Q13905  RPGF1_HUMAN

Gene name: RAPGEF1   Description: Rap guanine nucleotide exchange factor 1

Length: 1077    GTS: 1.011e-06   GTS percentile: 0.228     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 424      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDTDSQRSHLSSFTMKLMDKFHSPKIKRTPSKKGKPAEVSVKIPEKPVNKEATDRFLPEGYPLPLDLEQQAVEFMSTSAVASRSQRQKNLSWLEEKEKEV 100
gnomAD_SAV:     NR   H YP    I  L  L    #R M  E  R# D FIM A RAM EQ A  C S SC    Y    S  L T   L     T  H       Q DI
Conservation:  9224747967676765545665666466486462541212341057113222222222222222222222222222222222222226232564747769
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH                              HHHH             HHHHHHHH    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             EEEEEEEEHH                              HHH              HHHHHHHH     HHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHH                                               HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D D D                       DD                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSALRYFKTIVDKMAIDKKVLEMLPGSASKVLEAILPLVQNDPRIQHSSALSSCYSRVYQSLANLIRWSDQVMLEGVNSEDKEMVTTVKGVIKAVLDGVK 200
gnomAD_SAV:     G  C   N        E   AI           FVT M  N # R    FC G  Q  K   T  C   LMV   L     #T M     VR M     
Conservation:  7679687657599636515974777676457777334646171413155355975657979966976979475854653576725147625979999679
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HH      HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    H HH     HHHHHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     EE     HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                               D DD                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELVRLTIEKQGRPSPTSPVKPSSPASKPDGPAELPLTDREVEILNKTTGMSQSTELLPDATDEEVAPPKPPLPGIRVVDNSPPPALPPKKRQSAPSPTRV 300
gnomAD_SAV:    D   H  K   HLP M  M    #   RY   GVLM EGK  N T#MI    PS  FQHS#YD  V T LS R  W I      T       L#L   Q 
Conservation:  5795512653337775341431343214310141531423032433331121205011401236299988899334325412364895669332256445
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH                            HHHHHHHH                                                       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH                            HHHHHH                                                       E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH                             HHHH                                                        E
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                                                         SPPPALPPKKRQ        
MODRES_P:                                                                                      S           S       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVVAPMSRATSGSSLPVGINRQDFDVDCYAQRRLSGGSHSYGGESPRLSPCSSIGKLSKSDEQLSSLDRDSGQCSRNTSCETLDHYDPDYEFLQQDLSNA 400
gnomAD_SAV:     L  L  QP G T    EV #   G N  P     V GP # A   H   Y N SEF R ED           Y Q        RC  N     E  A T
Conservation:  7654855523462445131223535166214776655546424568437754747779496758552519797496677676772677776773677621
SS_PSIPRED:     EE                      HHHHH                              HHH                 EE         HHH      
SS_SPIDER3:     EE                      HHHHH                               HH                  E         HH       
SS_PSSPRED:    EEE                      HHHHH                                                             HHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD         D D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDD DDDDDDDDDD
MODRES_P:                   S                    S                        S                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQIPQQTAWNLSPLPESLGESGSPFLGPPFQLPLGGHPQPDGPLAPGQQTDTPPALPEKKRRSAASQTADGSGCRVSYERHPSQYDNISGEDLQSTAPIP 500
gnomAD_SAV:       L  MS   GL S  SR CV   VSL      RDY   GR   AR    M S  HK  H RT   MVES R   F G# SL  #H# AA  E I L  
Conservation:  7313211221778595201632452231031050011511110121000010975792767554322116133141233533547694253722012222
SS_PSIPRED:                   HHH                                                               HHHH    HHH        
SS_SPIDER3:                                                                                        H    HHH        
SS_PSSPRED:                                                             HHH                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                           DTPPALPEKKRR                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVPYAPFAAILPFQHGGSSAPVEFVGDFTAPESTGDPEKPPPLPEKKNKHMLAYMQLLEDYSEPQPSMFYQTPQNEHIYQQKNKLLMEVYGFSDSFSGVD 600
gnomAD_SAV:     I  VS  G VL PR S   L QS  N IVS AISE G                       L     VL  M   K M E#R ##       GNP     
Conservation:  1131433331142312022112221113022211124236776956446334364454664558675466436742356534441324534434451203
SS_PSIPRED:                                                    HHHHHHHHHH                   EEHHHHHHH HHH          
SS_SPIDER3:                                                    HHHHHHHHH                       HHHH HHHH           
SS_PSSPRED:                                                 HHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDD DD                DDD
MOTIF:                                              EKPPPLPEKKNK                                                   
MODRES_P:         Y                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVQELAPPPALPPKQRQLEPPAGKDGHPRDPSAVSGVPGKDSRDGSERAPKSPDALESAQSEEEVDELSLIDHNEIMSRLTLKQEGDDGPDVRGGSGDIL 700
gnomAD_SAV:    #M  PGLL T  R   H  TS   N    E  V  SI E     S      L#    L   K KMN  # V  #K ITK M  R   NEL ICR   N  
Conservation:  2132123453576444423311112202121120012111233200220112222020211122357535246157533543543335654744764555
SS_PSIPRED:                                                        HHHH                HHHHHHHH           EEEE HHHH
SS_SPIDER3:                                                          H                 HHHHHHH EE         EEEE HHHH
SS_PSSPRED:                                                                                 HHHH               HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDD DDDDDDD 
MOTIF:              APPPALPPKQRQ                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVHATETDRKDLVLYCEAFLTTYRTFISPEELIKKLQYRYEKFSPFADTFKKRVSKNTFFVLVRVVDELCLVELTEEILKLLMELVFRLVCNGELSLARV 800
gnomAD_SAV:             R     Y          M L               L TN L   I      M  W                  I M LH  FTR       
Conservation:  4655545434946777979777796744997795974477427635474464766776697777676666467777779549769973964297979997
SS_PSIPRED:    HHHHH      HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH        HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H      HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH        HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH EEEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRKNILDKVDQKKLLRCATSSQPLAARGVAARPGTLHDFHSHEIAEQLTLLDAELFYKIEIPEVLLWAKEQNEEKSPNLTQFTEHFNNMSYWVRSIIMLQ 900
gnomAD_SAV:      N                   S V QR    L S  N R Y      K        I   S I         K    F#H M          Q V   H
Conservation:  9949796962676342312204797765665997779775779677999977657975777999999999999996567747779799999799959757
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH                     HH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH         HHH             HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:          BBDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_SPOTD:               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                DDD                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKAQDRERLLLKFIKIMKHLRKLNNFNSYLAILSALDSAPIRRLEWQKQTSEGLAEYCTLIDSSSSFRAYRAALSEVEPPCIPYLGLILQDLTFVHLGNP 1000
gnomAD_SAV:           Q     VRVR  S        *    C V     H  G    I  C   C    N     Q    T L   L               I    S
Conservation:  9647745466566777776644664763367645647466665665544444654447467797777767979967777977779999999979799999
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   HH     HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH   EEE       HHHHHHHHHH      HHHHHHHHH        HHHHHH HHHEH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70       
AA:            DYIDGKVNFSKRWQQFNILDSMRCFQQAHYDMRRNDDIINFFNDFSDHLAEEALWELSLKIKPRNITRRKTDREEKT 1077
gnomAD_SAV:      MNR  K        S     C    #   TQ  Y   S LS  G                 K L     EW GN 
Conservation:  94444979977779999977497577747654455777739976767997777799997999997529676575652
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:         E  HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH       HHHHHHHHH                  
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                     DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                      DDDDDDDDDD