Q147U7  SMCO1_HUMAN

Gene name: SMCO1   Description: Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1

Length: 214    GTS: 1.073e-06   GTS percentile: 0.256     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 104      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNNETTTLISLKEAMKRVDHKLQALETQFKELDFTKDNLMQKFEHHSKALASQAAQDEMWTAVRALQLTSMELNILYSYVIEVLICLHTRVLEKLPDLVR 100
BenignSAV:                        Y                                           W                                    
gnomAD_SAV:    L   NI  K      EK EY#F#V AI     HLN    L   *P   D  R    G  RIV W P   *I S  S*I IT  FTG RICA     E MG
Conservation:  6112112200400120644155315123423660223183247303222532512535471434223644392555356526360166435323594731
STMI:                                                                          MMMMMMMMMMMMMMMMM                   
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH 
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                                                               
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLPTLASVLRRKVKNKRVRVVWESILEECGLQEGDITALCTFFIARGNKAEHYTAKVRQMYIRDVTFLITNMVKNQALQDSLLRAVQVIEKGKAVRTPEK 200
gnomAD_SAV:      L SVF   K INS #I #    #  A    G  T      L VCD    #   T  *T L   M     T    T *   R VM #T    V  AA  
Conservation:  2998566765251352253146445720286142531467487444312627312128303215310353246131253136825433354442010212
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH       HH
SS_SPIDER3:        HHHHH HH   HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH   E      
SS_PSSPRED:    H  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH    HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                     DDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10    
AA:            QKSSLEELIPSVKN 214
gnomAD_SAV:         K  TL   I
Conservation:  11222121241242
SS_PSIPRED:    H   HHHH      
SS_SPIDER3:        HHHH      
SS_PSSPRED:        HHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  D DDDDDDD DDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: