Q14028  CNGB1_HUMAN

Gene name: CNGB1   Description: Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1

Length: 1251    GTS: 2.518e-06   GTS percentile: 0.811     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 15      gnomAD_SAV: 802      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETESESMPPEESFKEEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSR 100
BenignSAV:                                                                                          Q             H
gnomAD_SAV:    IWD* *SM  *SA  AG  E *GV      L L V MG ALY#   K   K TTRKK L  K  VMT #N   SR TT P I P#Q   S   KISGA L
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                HH                         HHHHHHH      HHH            H
SS_SPIDER3:        E E E             HHH                                               H                 E         
SS_PSSPRED:       HHHE                                                                                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RVLTWLMKGVEKVIPQPVHSITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQDTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVWRDEPAVATGAASDPAPPGRP 200
BenignSAV:                                                   R                                                     
gnomAD_SAV:    G   S L DI T  L*     M  #PH         #EYIA S K RK  H WLR LM  *  H    M  R  R  # * VKL    CT    PT  CT
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH                                    HHHH       HHHHHHHHHHHHHH                               
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   EEE E           H  E             HHHHH       HHHHHHHH    E                                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  EEE                                          HHHHHHHHHHHH                                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQAQTSSLPPTRDPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTISILPGGQV 300
BenignSAV:                                          S                                                              
gnomAD_SAV:       R     WKS#      H #    AR    Q T TSP THNTFR  S V  T L#CF NK   V  *S  R     #K HC  MY     N  S#  M
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                       HHHHHHHHHHHHHHH                       EEEEE      
SS_SPIDER3:                                                       HHHHHHHHHHHHHHH                      EEEE        
SS_PSSPRED:                                                         HHHHHHHHHHHHH                       EEEE       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EPDLVLEEVEPPWEDAHQDVSTSPQGTEVVPAYEEENKAVEKMPRELSRIEEEKEDEEEEEEEEEEEEEEEVTEVLLDSCVVSQVGVGQSEEDGTRPQST 400
gnomAD_SAV:     A FA  AF L *KY N*  NIGS S  MI V   D  V GETL D  W  D      DK*KKAQ    G L K M      LHA MS N   RIQT N 
Conservation:  1111111111111111000000011111110000110111110100011111111111111111111111111111111111111111110000000000
SS_PSIPRED:                HHHH                HHHHHHHHH    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    
SS_SPIDER3:                   H                  HHHHHHH   H      HHH        HHHHHHHHH  HHH H  H                  H
SS_PSSPRED:                                       HHH                                                              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SDQKLWEEVGEEAKKEAEEKAKEEAEEVAEEEAEKEPQDWAETKEEPEAEAEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLMAEENPPSTVLPPPSPAKSDT 500
BenignSAV:      N                                                                            I                     
gnomAD_SAV:    ANR  *       E   GD T   DK   K    NK *NCVD    # P TGSTC     M   L  RLKYAVTAGFRFV    TH  M S L  D  GS
Conservation:  1111000000011111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111010000000111111100000000111
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH  HHHHHHHHH                                             
SS_SPIDER3:     H HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH    HHHHHHH              EE                               
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHH                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSDPTTPKDTDGQDRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKP 600
BenignSAV:                                       A                                                                 
gnomAD_SAV:      AR   W#AYKE  L  N DT   EVS SV   A  G #TI L# AND ECV  K RKSRVT KNW RD   P   Q Q     FV #EI   KK#L L
Conservation:  1111111111111111111111111111100001011111111111111112102112121003321421431132252111313303210334304302
SS_PSIPRED:                        HHHHHHH                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:                        HHHHHHH                                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_PSSPRED:                         HHHHHH                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                                            LQELVKLFKER                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWLFFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDL 700
gnomAD_SAV:     S R  LK TS I LT  Q A KQQ W#IF *   YC *       N  L #  RC   V  MMVV     G FSMC   LN  L S R     N* RNF
Conservation:  1111011110100110110111220011001112100111012420434313511551762243253465274263512744312021127322823372
STMI:                                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                                                  EE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                         HHH                      EE      HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                         HHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IYFLDITVFQTRLQFVRGGDIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLESILSKAYVYRVIRTTAYLLY 800
PathogenicSAV:                                                              C           K                          
BenignSAV:                                   K             I                                                       
gnomAD_SAV:    #CL   I LHIC R L AR  TM EN T*S   R C#  T   GI     IC  DS K F #  HR  CLD LK   H     N S##  A    T F  
Conservation:  3741623335263452338434133023203611503521632433736454214432436936833610383686345642525565574367526755
STMI:          MMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                     MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH     HH   EEE  HHHHHHHHHH   HHHHHHHH    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    EEEEE  E E  HHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  EEEE  EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDST 900
PathogenicSAV:             L                  C                                                                    
gnomAD_SAV:                L  R IS  # L   M SICV#S*H TA SVV VRR L LR  SD I  QP S MDI     KSR TKNAARTTNVV#   C# IN M
Conservation:  2572646365226232753361755462831644775465558645655539153444289327762856345334455657566755233274135714
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH        E      HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH      EEE     HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMY 1000
PathogenicSAV:                                                                                             V       
BenignSAV:               R                                        M        #                                       
gnomAD_SAV:    M HL   R# RFA  HL  * K    LHVL  D    A # A  Q H V VM * VI   VRS CY W I   R ES C   F  I#HE#  E FSL   
Conservation:  4198216274104728752862877157659552144126813544455453541333462776345155436563475845569486753455696986
STMI:                                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHHHH HHH    HHHHHHHHHH   EEE    EEE    HH EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH H      HHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHH          HHHHHHHHH  E EEE    EEE       EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHEE     EEE     H HEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                                            MIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMY

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILP 1100
gnomAD_SAV:    L R EPLH# VS  R    MM Q  YL   L WPV#E R P#MDSM VRR A #L   EM Q     R  D HN  WT   S  S     R G NL    
Conservation:  7673937465683331255545436486674899622785596648373874475485754614752589263448247561431112221112100221
SS_PSIPRED:    EEE  EEEEEE     EEEEEE     EEEEE              EEE   EEEEEEHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH      
SS_SPIDER3:    EEE EEEEEEE     EEEEEE    EEEEEEEEE        E  EEE EEEEEEEEHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    EEE  EEEEEE     EEEEEE    EEEEEEE            EEEE   EEEEE HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                         DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                DDDD      
DO_IUPRED2A:                                                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
NP_BIND:       IIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILP
BINDING:                                    E           R                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELAALEAAAKQQELVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSP 1200
BenignSAV:                                                                                L         S              
gnomAD_SAV:    LWEVISE   G FVL   L       S #   Q #P  VVT K# E   *       *  ITE KS G#RERYM L   T#EA TSW  L SA C QIY 
Conservation:  1211433232322112111211111110312331101111111111111111111111111111111111111111100011120011111111000000
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                          
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                          
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
NP_BIND:       PRAGTPKLF                                                                                           

                       10        20        30        40        50 
AA:            PPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKAE 1251
gnomAD_SAV:       YF  L V K    QRK RTLM Y IL#QG  G* VP N LQ TD N *
Conservation:  101000010110011110000210101010100110121111101010111
SS_PSIPRED:                          EEEEEE         EEEE  HHHHHH  
SS_SPIDER3:                         EEEEEE        EEEEEE    H     
SS_PSSPRED:                          EEEEE        EEEE    HHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                         DDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD