Q15361  TTF1_HUMAN

Gene name: TTF1   Description: Transcription termination factor 1

Length: 905    GTS: 1.232e-06   GTS percentile: 0.324     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 489      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEGESSRFEIHTPVSDKKKKKCSIHKERPQKHSHEIFRDSSLVNEQSQITRRKKRKKDFQHLISSPLKKSRICDETANATSTLKKRKKRRYSALEVDEEA 100
BenignSAV:                                       K                                                                 
gnomAD_SAV:    V A  N    Y     QR  NYCV  KSR*NQ RK   N  V     #  K   G  V R VVYF  ET KV  K   #  A RR    S GP   #K  
Conservation:  6343232221324120744231322352112012204211131151101242575542131213332112210121323211045354340222232222
SS_PSIPRED:                                             HHH           HHHH                         HHH          HHH
SS_SPIDER3:                                       H     H              H H                                    EE   
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
MODRES_P:                                                                      S                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVTVVLVDKENINNTPKHFRKDVDVVCVDMSIEQKLPRKPKTDKFQVLAKSHAHKSEALHSKVREKKNKKHQRKAASWESQRARDTLPQSESHQEESWLS 200
gnomAD_SAV:       #  L  A TS      *E      I TN  H  T  L   #    PE R N   TPY TDW    E  R    #    QT# IRS A  Y Q# S  
Conservation:  2212324445311201211122121323403113121310222200112210101223210233245222112212212121110022123210122124
SS_PSIPRED:      EEEEE HHH              EEE              HHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH                   
SS_SPIDER3:      EEEEE H H             EEE             H HHHHHHH   HHH HH        HHHHHHHHHH H HHH            H     
SS_PSSPRED:      EEEEEE                EEEE                            HH HHHHHHHHHHHHH                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DDDDDDDDDDDDDDDD        D   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGPGGEITELPASAHKNKSKKKKKKSSNREYETLAMPEGSQAGREAGTDMQESQPTVGLDDETPQLLGPTHKKKSKKKKKKKSNHQEFEALAMPEGSQVG 300
BenignSAV:                                                                                              S          
gnomAD_SAV:       ES M V AV TY # Y   E #FN Q   IR V   W    DV   LR F# S     DPS    HA  N*    REEECSY * QSFTITA   ER
Conservation:  0012111121312103152611111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                HHHHHH   HHHH                                           HHHHHHHH        
SS_SPIDER3:                                 HHH                                                    HHHHHHH         
SS_PSSPRED:                                HHH                                                     HHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                             S       T                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEVGADMQESRPAVGLHGETAGIPAPAYKNKSKKKKKKSNHQEFEAVAMPESLESAYPEGSQVGSEVGTVEGSTALKGFKESNSTKKKSKKRKLTSVKRA 400
BenignSAV:       A          L                                             V                                        
gnomAD_SAV:     DA#T I   W TLS     G M  #V*       N   S  * V MG#T   KNTCS VP     A   *    HTA    S    *  *   M   KS
Conservation:  1111111111111111111111111111111133544011122133020421110002321111010221521111010212010333347341122121
SS_PSIPRED:          HH                                 HHHHHH     HH                  HHHH                        
SS_SPIDER3:                                            HHHHHH                                                      
SS_PSSPRED:                                             HHHHH                                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RVSGDDFSVPSKNSESTLFDSVEGDGAMMEEGVKSRPRQKKTQACLASKHVQEAPRLEPANEEHNVETAEDSEIRYLSADSGDADDSDADLGSAVKQLQE 500
BenignSAV:     Q                                                               K       K                           
gnomAD_SAV:    GMPV#     RED  R I G   CN#TI#K  M   SQ#  N  R S RQM QTS    T  QYKA     PKT C P  *   N   V VS  M   *K
Conservation:  1233321421000132210532241121022011111122102312110001110222120221122120111121012213322122474123332945
SS_PSIPRED:                             HHHH         HHHHHHHHH              HHH HH      HHHH          HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                               H           H  HHH                     HH                    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHHHH                          HHHH            HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDD          
MODRES_P:        S                                                                        Y S  S     S             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FIPNIKDRATSTIKRMYRDDLERFKEFKAQGVAIKFGKFSVKENKQLEKNVEDFLALTGIESADKLLYTDRYPEEKSVITNLKRRYSFRLHIGRNIARPW 600
BenignSAV:                                                                          H                              
gnomAD_SAV:      A  E   S   TQLFW N KQ     G#D TV  #RSP QDS   K     C S  DVG T#    MH   DGI   I     CL K  S S V WH 
Conservation:  6493642642246235454873855365248544638765128856743861465558572342386332445432206136942518312554687885
SS_PSIPRED:    H        HHHHHHHHHH HHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH    HHHH HH HHHHHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH      HHHH H HHH  HHHHHH       H
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH       H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                               
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLIYYRAKKMFDVNNYKGRYSEGDTEKLKMYHSLLGNDWKTIGEMVARSSLSVALKFSQISSQRNRGAWSKSETRKLIKAVEEVILKKMSPQELKEVDSK 700
gnomAD_SAV:     FV  #  MI NID       KEG     I  F     * MT    VQ  V MT    H GN* SL   #    WR T   K    RQI   KF  A   
Conservation:  3276597487772345795752472447424424598494795345497445735745853203539395429447945965365643443256255643
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH     H
DO_DISOPRED3:                                                                                          DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                  DDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQENPESCLSIVREKLYKGISWVEVEAKVQTRNWMQCKSKWTEILTKRMTNGRRIYYGMNALRAKVSLIERLYEINVEDTNEIDWEDLASAIGDVPPSYV 800
gnomAD_SAV:    FH  SQN  PV WK  N A    GI  E         Q         K  KSQHL C T V WS F  T  SCD  MD A  V   GP      AA   I
Conservation:  7622621433757436926779646544957966579749854694579538303528335543763897665423634433759637513594475333
SS_PSIPRED:    HHH      HHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    EE     HHHHHHHHHHHHHH     HHH  HHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:    HH    HHHHHHHHHH     HHHHHHH     HHHHHHHHHHHH        E       HHHHHHHHHHHHH     HH   HHHHHHH     HHHH
SS_PSSPRED:    HH        HHHHHHH    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH    HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QTKFSRLKAVYVPFWQKKTFPEIIDYLYETTLPLLKEKLEKMMEKKGTKIQTPAAPKQVFPFRDIFYYEDDSEGEDIEKESEGQAPCMAHACNSSTLGGQ 900
BenignSAV:                                                                                         V               
gnomAD_SAV:    E   F     C  LR Q AL    N    MS    NKR K      R#   ALGTLE   L #G  C  NNN E  V N  KS VLYV NTY  N     
Conservation:  6233354622669465446646664664333582633162312131112432411442255645653132366433022021111111111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH               EEHHHEEE          HHH       HHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH               E EHEE            H        H H     H    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  E EEE                   HHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                DDD                           DDDDDDDDDDD D D          
MODRES_P:                                                                             S                            

                    
AA:            GRWII 905
gnomAD_SAV:     QG F
Conservation:  11111
SS_PSIPRED:         
SS_SPIDER3:         
SS_PSSPRED:      EE 
DO_DISOPRED3:  DDD B
DO_SPOTD:      DDDDD
DO_IUPRED2A: