Q14C86  GAPD1_HUMAN

Gene name: GAPVD1   Description: GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1

Length: 1478    GTS: 9.955e-07   GTS percentile: 0.220     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 601      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAECCQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFL 100
gnomAD_SAV:        G RI  YQ M  C        F    D V   A Q  CC S  EN       Q  L   D      R Y N     K LG CM  R R   HR   
Conservation:  9453643396469589697727853365285134322561954366534565355448644422349538521530852418464561844643186466
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD                                                              DDDDDDDDDDDDDD  DD                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNCIMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATL 200
gnomAD_SAV:    ##S  S H T # V SE        P  T A     HSSGVIH H  C     Q  M  Q     # GLR      T  VV  # C         F SI 
Conservation:  1365546464834642556222522312312334447845435895147854642944566225556587854646686235446367656686888768
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HEPIMQLLVEDEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVESNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSLRWIVSQMYKTLSCVDRLEVG 300
BenignSAV:                                                                                        M                
gnomAD_SAV:    R       G         R   M K#            SLNS S#E#P TM  S     P A   VRC   T    SRR   ML  I  #  RI M K# 
Conservation:  6267736857872677774165328646165353994367215315431352042259327344961475364599935639556844325222425322
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH         HHHHHHH  HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH     HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH          HHHHHHH  H HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHH      HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH         HHHHHHHH HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH     HH
DO_DISOPRED3:                                 DDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                S                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQLAMTGSEEGDPRTKSSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPLSSVNLLE 400
gnomAD_SAV:    K K T  GV        PA S  H  M  N      T    I A HVF    LS      RQ TNN     E R  V     T  H #       ISI  
Conservation:  6445686886732659687569869977596867448979999776669484512032264401226066583564457824545213746422225352
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH   HHH  HHH          HHH HHHHHHHHHHHHHH        HHH  HHHHH HHHHHHHHHHHH            HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HHHH  HHH  H      HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH   E               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                             D  DDD                                    
MODRES_P:                                                                                               T          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLSRTVVYITYSQLITLVNFMKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPPAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNMLMDLHMDHEG 500
BenignSAV:                                                                 S                                       
gnomAD_SAV:      GK ML   HRRVV  E V  # #      K T    S WT VSL  Q   CGF I L S  H  L    VS N QS    Q   CN#V # RY  Y R
Conservation:  5539765636225610851734240133010342229235532592104333434102422321243242312443232222222333300032204033
SS_PSIPRED:         EEEEEHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH                                            HHHHHHH       
SS_SPIDER3:         EEEEEHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH                                            HHHHHHH       
SS_PSSPRED:         EEEE HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH                                                         
DO_DISOPRED3:                                     D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                  DDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                      DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                               T       S   T                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPDKTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELG 600
gnomAD_SAV:     T  I H MHA        A  S VI  I#          LGR   H        R    E  #V R      AV   R DHF  A    I  A M KH 
Conservation:  0133211202545887665432211268575936681133211021231141121312236446688358449526854575645456674615336315
SS_PSIPRED:      HHHHHH    EEEEEE             HHHHHHHH           HHHH            HHHHHHHH                          
SS_SPIDER3:       HHHHH    EEEEEE             HHHHHHHH                                H              E       E     
SS_PSSPRED:      HHHHHH    EEEEEE             HHHHHH                                                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD  D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                       S  S                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKLRKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGSGSVLLD 700
gnomAD_SAV:      L  N   A  R  DR E         N         V  IE   # AR  G    EIFE    L T   H#  V  VT   V       SA       
Conservation:  3332222226342233243344343446553776641444224134345459779957774976622132543333211124113223312413211344
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH         HH                    HHHHHHHHHHHHHHHH   EE          
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHH       HHHHHH   HHHH            E                  HHHHHHHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSGISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVT 800
