Q15459  SF3A1_HUMAN

Gene name: SF3A1   Description: Splicing factor 3A subunit 1

Length: 793    GTS: 5.954e-07   GTS percentile: 0.070     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 206      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPAGPVQAVPPPPPVPTEPKQPTEEEASSKEDSAPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSE 100
gnomAD_SAV:             HA  L       #AG A#F  KY                                       Q    S    S  KLS   L   CR  # 
Conservation:  4101110111101111144222101211323524144335676579967979969775974699799769977776776997977759999679599767
SS_PSIPRED:                           HHHH             EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                           HHH H              E   HHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                             EE   HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD      DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D      DDDDDD 
MODRES_A:                                                            K                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQTTQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRP 200
gnomAD_SAV:     N     KL TT    RR       P MT   H    E  MM       L  T       G        M     #  CP     L#   H       # 
Conservation:  7767666775665676667356343777666565675564568657755676575767967779777767656775997799769677976969979769
SS_PSIPRED:    HH            HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HH            HHHHHHHHH H    HHHHH H                        HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHH             HHHHHHHH                                    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD                                                         
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_IUPRED2A:   DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DD        D    D                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLFSKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTT 300
gnomAD_SAV:      N  S  SN   R   #VF  E     PN  S   Q I      *        LK       R                         S H    TS K
Conservation:  7996957976997565566697677507566674655597666479797775997777999797969996777999979979966997739565779776
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE               
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE  HH          
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE               
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDDD                           DDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                  DD      
DO_IUPRED2A:                                                           DDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PEELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDDKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKP 400
gnomAD_SAV:          *   E   G                  NQH  V K#R       LI            R   S S DP I      A        G    V  T
Conservation:  6997766675797776677677999677776643321711325466767765777777797774329596976466677797697799776777979764
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH     HHHHHHHH                      HHH                       EE           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH    H HHHHH    HHHHHHH             HH                                               
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHH                                                EEE           
DO_DISOPRED3:  DDDD   DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD  DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                         S        S                             S                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKV 500
gnomAD_SAV:    F ST   G           T  NRVR  V       #     NLF      G                           G                    
Conservation:  3643233556769999996867778699969697796757776616566746777597747956777799667799976797777777769777976979
SS_PSIPRED:             EEE      EEEHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHH  HHHH       
SS_SPIDER3:             EEE      EE HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH        HHHH       H        
SS_PSSPRED:             EEE         HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH         HHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD                                        D                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                     DD DDDDDDDD DDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                  S                                     S    Y                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEIPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRP 600
gnomAD_SAV:    A         W *              T          V          SS      L   # IH   LT  #   LQ SA           S T     
Conservation:  6999769966677797779776799777779999995776396989967956233446334223223231664223354724365243543453534436
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH                                                                    
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH                                                                    
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH                                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:             S                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRR 700
gnomAD_SAV:     V      S     TA      T    MM     #      P T LV      A# A         VL LRH AH#    #        I  S    VH 
Conservation:  7636633336534445464435546554455442345562545864388547766976554522273662387564579924973968558558556846
SS_PSIPRED:                                                                                                 HHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                                                                 HHHHHH 
SS_PSSPRED:                                                                                                 HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDD   DD D      DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
REGION:                                                                                       PTSKKLKTEDSLMPEEEFLRR

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90   
AA:            NKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAVIHLALKERGGRKK 793
gnomAD_SAV:       SM  E H L   G M    K       P  #     F   T     V V      C       C   S     SD           R   
Conservation:  459564658799777997997959937375456677967597775766565666877554757799668576775139646565666797445
SS_PSIPRED:        EEEEEE              EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE  EE     EEEEEE     EEEEEEE       
SS_SPIDER3:        EEEEEEE            EEEEEEE EHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE  EEEE   EEEEE E    EEEEEE        
SS_PSSPRED:        EEEEEE              EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHEEEE   E      HHHH     EEEEEEEE       
DO_DISOPRED3:                                                                                         DDDDBB
DO_SPOTD:                                                                                              DDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDD DDDD                            D     D                                        D 
REGION:        NK                                                                                           
MODRES_P:                                                                Y