Q13948  CASP_HUMAN

Gene name: CUX1   Description: Protein CASP

Length: 678    GTS: 1.052e-06   GTS percentile: 0.247     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 308      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVP 100
BenignSAV:                                                                                                       I 
gnomAD_SAV:       SAA  L   RL          NG TA  V Q E       W     W   N IL       G         T          G      C     L 
Conservation:  1111111111111111111113342212114211221211242224322322221243314111220101221253653355333524672443244237
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:        H HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBB                  BBBBBBBBB BBBBBB                                                          
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                              DDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDD  DD                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPVPALDLGQQLQLKVQRLHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSK 200
gnomAD_SAV:    E A T E R*HFK  L C  N             K      KM     M  T     QA    P   DK T FKR #              D H   N  
Conservation:  6435365234254235442422333222546221142523412300421122210221212101110010001332114214333141204333143429
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           H HHHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHHHHHHHH    E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H   HH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                        DD        DBD 
DO_SPOTD:                                                                                              D DDDDDDDD  
DO_IUPRED2A:                           D DDDD  D D                                D  DD  DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSSLE 300
BenignSAV:                       Q                                                                                 
gnomAD_SAV:       P # I R RK  KI Q K  NV    N      T# M  V M FV  K  GD   K V       LL S              M P T M IH    
Conservation:  9245516433775462356345246526533523282265124334832325665166554335543623212311213121312303111212214344
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH  HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD             DDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDD D                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKN 400
gnomAD_SAV:    AQ  TRDW MT   G ##  R IFI  Q       #R      T   A R    N  V     K   D SV   T L L KDT ILY TQ  QMR MG  
Conservation:  5351365392257355652672363533524325633751673151233344525721627764584673246554233221342521252252442351
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH                  EEEHEE   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                   DDDDDDDDDDDD           
DO_IUPRED2A:                                 D     DDD         D   DD                     DDD DDDDDD   D           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSLQSENAALRISNSDLSGRCAELQVRITEAVATATEQRELIARLEQDLSIIQSIQRPDAEGAAEHRLEKIPEPIKEATALFYGPAAPASGALPEGQVDS 500
BenignSAV:                                                                    T                                    
gnomAD_SAV:    SL RP S V H    A N C G    CM      VA   QV TH      NT C#HQ GDKS V QC #E            CR V   RV I D  M  
Conservation:  3112254212203211111983582767789789896691114334542142431410211301111100000100011111111111111111111100
SS_PSIPRED:            EEEEE        EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH HH     HHHHHHHHH             HHHH
SS_SPIDER3:            EEEE        E EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH     HHHHHHHHH               HHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHEEE         EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH             HHHH
DO_DISOPRED3:                                                             BBDBBB                                   
DO_SPOTD:                                                                DDDD                                      
DO_IUPRED2A:          D D                                             DD  D DDDDDDDDDD          D    D             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLSIISSQRERFRARNQELEAENRLAQHTLQALQSELDSLRADNIKLFEKIKFLQSYPGRGSGSDDTELRYSSQYEERLDPFSSFSKRERQRKYLSLSPW 600
BenignSAV:                                                 V                                                       
gnomAD_SAV:     F S    G C H L        PV    P    N P   CT# VQ       V  *L QS S N A  Q W P K HP SLC   RQD# S N N IR 
Conservation:  1100001202012011011111111100101021102221110101010120011121021111111111111111111210322432123121111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHH HHHHHH        HHHHHHHH    HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH                   HHHH        HHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            EE   HHHHH        HHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:               BBBBB                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                 DDDDDDDDD                                
DO_IUPRED2A:                  DDDD      D                                         D  D                             
MODRES_P:                                                                                           S              

                       10        20        30        40        50        60        70        
AA:            DKATLSMGRLVLSNKMARTIGFFYTLFLHCLVFLVLYKLAWSESMERDCATFCAKKFADHLHKFHENDNGAAAGDLWQ 678
gnomAD_SAV:            H    S  V#A S LH  CV R  L EV      K##   RV   T   T Y Y# Q#   RVVG A  *
Conservation:  211111111111111111111111111111111111022312110112222224123223723442473353232232
STMI:                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            
SS_SPIDER3:      HHH   HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH           H  
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                    BBBBBBBBBBBB
DO_SPOTD:                                                                          DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: