Q15573  TAF1A_HUMAN

Gene name: TAF1A   Description: TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A

Length: 450    GTS: 1.264e-06   GTS percentile: 0.338     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 190      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSDFSEELKGPVTDDEEVETSVLSGAGMHFPWLQTYVETVAIGGKRRKDFAQTTSACLSFIQEALLKHQWQQAAEYMYSYFQTLEDSDSYKRQAAPEIIW 100
BenignSAV:                                                                                                      M  
gnomAD_SAV:     N  NG#   A   V DG  FLPT  EL        I   V     K G  P  N      R   Q  *    VG IHG   IS   G    R  S MM*
Conservation:  1121113301010111001010011012027120011112101100223623422186124556554448326525512716267301100110228246
SS_PSIPRED:       HHHHH         HHHHH        HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH
SS_SPIDER3:        HHHH         HE            HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHH          EEE         HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH       HHHH  HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                                                            
DO_IUPRED2A:        DD DDDD  DD  D                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLGSEILFYHPKSNMESFNTFANRMKNIGVMNYLKISLQHALYLLHHGMLKDAKRNLSEAETWRHGENTSSREILINLIQAYKGLLQYYTWSEKKMELSK 200
gnomAD_SAV:      R    C  L  KTD   I   WL   DF #   TP *Y   #    V   V     A  A  RS  M FQ   V  TRSC  P   FI T R VQF  
Conservation:  6454566244622223224151434842642155447766355954361234923172054488474152150011266456344646118014401222
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                               DDD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDKDDYAYNAVAQDVFNHSWKTSANISALIKIPGVWDPFVKSYVEMLEFYGDRDGAQEVLTNYAYDEKFPSNPNAHIYLYNFLKRQKAPRSKLISVLKIL 300
gnomAD_SAV:     GT   S SS DRVM SN LN  VD   SF    DGN V   C  L   CV *  SR   PD    *        L C HSSVR   T T   VG  M F
Conservation:  1202210112113341223435323612443187577275335646764433223623492389672257489873374724455222512244346427
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YQIVPSHKLMLEFHTLLRKSEKEEHRKLGLEVLFGVLDFAGCTKNITAWKYLAKYLKNILMGNHLAWVQEEWNSRKNWWPGFHFSYFWAKSDWKEDTALA 400
gnomAD_SAV:       I         P    E    GLC   V L C     VR# M  #   SF      T      V I#DK       C   Y  C R  N      T S
Conservation:  3036658245346304822632123133462635237552463142259127112421321122002402261083358504764032411631221152
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH     HHH   HHHH   HHH HHHH
SS_SPIDER3:    HH     HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH        H HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHH      HHHH
SS_PSSPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE         HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50
AA:            CEKAFVAGLLLGKGCRYFRYILKQDHQILGKKIKRMKRSVKKYSIVNPRL 450
BenignSAV:                                       Q               
gnomAD_SAV:    S           E    CQ    *          W R# M  CG  YL  
Conservation:  02631422342521125110111110100011030222122213121211
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH      HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                         DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: