Q16572  VACHT_HUMAN

Gene name: SLC18A3   Description: Vesicular acetylcholine transporter

Length: 532    GTS: 1.554e-06   GTS percentile: 0.472     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 312      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDYIAHMRGGGEGPTRTPEVWEPTLPLPTPANASAYTANTSAS 100
BenignSAV:               Q P               W                                                                       
gnomAD_SAV:          TR  Q PV N   # S#  PK#GW KGVM #   LE  M S  H AML V  E V   G#DV##     DMC LI  R P   DGT K  # G 
Conservation:  0100011000001000011113413558261365117612324442123301520241161112014619221121563111122242211175125266
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH                                     
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHE EE E  HHHHHH                            EE      
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH                           E        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                D                                   DDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                         DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD       DDDD                                        DDD  DDDDDDDDDDDDD      D   D       
CARBOHYD:                                                                                              N      N    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMI 200
PathogenicSAV:                                                                                      A             N
gnomAD_SAV:    L  #R VRLT GS# LA           S RV     #S      V L GC#       D L      L LV  C K  G  GR   #L  S   S#SI 
Conservation:  4435514221111162130030115254355112053202555111815110045465331677111644231311243115862451215011285053
STMI:                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                         HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              E         HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                           EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            DD                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ADKYPEEPERSRALGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTT 300
gnomAD_SAV:     G  #GGRQP #V  LSQ    LRIPGSR L D  F*LSVEHL L       P  V W MP   SS E  PSP D S D A R  V E C  M  D  SA
Conservation:  2411225234412462434258111166120110331010201313566588879844656661572383233643367332313142123211132121
STMI:          MMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH       HHHHH  HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHHHHH        HHHHH  HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                        DD DDDDD DD                   
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDDD                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDTA 400
PathogenicSAV:                                                                                                  H  
gnomAD_SAV:         SL   IV KGLN K#       SV     #M  L    VSLP  V   PV   FCSV     S N GTM T        GL YV    TV  ER 
Conservation:  4217358116233425300410631241111112123145530300057512360244734456544412101434242552521111111621754425
STMI:          MMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLLDEPPQGLYDAVRLR 500
BenignSAV:                              V                                                                          
gnomAD_SAV:         VS   ##     D   GM  F      G  A L     Q    K       #SS FCG I    LSMS  K  #  #VAMPNK L    GV SP 
Conservation:  3335107312320341025118435202411111114419244755574125001228247262451231241638742422334343472132324324
STMI:          MMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH  HH          EE  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHH H           EEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH           H H 
DO_DISOPRED3:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30  
AA:            ERPVSGQDGEPRSPPGPFDACEDDYNYYYTRS 532
BenignSAV:                        E            
gnomAD_SAV:     G L   #S*SC L   L E K Y    H SN
Conservation:  53521214132344311112312322003310
SS_PSIPRED:                                    
SS_SPIDER3:                                    
SS_PSSPRED:                               EEE  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDDDDDDDDD