Q16099  GRIK4_HUMAN

Gene name: GRIK4   Description: Glutamate receptor ionotropic, kainate 4

Length: 956    GTS: 2.143e-06   GTS percentile: 0.703     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 441      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPRVSAPLVLLPAWLVMVACSPHSLRIAAILDDPMECSRGERLSITLAKNRINRAPERLGKAKVEVDIFELLRDSEYETAETMCQILPKGVVAVLGPSSS 100
BenignSAV:                           Q                                                                             
gnomAD_SAV:     SCIWVLF    VG M  V  TQY   T    N  D G VV#     #  H IHT    STT  KM  LQ     KHK TQ  Y  VS RLI I   L  
Conservation:  4201111211111110001021122422336634318456647545546324631252111445664553643654856564234423474344544322
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHH   EEEEE     
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH  EEEEEEEEEEE   HHHHHHHHHHH    EEEEE     
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHH   EEEEE     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PASSSIISNICGEKEVPHFKVAPEEFVKFQFQRFTTLNLHPSNTDISVAVAGILNFFNCTTACLICAKAECLLNLEKLLRQFLISKDTLSVRMLDDTRDP 200
BenignSAV:                                                                       G                                 
gnomAD_SAV:    S    V          S      QV I        # S Q #I   IM I R  KYL  I TG # V E  F       W V V   M  F#K GY QNH
Conservation:  5322333343433234433444454234433365434253554333524421352243243444454143665466384435656553855866623246
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH     EEEE  HHHHH      EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE HHHHH HHHHHHHH     EEEEEE       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     EEEE   HHHHH     EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH      EEEEE      H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH      EEE      HHH     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE      H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                               N                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPLLKEIRDDKTATIIIHANASMSHTILLKAAELGMVSAYYTYIFTNLEFSLQRMDSLVDDRVNILGFSIFNQSHAFFQEFAQSLNQSWQENCDHVPFTG 300
BenignSAV:                                                                     V                                   
gnomAD_SAV:     L   D W#N  TAV V  #TCV  I #   VK             D  LLF   NN   YCASV  S V    RS  R  T       R K EPL  S 
Conservation:  3654754554432334333433261154144235662433646545344544434622223256646884481483352463167527838381223525
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE   HHH  HHHH      EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    EEEEEEE HHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   H     HHHE   E EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:    HHHHHHH     EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE                 EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                         N                                                   N             N              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PALSSALLFDAVYAVVTAVQELNRSQEIGVKPLSCGSAQIWQHGTSLMNYLRMVELEGLTGHIEFNSKGQRSNYALKILQFTRNGFRQIGQWHVAEGLSM 400
gnomAD_SAV:    LV        VFC    EMR   QGR  SM   FGS GH *  SN FIS  # #Q     S    T      S T    P A  DSW V  *LM DS  R
Conservation:  3424433444435443274454443532743374424525436656855454465345456445655673624645364321203235582844225737
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH       EEEEE        EEEEEEEEE   EEEEEEEE    EE 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH      EEEEEE     EE  EEEEEEEE    EEEEEEE    E E
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHH      EEEEE         EEEEEEE     EEEEEE        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                            N                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DSHLYASNISDTLFNTTLVVTTILENPYLMLKGNHQEMEGNDRYEGFCVDMLKELAEILRFNYKIRLVGDGVYGVPEANGTWTGMVGELIARKADLAVAG 500
gnomAD_SAV:     NR    KTLGS   I V I      L     R         C    S    E      *  H  C     M  I K  S    VIR  LT      M A
Conservation:  3111121424235264563566659699685503643315446759996789395723956362639638645544424566464374841844665384
SS_PSIPRED:      HH            EEEEEEE    EEEE           HH   HHHHHHHHHHHH  EEEEEE                 HHHHHHH    EEEE 
SS_SPIDER3:                    EEEEEE     EEEEE           H HHHHHHHHHHHHH   E EEEEE       E     E   HHHHHHH HHHEE  
SS_PSSPRED:                   EEEEEEEE    EEEE               HHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE                 HHHHHHHHHHHHHE 
DO_DISOPRED3:       D                                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:             N      N                                                               N                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LTITAEREKVIDFSKPFMTLGISILYRVHMGRKPGYFSFLDPFSPGVWLFMLLAYLAVSCVLFLVARLTPYEWYSPHPCAQGRCNLLVNQYSLGNSLWFP 600
BenignSAV:                                I                                                                        
gnomAD_SAV:      T   W          TI       CI R P  S#   P   FL I    IVVF  INS     V  M        S #  L  PP        G   L
Conservation:  5455656634444378443544544342224646565698566775667655958634555586365879899846367234322375989798997999
STMI:                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  
SS_PSIPRED:    EEEEEEHHH       HHH  EEEEEE          HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH                   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEEEEH        HE EEEEEEE         HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH              E     H  HHHH
SS_PSSPRED:    EEEEEHHHH            EEEEEE                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      EE  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                              DDD  DDD                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGGFMQQGSTIAPRALSTRCVSGVWWAFTLIIISSYTANLAAFLTVQRMDVPIESVDDLADQTAIEYGTIHGGSSMTFFQNSRYQTYQRMWNYMYSKQPS 700
PathogenicSAV:                   H                                                                                 
gnomAD_SAV:     #  V  V     HSI  C  N I* V MP#     M        M #  M V       NR TTD  I  R   T   R  H  S  HI         R
Conservation:  7998899966739499899977666955676766757776797976679759636557999995959997567967697544464655566656235355
STMI:                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                        
SS_PSIPRED:    HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHH    EEEEE   HHHHHHH    HHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH     EEEEEE  HHHHHHH    HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH    EE      HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFVKSTEEGIARVLNSNYAFLLESTMNEYYRQRNCNLTQIGGLLDTKGYGIGMPVGSVFRDEFDLAILQLQENNRLEILKRKWWEGGKCPKEEDHRAKGL 800
gnomAD_SAV:      MN     VT L   S T  Q   I K CQ Q   I HM S  N  SC V   FD FLQ KL   VI*  K  H  #  C      R SR  Y      
Conservation:  7685766677476468576667799977977355999966966997999979773552664644455535273437546564652633844436344354
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHH     EEEEHHHHHHHHH     EEE                 HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHH   EEEEEE HHHHHHH      EEE        EEEE     HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH        H  H     
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHH   EEEHHHHHHHHHHHH   EEE                  HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:                                                                                            DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                DDDD   
CARBOHYD:                                         N                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GMENIGGIFVVLICGLIVAIFMAMLEFLWTLRHSEATEVSVCQEMVTELRSIILCQDSIHPRRRRAAVPPPRPPIPEERRPRGTATLSNGKLCGAGEPDQ 900
BenignSAV:                            T                                                                            
gnomAD_SAV:       T D  C     A ML T V TW#              I *  M    NVT   N  PLC W#   LLSLH V K LQQQ MV   SR      K   
Conservation:  6443363334554766336454524442612425112212231221211001211122201110011002222112110211111112131212210022
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                           
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH                                            H
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H       HHHHHHHHHHHHHH                                             H
SS_PSSPRED:       EE EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH                                              
DO_DISOPRED3:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_IUPRED2A:                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD         

                       10        20        30        40        50      
AA:            LAQRLAQEAALVARGCTHIRVCPECRRFQGLRARPSPARSEESLEWEKTTNSSEPE 956
gnomAD_SAV:     T          S         #Q  H      GL  V I  N  *  IA GCK D
Conservation:  22102111210120120103111122101201220110001010111101011111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH     EEE                                    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH       EEE  HHH                    HEE        
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHH     EEE                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      D                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD