Q14746  COG2_HUMAN

Gene name: COG2   Description: Conserved oligomeric Golgi complex subunit 2

Length: 738    GTS: 1.842e-06   GTS percentile: 0.596     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 356      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEKSRMNLPKGPDTLCFDKDEFMKEDFDVDHFVSDCRKRVQLEELRDDLELYYKLLKTAMVELINKDYADFVNLSTNLVGMDKALNQLSVPLGQLREEVL 100
BenignSAV:                                                                             S                           
gnomAD_SAV:    I#I#G  VL ELN#VY #E  LV D  NINY M     Q H     G   H C    P V KP SEY  G FS    VA TG VF H  ML         
Conservation:  2100020110111011111212122364662665565438345365346737546855655565567677976765697779757679669997657766
SS_PSIPRED:                      HHHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                      HHHH      HHHHHHH  H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      HHH       HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLRSSVSEGIRAVDERMSKQEDIRKKKMCVLRLIQVIRSVEKIEKILNSQSSKETSALEASSPLLTGQILERIATEFNQLQFHAVQSKGMPLLDKVRPRI 200
BenignSAV:                                      M                                                                  
gnomAD_SAV:    R  # AT   W    *   H    E  TSE   M   W  K T    H PG      Q VG R    *V   S         Y     #T   E   LCL
Conservation:  5964553456367533426359553984594363386385666667735733341223612545369549995769999978977999956967367987
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                    DDDDDDDDDDD                                       
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDD                                       
DO_IUPRED2A:                                                            D                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGITAMLQQSLEGLLLEGLQTSDVDIIRHCLRTYATIDKTRDAEALVGQVLVKPYIDEVIIEQFVESHPNGLQVMYNKLLEFVPHHCRLLREVTGGAISS 300
BenignSAV:                                                                                            H            
gnomAD_SAV:         V      SF   V  MPN#N  Q W WI TMV   QES  F   A A Q # KL   H F T  SV * I S    VFT R CR Q  P DTVP 
Conservation:  6688659959986895586644552575699699888998699949696679985436851521426142484148178949594995895599574246
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHH HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKGNTVPGYDFLVNSVWPQIVQGLEEKLPSLFNPGNPDAFHEKYTISMDFVRRLERQCGSQASVKRLRAHPAYHSFNKKWNLPVYFQIRFREIAGSLEAA 400
BenignSAV:        K                                                                                                
gnomAD_SAV:       KAI  C          M  V   R  L# DR   NP   T SVNVH  G   Q RR  P I   GV LT  # SR     I   K     V    V 
Conservation:  5632379999938896885443658344226666958618446932743964267499679977597529446147247979567677966858527825
SS_PSIPRED:            HHHHHH HHHHHHHHHHHH  HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            EEEEEHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH  HHHHHHHHH    HHEHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LTDVLEDAPAESPYCLLASHRTWSSLRRCWSDEMFLPLLVHRLWRLTLQILARYSVFVNELSLRPISNESPKEIKKPLVTGSKEPSITQGNTEDQGSGPS 500
gnomAD_SAV:     KE    T  Q    F T R           G # S  PM#H  I       Q P#  S   FGH   KT    #       Q L T RR    R CDA 
Conservation:  4231624653440539256214704602784313547284776866489445975163164204212021144025131222432412321044241111
SS_PSIPRED:    HHHHH          HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHH                          
SS_SPIDER3:     HH H       HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                       
SS_PSSPRED:    HHH H        HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                      
DO_DISOPRED3:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ETKPVVSISRTQLVYVVADLDKLQEQLPELLEIIKPKLEMIGFKNFSSISAALEDSQSSFSACVPSLSSKIIQDLSDSCFGFLKSALEVPRLYRRTNKEV 600
BenignSAV:              CS                                                                             I           
gnomAD_SAV:     P       C#  MC     GR     L   KVN L   T S RK   V  TV  P#TC A     SNGR     R F  S   IS# I    QI K   
Conservation:  3121212572246424357424443346444334316830465263226346516420363131625315523284445322964657598689888964
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH      
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHH       
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                                                                
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:   DDD                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTTASSYVDSALKPLFQLQSGHKDKLKQAIIQQWLEGTLSESTHKYYETVSDVLNSVKKMEESLKRLKQARKTTPANPVGPSGGMSDDDKIRLQLALDVE 700
PathogenicSAV:                                  G                                                                  
BenignSAV:                                                         I                                               
gnomAD_SAV:     IAVY * N   T      NR   E###T       D     AR     L GI    Q V      P  V    RTSSIS#   V N H        #I 
Conservation:  8326739655764752472223221712132219521453165376369785784686669588889868863222231423483799399869786984
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHH  HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHH   H H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H              HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDD                
DO_IUPRED2A:      D                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            

                       10        20        30        
AA:            YLGEQIQKLGLQASDIKSFSALAELVAAAKDQATAEQP 738
BenignSAV:        K                                  
gnomAD_SAV:    F  K TKN E    N    PT T      ## T   E 
Conservation:  36536632344110232252251454135331201122
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                     DDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                   DDDDDD