Q13753  LAMC2_HUMAN

Gene name: LAMC2   Description: Laminin subunit gamma-2

Length: 1193    GTS: 1.371e-06   GTS percentile: 0.389     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 21      gnomAD_SAV: 646      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSRREVCDCNGKSRQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSARCDNSG 100
PathogenicSAV: #                                                                                                   
gnomAD_SAV:     LV   S     L #   DG P G  A  G A FG  V   # #G AR#  LY    N  GD R KRR     W G   C  #   KP     VQ    R
Conservation:  1000020103111121111112001106171225018124024211220524811703442822751721253030110051331522155111263107
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                               
SS_PSIPRED:                                            HHHH                                                        
SS_SPIDER3:        HH                             H    HHH        EE             E              E        EE        
SS_PSSPRED:        EE                                  HHH                                                         
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                 C C      C               C  C        C  C            C  C C         C    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCDAGRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSA 200
BenignSAV:               P   Q        M           V                            C    L                          C   
gnomAD_SAV:    Q  Y SRM ES  EGY RA PV M VWY  #R V V  GN  TP FT S  V C    T   AKH # Y*       A I   S#       L   S  E
Conservation:  1607312215047507113311331164100000000090921284230500529087025281121242341637310331761268734671170230
SS_PSIPRED:     EE                            HHH                                                             EE   
SS_SPIDER3:     EE                EEE         H H                     EE    E                                 EEE  
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:                                          DDD DDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:       C C        C  C           C          C C        C    C C        C  C              C                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EYSVHKITSTFHQDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFDYRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPL 300
BenignSAV:                               S                   E                                                     
gnomAD_SAV:    V#RIR T       IG   V  QD  SE   #  HRKH      Q HS   L # #      MN   TP    HLNKR  YTP      DV V W I T 
Conservation:  1412106162801513281310021000132511012331301110122250362144424127645143414123111113100152849152143311
SS_PSIPRED:      EEEEEE          EEEE               EEE         EEE  HHH          EEEEEEEE           EEEE   EEEEEE 
SS_SPIDER3:      EEEEEEE EE      EEEE    E EEEE   EEEEEE       EEEE  HHHH   EEE   EEEEEEEE           EEEEE  EEEEEE 
SS_PSSPRED:       EEEEEE         EEEE                          EEEE  HHH    E     EEEEEEEE          EEEEE   EEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                               D                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPLGKTLPCGLTKTYTFRLNEHPSNNWSPQLSYFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTGYIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYKGQFCQDCASGY 400
gnomAD_SAV:    RS A S LY   E       QQST   R R  CS  *G  WY I VH *    K G V V S    L CL      H    RV    #  H   YR    
Conservation:  1101000200000031535230112071304312254247156534152212310213151171415611113115067408196064093495093266
SS_PSIPRED:               EEEEEEE              HHHHHHHHH   EEEEEE      EEEEEEEEEEEEE         EEEE                 E
SS_SPIDER3:               EEEEEEEE             HHHHHHHH    EEEEEEE     EEEEEEEEEEEE          EEEEE          E      
SS_PSSPRED:                EEEEEE              HHHHHHHHHHHHHHHEEE      EEEEEEEEEEEE          EEEE                  
DO_DISOPRED3:     DDD                                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                               N                   N                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KRDSARLGPFGTCIPCNCQGGGACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGFYNDPHDPRSCKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGY 500
BenignSAV:                         E                                                                               
gnomAD_SAV:    R E*V#  S   Y   K HEER#Y         E    HTQGD   V  FDNL #LH  ES  YY R      L#MV  M      R SS C   S    
Conservation:  3610300533319328192265173315518051524010031180075622310101722998202138211112024291154142190182172454
SS_PSIPRED:    EE           EE                                                       EE      EEE                   
SS_SPIDER3:    E           EEE        E      EE                           EE         EE      EEE             E    E
SS_PSSPRED:                                                                                  EEE                   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                   C C     C          C  C        C  C    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FGDPFGEHGPVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPADKCRACNCNPMGSEPVGCRSDGTCVCKPGFGGP 600