gnomAD_SAV:       A P T   T V  I    N   VL    KDC             A  M       CS       MF LI A     T T              #A I
Conservation:  4444333645365467469979975336455667637765443334347432245343545335463345232344444243343333232335445633
SS_PSIPRED:                                HHHHHHHHH                                            HHH                
SS_SPIDER3:                    EEE       HHHHHHHHHHHH                                             H                
SS_PSSPRED:                                   HHHHH                                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                               S   S          S    T   S                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPDMDEITHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAVVRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHVLTPAEMEAFKQRHSYPERLVRS 900
gnomAD_SAV:      H    IND RH  F# P   FV  # N    RK    M GS   H KLLY    LQVP   M#RSK    D S R   SP   T   S       AQ 
Conservation:  4742462133131643544334697546364421241233476757537925799799779531232539351513704130539317997946797765
SS_PSIPRED:       HHH               HHHHHH                                                     HHHHHHH      HHHHH  
SS_SPIDER3:         H               HHHHHH                                                     H   HHH       HHHHH 
SS_PSSPRED:                         HHHHHH                                                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                 S                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSSDIVSSVRRPMSDPSWNRRPGNEERELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRKRFVSAMPKAPIPFRKKEKQE 1000
gnomAD_SAV:        TAC LP  V  LCR WLS S KQDV S VPV G T  S S L YAYL   F  R     R      L  K A    HLI G    S   G    P 
Conservation:  5756435237993979554762215544231001033122113435744799797474704556477575577777997977479799454476977637
SS_PSIPRED:                                                                                HHHHHHHHH            HHH
SS_SPIDER3:                                   HHH                                         HHHHHH HH           HHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                 HHH HH         HHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:       SS    S                                                         S                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSDGAMANYESTGDNHDRDLSSKLLYHSDKEVMGDGESAHDSPRDEALQNISADDL 1100
gnomAD_SAV:     G  E  SN  L   VGLN# FG# V    YV         GS  T V VT C   AYIRN        C  G K#IVVD   R  SL KG R TLVAG 
Conservation:  6433311143110224321221213342556644564444652233464133453322222222222222222221122252133313241444242757
SS_PSIPRED:                              HHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHH                   HHHHHHH      
SS_SPIDER3:    H                      H    HHHHHHHHHHHH                    H  HHH     H              HHHHHHH       
SS_PSSPRED:                            HHHHHHHHHHHHHHHH                                                HHHH        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                        S                          S                                                 S    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PDSASQAAHPQDSAFSYRDAKKKLRLALCSADSVAFPVLTHSTRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCRFDNRTCRKLL 1200
gnomAD_SAV:    S  S     LR   LF   S        RFVG        #  # S R       D    C        N              VH  YS  #   G  Q
Conservation:  6666453435433366779699999799747766547443349699777735375797999997979999999796779977994999447937474777
SS_PSIPRED:       HHH       HHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDD                           DDDDDDDDDDDDD                                                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDDDDD                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLESKEKKIREFIQDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDV 1300
gnomAD_SAV:     L    C E #A V    # Q    S           A WG   TSQ        F  K  G  V    RN R  #T      HA N     C  V  A 
Conservation:  3446477799559579999799999757979779999797997957779979999999755914535972354145755555937447743755457354
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   HHHHHHHHH  H H  HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H
DO_DISOPRED3:                 D            DDDDDDD D  D                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAFYPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRM 1400
gnomAD_SAV:       D       E R  V  CM  W  N T C                     EIM     P   S    Q    S      G  N   N   R   V   
Conservation:  7774999799777745777759977777795997779557757745972774797575757777979955999997995995797999999797777799
SS_PSIPRED:    HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHH      HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        
AA:            CSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEFIKTIDDRK 1478
gnomAD_SAV:         K  N  S  C           L                    SF  S     Y   V    V A       Q 
Conservation:  975999999997757999999979999999976577555977777447734495979799999999979999999797
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH       HHHHHEEEEEHHHH  HHHHHHHHHHHHHH HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH              EEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH H     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH          HHHHHHHHEEEEE  HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                              DD
DO_SPOTD:                                                                                   D
DO_IUPRED2A: