Q14973  NTCP_HUMAN

Gene name: SLC10A1   Description: Sodium/bile acid cotransporter

Length: 349    GTS: 4.198e-06   GTS percentile: 0.983     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 285      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSP 100
BenignSAV:                                                                                            T            
gnomAD_SAV:    IQTQ VPVL ILN S   VMC IH  QRI M  #*L TTVL  *  A   SEVD  #  R VVTR V #  I#RMV   S A WV  T   DVF   SLL
Conservation:  1111313212211100100101241332222222423354548635422433043145544345325553468536624461635122234456688556
STMI:                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:               EE         HHHHHH   HHHHHHHH        HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHEEEEE   
SS_PSSPRED:                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD D     D                                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:          N     N                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGNLSNVFSLAMKGDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSV 200
gnomAD_SAV:     #K  S LC  I #NI   V RIN    YV STISHFPFL  S  C A   GT    RNMVP A F TL ITRSI   QWT H#H#L  RRR  L *RRM
Conservation:  6623863345322763577324423522164644646534542433213322266412621462236366336724523372231141537213223223
STMI:          MMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHH     HEHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH HH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH  HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                      N                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL 300
BenignSAV:                           T                                           F                                 
gnomAD_SAV:     IPL#  #I # RVV  LI IFT   F # LTALP## DPF I Y  VQR HS#NT SRR* I*#YFATFK DSSS#LTVTFI S    #  E #KRF P
Conservation:  3323542212610420433404424325563366246522412423212344674575958833852556534532323645547923422382275234
STMI:          MMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   HHH      HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHEEEEEEE     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEE   HHHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        5
AA:            IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA 349
gnomAD_SAV:    T V  SDKE#* AE  P I HR  A KQ   RT E   HNRKA    IV
Conservation:  3225414211211111000000100000001111111111111111111
STMI:          MMM                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH                                        
SS_SPIDER3:    HHHHH            HHHH                 EE         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH          HHH                           
DO_DISOPRED3:                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                    
CARBOHYD:                                         N