Q17RS7  GEN_HUMAN

Gene name: GEN1   Description: Flap endonuclease GEN homolog 1

Length: 908    GTS: 1.419e-06   GTS percentile: 0.411     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 466      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGVNDLWQILEPVKQHIPLRNLGGKTIAVDLSLWVCEAQTVKKMMGSVMKPHLRNLFFRISYLTQMDVKLVFVMEGEPPKLKADVISKRNQSRYGSSGKS 100
BenignSAV:                                                                                                T        
gnomAD_SAV:    V   G *KV   L #   #C   R    I   F#L  G S   TI NLV    #  L # TC I  G T IS     A    S  K #   FQ      L
Conservation:  8863399566354343224128294458666648686762642838281896866687825273454648498389358258436415842154512130
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHH EE  HHHH   EEEEEHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE        HHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHH  EE HHH    EEEEEE HHEEHEHHEE        HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE        HHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHH    HHH    EEEEEEHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE        HHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  D                                                                                               DDDD
DO_SPOTD:                                                                                              DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DDD 
METAL:                                      D                                            E                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WSQKTGRSHFKSVLRECLHMLECLGIPWVQAAGEAEAMCAYLNAGGHVDGCLTNDGDTFLYGAQTVYRNFTMNTKDPHVDCYTMSSIKSKLGLDRDALVG 200
BenignSAV:                                               S                                                         
gnomAD_SAV:    * # REI     I   WF  VK    LSFHP#  S V #   S   R#N Y  S  #      #N N D  # RQN N YSH L   RN P   G  V  
Conservation:  0102238416323956932765359588719499998898485304156795859995997865668588446356544558132142218352543765
SS_PSIPRED:    HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE  HHHHHHHHHHHH     EEE   HHHHHH   EEEE           EEEEHHHHHHH    HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE  HHHHHHHHHHH     EEEE   HHHH    EEEEE         EEEEEHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE  HHHHHHHHHHHH    EEEE   HHHH     EEEE           EEEEHHHHHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                          E E                  D D                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAILLGCDYLPKGVPGVGKEQALKLIQILKGQSLLQRFNRWNETSCNSSPQLLVTKKLAHCSVCSHPGSPKDHERNGCRLCKSDKYCEPHDYEYCCPCEW 300
BenignSAV:       V                                                                                                 
gnomAD_SAV:      V  DYNC L E     N  T T V        F    W       P LR   IE  SYR IS   D    Y HS RK R GY #     CDC SLY #
Conservation:  6454587565988658888846867512537557957702721110100111012332255238277751327431880482502394534222177658
SS_PSIPRED:    HHHHH             HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH        HHHHH                                            HH
SS_SPIDER3:    HHHHH             HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH       HHHHHHHHH              H                          H
SS_PSSPRED:    HHHHH             HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH                                       HH
DO_DISOPRED3:                                                                        D D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDBDDDDD
DO_SPOTD:                                                                      DDDDDDDDDDD                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                D                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HRTEHDRQLSEVENNIKKKACCCEGFPFHEVIQEFLLNKDKLVKVIRYQRPDLLLFQRFTLEKMEWPNHYACEKLLVLLTHYDMIERKLGSRNSNQLQPI 400
BenignSAV:              N                                                                                          
gnomAD_SAV:    YH   E   N A     N    *KV LYPKI EG   D N      G          S  F   K*SSND Y  S LR A   V K  V N   # IRSV
Conservation:  7204103311237235568611423998156528772365431103013484654472762478593238675843375632552354151011044363
SS_PSIPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH         EE     HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH          E     HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH        EEE   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RIVKTRIRNGVHCFEIEWEKPEHYAMEDKQHGEFALLTIEEESLFEAAYPEIVAVYQKQKLEIKGKKQKRIKPKENNLPEPDEVMSFQSHMTLKPTCEIF 500
gnomAD_SAV:    *  N *#  V RYL      R R  # N  RE          T   V    MI   * P  #M  E * L N  G SF  S  I   RP L   L YK  
