Q17RM4  CC142_HUMAN

Gene name: CCDC142   Description: Coiled-coil domain-containing protein 142

Length: 750    GTS: 1.137e-06   GTS percentile: 0.284     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 381      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQASRSGSLPPLVIVPPLRAQPGGTGEEQWERSRTGGLRWEVHCWPSGTSGGTPWWPTPADVSEDYEADAAAWRRGPAGGGPIPPALQRLRAVLLRLHR 100
gnomAD_SAV:    T P  S S R S L  SL   P#W  E  PGQ    A  C*D DY*T   YR KL#C#     R Y G   ET KWE  DDDR  SV  #      P   
Conservation:  4332233315332221223211313021112111122111021131222220302221121022210202222101223121311214222312622732
SS_PSIPRED:                                             EEE                          HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                HHH           EE                      HHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                            EE                            HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                         
DO_IUPRED2A:   DDDD   D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D DD      D DDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDD D               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EREQLLQARDCAYHLQSAVRLMKTLSPGSPSGGPSPLPQWCRDLQLHPSQGAVLRIGPGETLEPLLLARPIGLAAQCLEAVIEMQLRALGREPASPGLSS 200
gnomAD_SAV:    Q *E F    YS L    LQ TE     LQ#CDT  #RH YCH   YS  E#  Q   A  VK  R    V    *   G M* RR   #L    LD W 
Conservation:  4732843353533343142144003010011010014125325522422441041142223121252121125113345214211621343222111312
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHH        HHH       HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHH           EE      HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH           H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH                  HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLAELLFALPAYHTLQRKALSHVPGAARPFPTSRVLRLLTGERGCQVASRLDEALQGSALRDQLRRRCQEEGDLLPGLLGLVGGVAGSASCGLGLGGAGA 300
gnomAD_SAV:    *  K  L  #V  I   NV     VG    RKPH FG F V##SWEA NWP KV  # #   R    *K  E   S#        V       W RV  D
Conservation:  2625341342275234221000000031353213660576125611361281023111120123011322422220044223233211122325231212
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH              HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               H HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                      DDDDDDDDDDD         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LWSQYWTLLWAACAQSLDLNLGPWRDPRATAQQLSQALGQASLPQECEKELASLCHRLLHQSLIWSWDQGFCQALGSALGGQSSLPTSSGTAELLQQLFP 400
gnomAD_SAV:    F NR        F         # G L  IE   T#  #RT    QY  D V  ##S HQ * S N E  I    V    V   R       A       
Conservation:  7223621556123223501143121001024216114301433514321251142114211222019612351373332143311100506321232523
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                D    DDD              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLLDALREPRLRRIFCQPADPAPVALGLCTLQTTLLWFLGRAQQYLAAWDPASFLLLIQKDLPPLLHEAEALYSLASEESLALEVEQQLGLEIQKLTAQI 500
gnomAD_SAV:    S W T Q    #WT  *#  AV  T  PR   IAV *    D      *N             S    T TVD              EP    RR A PM
Conservation:  4711242111211003123120231324352533216313532344427341376454645922621222141043111011132114201241032204
SS_PSIPRED:    HHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH        EE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH  H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLLPEESLSVFSQECHKQAMQGFKLYMPRGRYWRLRLCPEPPSAPSEYAGLVVRTVLEPVLQGLQGLPPQAQAPALGQALTAIVGAWLDHILTHGIRFSL 600
BenignSAV:                                      Q                                                                  
gnomAD_SAV:    * V   LV          GL CL P LRPSQF W H  RV         SV IHNL KAGV AS R  HRT*    D   M  M      M  #R W   
Conservation:  2254112612631172535242623278154586221245251155354115422654666374315513242237215435344576458833466854
SS_PSIPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H                    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E H
SS_PSSPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGALQLKQDFGVVRELLEEEQWSLSPDLRQTLLMLSIFQQLDGALLCLLQQPLPKSQVHRRPPCCCACQEVQTTKLPSSCLNSLESLEPPLQPGTSPAQT 700
gnomAD_SAV:     RG K RP L # K# V  K  T CS VC  P T  #    NRVV      T   PE N ## S   R Q  P    R  F #VQ   #T R  ITL   
Conservation:  5986885486525413524323364253241462635634344442465877113112212211772111123322322353354244111011101201
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                               HHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH                                                  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                   
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                         D  DDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50
AA:            GQLQSTLGGRGPSPEGYLVGNQQAWLALRQHQRPRWHLPFFSCLGTSPES 750
gnomAD_SAV:    D  P I  RKEL L#           G S*Y Q C R T C # A  L  
Conservation:  11221331112122434411244243345121122322222132211320
SS_PSIPRED:                  HHH  HHHHHHHHHH           HH        
SS_SPIDER3:                  H  HHHHHHHHHHHH                     
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHHHHH                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                              DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD