Q16799  RTN1_HUMAN

Gene name: RTN1   Description: Reticulon-1

Length: 776    GTS: 6.387e-07   GTS percentile: 0.083     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 373      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAPGDPQDELLPLAGPGSQWLRHRGEGENEAVTPKGATPAPQAGEPSPGLGARAREAASREAGSGPARQSPVAMETASTGVAGVSSAMDHTFSTTSKDG 100
gnomAD_SAV:     P          L  #S   R  #  V K     L       P A L L F    G    W  R           A    D TD  C RE  S     GE
Conservation:  6111111111111121111122222031020111111111111111110211001111101101111212224223434341202221021131212112
SS_PSIPRED:           HH                                           HHHHHHHH                                        
SS_SPIDER3:            H                                           HHHHHHH                                         
SS_PSSPRED:                                                          HHHHH                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGSCYTSLISDICYPPQEDSTYFTGILQKENGHVTISESPEELGTPGPSLPDVPGIESRGLFSSDSGIEMTPAESTEVNKILADPLDQMKAEAYKYIDIT 200
BenignSAV:                            A                                                                            
gnomAD_SAV:    A W H  P      A   EA   A   RNK V#I V     KP AAS    #LR V  L   R   EMVI#RS  AD #    ERMV R   G E#V# I
Conservation:  1233887928312332215224433112221211203233452122322222111033144454774554344210322423223232142524597953
SS_PSIPRED:                                                                                         HHH  HHHH      
SS_SPIDER3:        E                                   H                                    H       HHH HHH        
SS_PSSPRED:                                                                                             HHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDD   DDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDD  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D      DDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDD DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RPEEVKHQEQHHPELEDKDLDFKNKDTDISIKPEGVREPDKPAPVEGKIIKDHLLEESTFAPYIDDLSEEQRRAPQITTPVKITLTEIEPSVETTTQEKT 300
BenignSAV:                                                   E                        H                            
gnomAD_SAV:      KV      QQ K  VEG   EK #ANT V S   #DL# # AM E  V N   K P# V  LG   DK#S  LR         # VAL   S P  N 
Conservation:  2333110221001101111121124103121122010111001122121123223434431553321313222121134753645732122012122101
SS_PSIPRED:     HHH                                              HHHHHH            HHHH        EEEE                
SS_SPIDER3:                  HH                                                  H HHH         EE                  
SS_PSSPRED:                                                                        HHH                             
DO_DISOPRED3:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PEKQDICLKPSPDTVPTVTVSEPEDDSPGSITPPSSGTEPSAAESQGKGSISEDELITAIKEAKGLSYETAENPRPVGQLADRPEVKARSGPPTIPSPLD 400
BenignSAV:                                                             V                                           
gnomAD_SAV:    A   GM P     I L    L   EN    VIHL  E G   P Y E C N G K V PV  VEA #H  T D WLGD R Y  K    F# S   R Q 
Conservation:  2131312863514269588677988687382564432145644432210131343122322242223331221231011022222010121031121214
SS_PSIPRED:                                                        HHHHHHHHHHH                                     
SS_SPIDER3:                                                        HHHHHHHHHHH                                     
SS_PSSPRED:                                                        HHHHHHHHHHH                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                S                      S S                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HEASSAESGDSEIELVSEDPMAAEDALPSGYVSFGHVGGPPPSPASPSIQYSILREEREAELDSELIIESCDASSASEESPKREQDSPPMKPSALDAIRE 500
gnomAD_SAV:    R    T L     #V     LGT  T    #     #D L  L #L           H        M  #      L #R RP  Y*S#T HR     W 
Conservation:  1436427776665736355221132112333132322333242323321356554567655556563466535665656665732212111402333424
SS_PSIPRED:               HHHH      HH                           HHHHHHHHHHH  HHHHHHH                       HHHHHHH
SS_SPIDER3:                H       HH                            H HHHHHHHH      E                           HHHHHH
SS_PSSPRED:                                                          HHHHH     HHHHH                               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                            S             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ETGVRAEERAPSRRGLAEPGSFLDYPSTEPQPGPELPPGDGALEPETPMLPRKPEEDSSSNQSPAATKGPGPLGPGAPPPLLFLNKQKAIDLLYWRDIKQ 600
gnomAD_SAV:    DS  W  K# # P  V  L    EFR  DHRHD # ST  RDQ   KSV  G A   L  DK  V  #DS   CHV   #   FS#R     V  W  T 
Conservation:  4141321101120010213130210201121201323211112111231111210121111111112311111120122141242644535775996476
SS_PSIPRED:    HH   HHH                                                                        HHH     HHEEEEE  HHH
SS_SPIDER3:    H                                                                               HHH     EEEEEEE  HHH
SS_PSSPRED:                                                                                         HHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TGIVFGSFLLLLFSLTQFSVVSVVAYLALAALSATISFRIYKSVLQAVQKTDEGHPFKAYLELEITLSQEQIQKYTDCLQFYVNSTLKELRRLFLVQDLV 700
gnomAD_SAV:       M ANC      V L  M GIM   T  T L A  YC  E         NK N   T    G       M   M    LCL             E   
Conservation:  7646666399776667496555324433452454455555444485456434434545376427435625753443412315382333544554554544
STMI:            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH  EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        H H     E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70      
AA:            DSLKFAVLMWLLTYVGALFNGLTLLLMAVVSMFTLPVVYVKHQAQIDQYLGLVRTHINAVVAKIQAKIPGAKRHAE 776
gnomAD_SAV:                 NI T              V   R           E  R     T  I     V   ST SQTQ
Conservation:  4353455545363559556799997645976553284553545364866456454446254564333354332112
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                          DDDDDD                  DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDD
DO_IUPRED2A: