Q14444  CAPR1_HUMAN

Gene name: CAPRIN1   Description: Caprin-1

Length: 709    GTS: 5.822e-07   GTS percentile: 0.066     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 303      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPSATSHSGSGSKSSGPPPPSGSSGSEAAAGAGAAAPASQHPATGTGAVQTEAMKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQ 100
gnomAD_SAV:    I W  INR NDR  FRTLLL  F A    # SV #VL#C*QSTAV  #LRS  V                  V      Q  I      K      C   
Conservation:  5213201100120110212222222222221111222010112222200113232222123444232412014687963272158618846676872947
SS_PSIPRED:                                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
MODRES_P:               S                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVLELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMS 200
gnomAD_SAV:       #            K         M R V        # K  H    RK   I     VED W   R D#S L # PKQD       C R    QYI 
Conservation:  9413757956685625236437499427833995993678265568525694854743656513816634201212353423611594769862855514
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                DDDDDDD DD                                                             
MODRES_P:                    S                                                                                     
MODRES_M:                                                                      R                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRLNEQYEHASIHLWDLLEGKEKPVCGTTYKVLKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPAVEDQVPEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFM 300
BenignSAV:                                                                   D                                     
gnomAD_SAV:       S #C YT V Q V       LI       I AVA C  R T   G RSRK  Q GD     T    HE          QCP P   G A F DK #I
Conservation:  2562476535628433875555626577466085525534615378632113488271132101211233111334111252335221472477475773
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH                 HHHHH                 HH                  
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH                 H                                  H      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH                HHHHH                                     
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D DD                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AETQFTSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQPQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQN 400
gnomAD_SAV:        L NV N E       MF #L     RS #V S   # Y V A  H VR M  E* #  T RI      M   V  Y S  PNT  I   RV  A  
Conservation:  2622332234541348226264243334632311131028312220323286327464775966677975797965566554335797676786643233
SS_PSIPRED:                    EE                                      HHHHHHHHH                     HHH           
SS_SPIDER3:                                                             HHHHHHH                                    
SS_PSSPRED:                                                              HHHHHHH                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                                                                   QDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFE                   
MODRES_P:                                        S       S                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDMPQLVCPPVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQTTASSSLPAASQPQVFQAGTSKP 500
gnomAD_SAV:    VGI   L  A #           L HS E    FEL R G  I   S     R#AG    E  VE  E  VP  A E IPA F LSTPEA       NRR
Conservation:  3433462634152512222202436537323743464536275344443334322343523623546435555246534135455224442555433543
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRS 600
BenignSAV:                                                                                            H            
gnomAD_SAV:    SQNT             M   # V L    K     #  H E          H      K  R E H    N        R   D #  LS H P  AH 
Conservation:  3436979999999994979645758596236172332445652352548325222334244535375456436443454243222222312234359252
SS_PSIPRED:                                    HHHH                           HHH                                  
SS_SPIDER3:                                      HHH                       HHHHHH                                  
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSAPRDYSGYQRDGYQQNFKRGSGQSGPRGAPRGRGGPPRPNRGM 700
BenignSAV:                    H                                                                                    
gnomAD_SAV:    S HC S               I  H#A# S     C C C  LC   S A I      S#   A  G   L    *    G AW   * C  A   D   
Conservation:  2645753844494646535623766874465965646433336233332361425422365543465596665689544648365257743321221343
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                          E                                                             
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:                               R      R      R                                                         R  

                       1
AA:            PQMNTQQVN 709
gnomAD_SAV:    LR   R   
Conservation:  224213221
SS_PSIPRED:             
SS_SPIDER3:        H    
SS_PSSPRED:             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD