Q13790  APOF_HUMAN

Gene name: APOF   Description: Apolipoprotein F

Length: 326    GTS: 1.034e-06   GTS percentile: 0.239     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 167      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTGLCGYSAPDMRGLRLIMIPVELLLCYLLLHPVDATSYGKQTNVLMHFPLSLESQTPSSDPLSCQFLHPKSLPGFSHMAPLPKFLVSLALRNALEEAGC 100
gnomAD_SAV:    V     C  A #G   F        V    MPTANTI   NR  I ##SL  W  L T A R   R  D#MP   L  V LP         S     G  
Conservation:  0000020000041224022231043321356021010201001000104111212111110322801622122243202103442534433222811359
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                 
SS_PSIPRED:                  HHH HHHHHHHHHHHHH                                 HHHH               HHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHHHHHHHHHH     EEE                          HHHH  HH           HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                   EEHHHHHHHHHHHHHH                                  HHH HHH          HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                            DDDDDDDDDDDDDDD                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDD       DDDDDDDD D                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
PROPEP:                                           ATSYGKQTNVLMHFPLSLESQTPSSDPLSCQFLHPKSLPGFSHMAPLPKFLVSLALRNALEEAGC

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QADVWALQLQLYRQGGVNATQVLIQHLRGLQKGRSTERNVSVEALASALQLLAREQQSTGRVGRSLPTEDCENEKEQAVHNVVQLLPGVGTFYNLGTALY 200
BenignSAV:                 H                                                                G                      
gnomAD_SAV:     G   T  P #*G*# MS  H VM  IQE    K   KSM   V PAT    S G E# R A#H FLI   DD N  G PSA  Q    RN     KTF 
Conservation:  0033214112720137104610721151131212010110211341425244400013206126110000911128304414323592533495377548
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH            HHHH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH           HHH    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                  DDDDDDD                 DDD DDD                                     
DO_SPOTD:                                     DDDDDDDD                DDDDDD                                       
DO_IUPRED2A:                                                              D DDDDDDDDDDDDD  D                       
PROPEP:        QADVWALQLQLYRQGGVNATQVLIQHLRGLQKGRSTERNVSVEALASALQLLAREQQSTGRVGR                                    
CARBOHYD:                       N                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YATQNCLGKARERGRDGAIDLGYDLLMTMAGMSGGPMGLAISAALKPALRSGVQQLIQYYQDQKDANISQPETTKEGLRAISDVSDLEETTTLASFISEV 300
gnomAD_SAV:    C IE G R  SG* *   V V        G#I R# #S V           E *  T        V TA L   EKS KV   M # K K   T  T  A
Conservation:  8522491228328532444755664632328233522522422446543726522431341112210122320112130123112212111101121320
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH                        
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHH HH    HEHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H                               E   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHH    
DO_DISOPRED3:                                                                           DDDD DDDD         DDDDDD   
DO_SPOTD:                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:                                                                     DDDDDDD     DDDD                  
CARBOHYD:                                                                               T                          

                       10        20      
AA:            VSSAPYWGWAIIKSYDLDPGAGSLEI 326
gnomAD_SAV:         HL RTTV   NF T S  ##T
Conservation:  13000000000000000000000000
SS_PSIPRED:             HHHHH            
SS_SPIDER3:           HHHHHHH            
SS_PSSPRED:             HHHE             
DO_DISOPRED3:                          DD
DO_SPOTD:                        DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                             
MODRES_P:                            S