Conservation:  6616273544525676382275473135211111052747322752354543420612223211233256041433101211242132423343211110
SS_PSIPRED:    EEEE      EEEEEEEE    HHH        EEEE    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    EEE  EEE  EEEEEEEE   HHH         E       HHHHHHH HHHHHHHHH HHH                    HHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHEEEE     EEEEEE                EE   HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                        DDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DD D        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HKQNSKLNSGISPDPTLPQESISASLNSLLLPKNTPCLNAQEQFMSSLRPLAIQQIKAVSKSLISESSQPNTSSHNISVIADLHLSTIDWEGTSFSNSPA 600
gnomAD_SAV:      H CR  W FA##AA      FP#         ILR T    L CFI    TRRME  N*PI  A    S   R TFM  N QF #   *S TSG Y P
Conservation:  1111101110011100101210001001211310000201111000110110001010011211112111123211322322627424233324431341
SS_PSIPRED:                           HHHHH           HHHHHHH     HHHHHHH                   HHH                    
SS_SPIDER3:                                          HHHHHHH       HHHHHH                    E E  EE         EE    
SS_PSSPRED:                           HHH             HHHHH         HHHH                                           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D      DDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       D  DDDDDDDDDDDD                                           DDDDDDD                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQRNTFSHDLKSEVESELSAIPDGFENIPEQLSCESERYTANIKKVLDEDSDGISPEEHLLSGITDLCLQDLPLKERIFTKLSYPQDNLQPDVNLKTLSI 700
BenignSAV:                                                                                    I                    
gnomAD_SAV:        NS      K   KP  M N   HNA R A  LD  PGKMRQL N Y A FN   # FC T# VS   MS   *  I   C H  V AHIS  I CV
Conservation:  0100101110000200000202012110101100210001000121100102011112031221101123326643442241201101113011122100
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHH         HHHHH             HHHHHHHH               HH  
SS_SPIDER3:              HHHHHHHH                  HHHHHHH HH         HHHHH             HHHHHHHH                   
SS_PSSPRED:                HHHHHHH                HHHHHHH              HHHH             HHHHHHH                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DD             D          D              DDDD                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSVKESCIANSGSDCTSHLSKDLPGIPLQNESRDSKILKGDQLLQEDYKVNTSVPYSVSNTVVKTCNVRPPNTALDHSRKVDMQTTRKILMKKSVCLDRH 800
gnomAD_SAV:     RIE PSVG  D      #  G L  A    T     V VVR  P YCEF N#A   F    I N    L S P G    D T  SQRT  RRT   YTR
Conservation:  1111000101001002012120021110001211000000001011001010100000110010100001201111100210011103121534460111
SS_PSIPRED:     EEE           HHHHHH                    HHHHHH               EEE                   HHHHHHH         
SS_SPIDER3:      EEE                                                  E     EEE                        EE          
SS_PSSPRED:     EEEEE                                                 EE     E                     HHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                      DDDDDDDD  DDDDD  D D                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDD               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSDEQSAPVFGKAKYTTQRMKHSSQKHNSSHFKESGHNKLSSPKIHIKETEQCVRSYETAENEESCFPDSTKSSLSSLQCHKKENNSGTCLDSPLPLRQR 900
BenignSAV:                                                                                                      C  
gnomAD_SAV:     F   G# L  R  HAIE L       S CR NK  Y    NS V# R#     KY   GG  K  #  * TRYP YP  PERDK        # T CH 
Conservation:  2335442122010101011010112001111121100010110100010011000111001111102100100111210001111111201356476255
SS_PSIPRED:      HHH                       HHH                 HHHHH                                           HHHH
SS_SPIDER3:                                 HH                HHHHH                           H                HHHH
SS_PSSPRED:                                                     HHHH                                           HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD
DO_IUPRED2A:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DD                       DDD         DDDDDD      
MODRES_P:      SS                                                                                                  

                       
AA:            LKLRFQST 908
gnomAD_SAV:    V  T    
Conservation:  55253402
SS_PSIPRED:    HHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHH   
DO_DISOPRED3:  D   DDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD D D