gnomAD_SAV:     #HRSVKRC   L     RK D G #     YP    Y    D  D       * A  RG  VL      Q Y    K  DTA RQNESI#   Q   V 
Conservation:  5733160040022801817324342332438520382854732452702831810564525321020025237274206401028112727092266280
SS_PSIPRED:                                                                                              EEE       
SS_SPIDER3:                  E                      E EEE                            E         E  E      EE        
SS_PSSPRED:                                                                                              EE        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                   C  C C           C      C  C        C  C                C  C C         C     C C       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NCEHGAFSCPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISKAQGGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLDDLKM 700
BenignSAV:            I                                                                      F              C      
gnomAD_SAV:    S KR T  YTVY     T     I     TQ   A  #DRVV  RVI    SL K  E# RG    VKT VS  KCPAF VTT M   KN   #      
Conservation:  3821213086296135203411310461144023111112000101012211111141120223021102131111500330032112010111311210
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                       HHHHHHHH      EE             HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                    BB BBBDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        D  DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD DDD             D            DDDD    
DISULFID:       C      C  C                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFKSLAQEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEG 800
BenignSAV:                     Q               T                                                                   
gnomAD_SAV:     G KIW PEI    * QVADG VI VH R V N D M  P V  LG   V I  RI    D#*I #  #   N TG Q#   D     T    P VPP #
Conservation:  1210110110111112122002310311151132004102132001000132032024135006312411131032124114101411410131111120
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            DD       D   DD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D   DDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D        DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGSGSGSPDGAVVQGLVEKLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLLDSVSRLQGVSDQSFQVEEAKRIKQKADSLSSLVTRHMDEFKRTQKNLG 900
BenignSAV:           NA  G                                             P                                           
gnomAD_SAV:    LR AISGL##G#  RFE    N         K D *V T T    R GVCFP  A Q  V C E     GVR FQ# V    R          H  N PR
Conservation:  0000021000012016102312111121161123112102421211020011012402000000101000301311221141003111101101212121
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                                                                                           
DO_SPOTD:       DDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDD                           DD              DDDD      DDDDD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANLAKSRAQEALSMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALGSA 1000
gnomAD_SAV:       GAEP FS# R N     YR FTH S     E KV GTD DS           G          E     T     V     G    IK# G  M  T
Conservation:  1010121115111200031222711241152204116310311210331133114332111321131231112321102112401312320141125113
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDD      D                            DD DD                DDDDDDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:                                               N                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAMEKGLASLKSEMREVEGELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLN 1100
BenignSAV:                                                                         M                               
gnomAD_SAV:    S  VH V   SR G      T  K R  T  VK  VY    # N  #P  CGKKG K    K K  L MTRV   IM  ## N  ITTR S   T    S
Conservation:  1112104102201420240122200000000211211133111113106101311201231021003110001211210231130013114302511241
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:           D      D  DD  DD     DD   D D                   DD                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDD DDD DDDDDD                           D     DDDD D DDDDDDDDDD          D         DDDD         
CARBOHYD:                                      N                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90   
AA:            TLDGLLHLMDQPLSVDEEGLVLLEQKLSRAKTQINSQLRPMMSELEERARQQRGHLHLLETSIDGILADVKNLENIRDNLPPGCYNTQALEQQ 1193
BenignSAV:     S                                                                                            
gnomAD_SAV:    S ESF #V # AV# GKQ  A V   VPQ         QH V    DK #  K      D R             VTVS  R  C   T   E
Conservation:  152155114211012211110162022112200011181024106211410511240032135115215416822611358117322232522
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                       D      D
DO_SPOTD:                                                                                       DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                       DD DDDDDDDDDDDD 
DISULFID:                                                                                         C