQATLQKKREAEARLLWANKPDKLQQAKDEILEWESRVTQYERDFERISTVVRKEVIRFEKEKSKDFKNHVIKYLETL 500
BenignSAV:                                                                      N                                  
gnomAD_SAV:    CFQ  LC   Y H   R C #         G  #SQ   TKR        NGLFK AFQ  HH  N Q      Q  M Q K     E  KRM RF  IV
Conservation:  8643456337548563856666462286785625543323648564856757819472541444457535413663431464543334440142257423
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20  
AA:            LYSQQQLAKYWEAFLPEAKAIS 522
gnomAD_SAV:        H #SN  DS      T F
Conservation:  3136651151311344222121
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH HHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                        
DO_SPOTD:                           D
DO_IUPRED2A: