Q16665  HIF1A_HUMAN

Gene name: HIF1A   Description: Hypoxia-inducible factor 1-alpha

Length: 826    GTS: 5.778e-07   GTS percentile: 0.065     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 319      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFV 100
gnomAD_SAV:      S D   #    IFAC      N   YW    Y   H        T  L L       I  A#  FH  Q MHV   G  E R #             I
Conservation:  1111111001111445496465555554553455454445423583334444367554559545646433454221100011313023522546764984
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH   EE
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH HHHHH   EE
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH  EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D        DDDD   DDDD                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
REGION:                            KSRDAARSRR                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHV 200
gnomAD_SAV:       SG   VV T      HT                  R     T T  NT    R     KI#Q            Q                   L I
Conservation:  3656259656646655343565355663934556649998679546382171310561550222448759886666448656646654989969485434
SS_PSIPRED:    EEEE    EEEEE  HHHH    HHH      HH   HH HHHHHHHH                 EEEEEEEE               EEEEEEEEEEEE
SS_SPIDER3:    EEEE    EEEEEHHHHHHH                    HHHHHHHH                EEEEEEEEE       EE      EEEEEEEEEEEE
SS_PSSPRED:    EEEE    EEEEE   HHH                    HHHHHHHHHH                  EEEEEE               EEEEEEEEEEEE
DO_DISOPRED3:                                    DDDDDDDDDD DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:                                                          DDDDDDDDD                                       
DO_IUPRED2A:                                                    DDDDDDD                                            
REGION:                                                                             RMKCTLTSRGRTMNIKSATWKV         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQV 300
gnomAD_SAV:      I G H  #       N        M Y                  VA R        #K #V        HP           Y   I# H      I
Conservation:  1110110111313341235444483762686446263645456666466646449544522749615456444857456666946243647535648884
SS_PSIPRED:                     EEEEEEEE               EEEEE     EEEEE HHHHHHH   HHHH      EEE  HHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    E               EEEEEEEEEE              EEEEE     EEEEE H HHHHH   HHHH   E EEEE  H HHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:                     EEEEEEEE                EEEE     EEEE HHHHHHHH    HHH    HHHH     HHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:       DDDDDDDDDD                                                                                     
DO_SPOTD:          DDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                    S                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLL 400
BenignSAV:                                                     N                                                   
gnomAD_SAV:      RH     R      I    S  C  Q  P * T     #     R N     H   R    I*     IA   I G          R           
Conservation:  3746696947188759458467658737676655646585679364312355852943113310211111211121100001010542257236537337
SS_PSIPRED:        EEEE     EEEEEEEEEEEE       EEEEEEEEEEE      EEEEHHHH             HHH          HHHHHHHH   HHHH  
SS_SPIDER3:      EEEEEE     EEEEEEEEEEEE        EEEEEEEEEE          HHHH           HHHHHH        HHHHHHHHH   HH    
SS_PSSPRED:         EEE     EEEEEEEEEEEE        EEEEEEEEE           HHH                             HHHH     HHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                     DDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                          DD D          D D            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQTPS 500
BenignSAV:                      I   Y                                                                              
gnomAD_SAV:       T  I V    S  NIQ  Y H   GRS  G#   #SSG V TR  T FS  ST  L   Q NG   VS  AS  S S  Q  # T  #S      R 
Conservation:  5845792452766311111111303341313221223422113102011111133111211111111111111111111113211111432230111212
SS_PSIPRED:           EEE                             HHHH                        HHHHHHHHH      HHHHHH            
SS_SPIDER3:            E                                                          HHHHHHHH                         
SS_PSSPRED:          EEEE                                                         HHHHHHH                          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVT 600
BenignSAV:                                                                                      S     T            
gnomAD_SAV:    L N NIT     SD   D YI LEG##     S          RK   SL  E       I            FHALNH  S  R CT    P  H PIK
Conservation:  2312213233425144145412232421111445348446524332322231312246865689797966986923323331111111011111111222
SS_PSIPRED:                   HHHH     HHHHHH  HHHHHHHHH                 HHHH              HHH                     
SS_SPIDER3:                    HHH        HHH  HHHHHHHH                H HHH                                       
SS_PSSPRED:                                   HHHHHHHHH                 HHHHH                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                                                               DLDLEMLAPYIPMDDDF                            
MODRES_P:                                                        S   T                    S            S           
MODRES_A:                                     K                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFQQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIASPSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTT 700
gnomAD_SAV:    E     M      VN   T P  F  M   CI   N  TP  A# QTY#G IT    #N  S* W  L  G  N IM E#  P RGN TM  IT  R AI
Conservation:  2643121111211021101112311110111111101110001111101120111113312113221361211211121001001102111010211311
SS_PSIPRED:                         HHHH                                                                 HHHHHH    
SS_SPIDER3:                         HHHH   H HHHH                                                          HHHH    
SS_PSSPRED:                                      HHH                                                       HHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                              S                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VPEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDC 800
BenignSAV:                                                                                                    A    
gnomAD_SAV:       V     #IG #STH    # Y# LF  VI LEP    LNER  A   FR H    QY#        AV  MSF   Y      IEV    #  N   
Conservation:  0012123321222142369733322113022121111111011011101113542602101111121233122212433336521424111563883488
SS_PSIPRED:           HHHHHH HHHH  HH     HHHH                    HHHH               EE   HHHHHHHH          HHHHHEE
SS_SPIDER3:       H   HHHHHH HHHHHH                               HHHH                    H HHHHHH            H   E
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHH        HHHHH                   HHHH                    HHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDD      DD    DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D D                         D     
MOTIF:                          RKRK                                                                               
MODRES_A:              K                                                                                           

                       10        20      
AA:            EVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN 826
gnomAD_SAV:     GK  #K N       K   D    Y
Conservation:  76948413320765835542586522
SS_PSIPRED:    EE            HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EEE           HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD
DO_SPOTD:                                
DO_IUPRED2A: