Q16849  PTPRN_HUMAN

Gene name: PTPRN   Description: Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N

Length: 979    GTS: 1.646e-06   GTS percentile: 0.513     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 490      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRRPRRPGGLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDD 100
gnomAD_SAV:        QP    WE RV Q          H AD        G   L            D  VR RM MR TW      FS   C   M Q#        NNE
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111101032110100021310534563521111111113344311523331332142013324233
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                  
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHH       HHHH   EE        EEEE        EE            HHHHHHHHHHHHHHHH       H
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHHHHHH           E E          EEE        E          E   HHHHHHHHHHHHHHHH       H
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHHH                         EEE                EE    HHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  BBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD                                                                                            
DISULFID:                                             C      C     C        C                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LTQYVISQEMERIPRLRPPEPRPRDRSGLAPKRPGPAGELLLQDIPTGSAPAAQHRLPQPPVGKGGAGASSSLSPLQAELLPPLLEHLLLPPQPPHPSLS 200
gnomAD_SAV:       D   R   H L  H#L  H  G P S HRK    EKP S       TL T RQ   RL  RD  R#N P Y     RFL     V  LQ*TSY  M 
Conservation:  1451342265214322211100011111111010000111111211211111111111111111111100110101121123233113121311111000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH                         HHH           HHH                    HHHHHH HHHHHH             
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH                          HH           HHH                         H  HHHH              
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHH                                      HHHHH                     HHHH  HHHHH             
DO_DISOPRED3:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDBBBBBDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YEPALLQPYLFHQFGSRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPAQLFQDSGLLYLAQELPAPSRARVPRLPEQG 300
gnomAD_SAV:     K  V  L# LQ LDCPG#T A    S I N SS   T   D  T   # A  RG L  CCR F     P VL    P   S KF    TSKLS      
Conservation:  0111111111111111111020101111110011010102111112102011011112011021121112112111111111110201011100110111
SS_PSIPRED:                                            HHHH                        HHHHHH   HHHHHH                 
SS_SPIDER3:             H H                            HHHH                        HHHHH    HHHH                   
SS_PSSPRED:            HHH                             HHHH  HHH                    HHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDD   DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDD              D    DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSSRAEDSPEGYEKEGLGDRGEKPASPAVQPDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAGRNPGGVVNVGADIKKTMEGPVEGRDTAE 400
gnomAD_SAV:    N RW K     *   R  EC GE S L#MKL VT * PDT  V   L  H PN  H   PM# V   A S# I L## A I G     V  L V  G # 
Conservation:  1111111011111111111011211111111401312321241122222102120222122112102111010110100110000111111000100111
SS_PSIPRED:              HHHH                 HHHHHHHHHHHH     HHH  HHHHHHHHHHHHHH                                 
SS_SPIDER3:                                   HHHHHHHHHHHH      HH  HHHHHHHHHHHH                                   
SS_PSSPRED:                                    HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:             S                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVLLEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIVTDQKPLSLAAGVKLLEILAEHVHMS 500
BenignSAV:                       R                                                                                 
gnomAD_SAV:     L P  SI  YT  RSA R G K S L  F  #  S TLL  A  GN GLR     M VE    H  TD   *VI YR   R P  M    T  K   V 
Conservation:  0011000000010010110001101011111010100110000111010011100111110001000021032521122232101221322032122222
SS_PSIPRED:                                                 EE                        EEEEE      HHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:                                                                       HH  EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                                                                          EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            
SITE:                                                         KS                                                   
CARBOHYD:                                              T                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCV 600
gnomAD_SAV:     R   I N#  S  I H WN K  P  TH   ET  M Y     R F    KR   KD T    L AT G   TH    A AV  RA   P V  MV   
Conservation:  2213123121543435322230133221222103201500331122323322412121111111211020022022232344232232234222222173
STMI:                                                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:       EEEEEEE  EEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE       HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EE  EEE  EEEEEEE       HHHHHHHHHH HHHHHHHH  EEEEE    H                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EE    EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_IUPRED2A:                                                               DDDDDDD                                 
CARBOHYD:           N                 N                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RQHARQQDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYME 700
gnomAD_SAV:    W  VW K   C PV  S# S            C    K Y  SWT A TA  QL N      NTTH     R N#L   K L    T   MRQ    * G
Conservation:  5203210233252234112212243035133555232111222412111112242323323462412554323423333343322133324442552243
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH                                                      HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH                  HHH   E                E                                  H HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH                                                     HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               
DO_IUPRED2A:           DDDDDDDDDDDD     DD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWE 800
gnomAD_SAV:    V  W Q HF E   V R *E K  ART T RK  F#N #  A       HV  R     FW#N V T  VL R  Q  P VVMRDL  DI T  G I  K
Conservation:  3331422251455334323244321102510205022340122434432631631402122164454424332444151245433633232226233344
SS_PSIPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHH                                 EEE              EEE       HHHEEE    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHHH          H                    HHEEEEE        EEEE E         HEEE E      HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHH                                                            EE     HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                               DDDDDDDD                                                                   
DO_IUPRED2A:                              DDDDDDDD DDDD                         D                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRG 900
gnomAD_SAV:     S  IFI   L       H E# RL DD     IH   R W DT*YKN V   LF#  # N K   HM V L    TGS AT  W P   H  G    G 
Conservation:  3353354424461935223523643433323332385334364434233535664344212244432432214431111450313324322632324332
SS_PSIPRED:    H  EEEEE        EE               EEEEEEEEEEE HHEEEEEEEEEEE     EEEEEEEE             HHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:       EEEEE  E      E            EE EEEEEEEEEEE E EEEEEEEEEEE     EEEEEEEEEE E         HHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    H  EEEEE                       EEEEEEEEEEE HHHH EEEEEEEEEE     EEEEEEE             HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        8
AA:            RSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ 979
gnomAD_SAV:    C    VM R N      I V MN   K#R        VT    Q    Q    H   L  VSVS MVV A   R T   
Conservation:  4355335745141321322432321744232432222113322342314112312124322112321323323321111
SS_PSIPRED:        EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:        EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:        EEEE         HHHHHHHHHHHHHH   EEEHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                               DD
DO_SPOTD:                                                                                     
DO_IUPRED2A: