Q15645  PCH2_HUMAN

Gene name: TRIP13   Description: Pachytene checkpoint protein 2 homolog

Length: 432    GTS: 8.854e-07   GTS percentile: 0.174     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 141      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDEAVGDLKQALPCVAESPTVHVEVHQRGSSTAKKEDINLSVRKLLNRHNIVFGDYTWTEFDEPFLTRNVQSVSIIDTELKVKDSQPIDLSACTVALHIF 100
BenignSAV:                                                                                                 R       
gnomAD_SAV:     V  L     G S  V   A  G  R     I E  N #R I    S Q  M    A A  H     G     FV      I Y # V#  ER      Y
Conservation:  5312112111111000110042434222143453136652371278277345573526278861590365276455723222423346482122514558
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHH        EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH  EEEEEE          EEHHH  EEEEEE
SS_SPIDER3:      HHH  HHH         EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHH   EEE      H  HHHH  EEEEEEE           EEHHH E EEEEE
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH HH     EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHH  EEEEEE            HHH  EE EEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:                         D DDDDD                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLNEDGPSSENLEEETENIIAANHWVLPAAEFHGLWDSLVYDVEVKSHLLDYVMTTLLFSDKNVNSNLITWNRVVLLHGPPGTGKTSLCKALAQKLTIRL 200
gnomAD_SAV:      S   H     QK R D   E #R                E     L  N  VAAS    NDI     I SW    Y  T    PT             
Conservation:  3755556325364563636455638488546766696896671359438747526644665548644555686648649999999779977777996776
SS_PSIPRED:    E                HHHHHHEEE   HHH   HHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  HH           EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                   HHHHHHHHEH    HHHHHHHH H   HHHHHHHHHHHHHHHH               EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHH    HHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:          D  DDDD                                                                                      
NP_BIND:                                                                                     GPPGTGKT              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSRYRYGQLIEINSHSLFSKWFSESGKLVTKMFQKIQDLIDDKDALVFVLIDEVESLTAARNACRAGTEPSDAIRVVNAVLTQIDQIKRHSNVVILTTSN 300
BenignSAV:         Q                                                                                               
gnomAD_SAV:    L   QCS        RV                R   NFL VE G   M V        T DS  V                H      P   M      
Conservation:  5298146976979777988589966686656565444346454336765868776854854353446468569688966786869366544465554556
SS_PSIPRED:    H     EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE   
SS_SPIDER3:          EEEEEEE H HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH  H    EEEEE   
SS_PSSPRED:           EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITEKIDVAFVDRADIKQYIGPPSAAAIFKIYLSCLEELMKCQIIYPRQQLLTLRELEMIGFIENNVSKLSLLLNDISRKSEGLSGRVLRKLPFLAHALYV 400
gnomAD_SAV:    V KR  M              L  TDV  V    W       LV SH    A Q  K    VK  M E   F S  A R K  GSW    P I       
Conservation:  4454562544464866667667411344254357548766444658565755438844547134366348608327726839789939988998867564
SS_PSIPRED:     HHH  HHHHHH   EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH  HHHHHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:      HH  HHHHH    EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH      H H   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH      HHH    HHHHHH  
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH  HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30  
AA:            QAPTVTIEGFLQALSLAVDKQFEERKKLAAYI 432
BenignSAV:                                    V
gnomAD_SAV:    H   IPTDE  R  F     *  D   FVT V
Conservation:  53723342175145224733735441151111
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                           DDDDDDD
DO_SPOTD:                              DDDDDDDD
DO_IUPRED2A: