Q14123  PDE1C_HUMAN

Gene name: PDE1C   Description: Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C

Length: 709    GTS: 1.41e-06   GTS percentile: 0.407     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 335      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPS 100
gnomAD_SAV:        ATD DKL  S      L P      #  W G    M    W   Q ID#E T AAE  QI  NT AM # M T  KG P     D       S   
Conservation:  1111111111111111111112111111111111110011113450252343122322033523331343343335244252245246472343362582
SS_PSIPRED:            HH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH         H
SS_SPIDER3:         HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH   HHHH           
SS_PSSPRED:           HHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH         H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              DDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                   DDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFIFYELLTRYDLIS 200
gnomAD_SAV:      #        Q I V V   N  TQ    I#T         I  W  DI   R  TS    F  LE    NI      GR   M CV C    H  V  
Conservation:  4844776278644211113424555355564454445554463555443233425521520256147172677828414523547444435543452523
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HH             HHHHHHHHHH                    HHHHHHHH         HHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH                    HHHHHH                     HHHHHHHH        HHHHHHH     HHHHHHHHHHH  HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH        HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                 
DO_SPOTD:                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                   
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH 300
PathogenicSAV:                                                            S                                        
gnomAD_SAV:    H M H  V     D      #       D # TVN  R      S I  V   M M L SV V    R CK  R  T V N  W    L    G   #Y 
Conservation:  4655622152152236519624425466532653554553623353674453544754572344437776465635525432558317447886766866
SS_PSIPRED:    H    HHHHHHHHHHHHH HHH        HHHHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHH           HHH    HHHHH      HHHH
SS_SPIDER3:    H    HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHH   HH    HHHHHHHHHHHH            EEE    HHHHH       H H
SS_PSSPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH           EEE     HHHEH      HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                D                      
METAL:                                        H                                   HD                               
ACT_SITE:                                 H                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFR 400
gnomAD_SAV:        T C       V   #   N#    L#   ND     GTC D  RM     S * LQV   SE       A G    T T    #H       K  I
Conservation:  7575463564314339561674354525362555345546474365254414621533222236243344455466545746070472347024656533
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HH HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH        EE   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH      E     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                           D                                           
METAL:                                                                                    D                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKRSGVKTSGSEGSAPINNSVIS 500
gnomAD_SAV:    *D S  DR   S   S Q  AV   PRA      M  P A  M  IK  M#   N    AS IR  HL   N  L  T Q R  I S   N       V 
Conservation:  5655833668348789884463584685676556538453563533543316322412121022010151111111310212021002121010101312
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHH                    
SS_SPIDER3:     HHHHHH               HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH                 HH                      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH               HHHHHHHHHHEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHH                     
DO_DISOPRED3:                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGE 600
BenignSAV:                                                                                L                        
gnomAD_SAV:    IES G   A M    VSWD CK E  E G  RQ T   P#R TG     T T N TK  VC# #   M   SE  LS  WT   EKACA  A  KT    
Conservation:  2521255024211401641255211112111110101111001010001010010000100000000010101111111100000111111110000000
SS_PSIPRED:      HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                           
SS_SPIDER3:             HHHHHHH HHHHH H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                               
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                              
DO_DISOPRED3:                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QQQNGDFKDGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDGTKQRSHGSPAPSTSSTCRLTLPVIKPPLRHFKRPAYASSSYAPSVSKKTDEHPARYKMLDQRIKMKKIQ 700
BenignSAV:                                       H                        H                                        
gnomAD_SAV:     P S NV      R    YPSVR    NINA  RHFYSLLVR    M H M L #MTS HN  HL *  T  TT      EV ATS* TMN* M   R  
Conservation:  0011101111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                               EE                              HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                               EE                       HH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                              HHH                      HHHHH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       1
AA:            NISHNWNRK 709
gnomAD_SAV:     T RH    
Conservation:  111111111
SS_PSIPRED:    HHHHH    
SS_SPIDER3:    HHH      
SS_PSSPRED:    HHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD