Q4G0X9  CCD40_HUMAN

Gene name: CCDC40   Description: Coiled-coil domain-containing protein 40

Length: 1142    GTS: 1.523e-06   GTS percentile: 0.458     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 27      gnomAD_SAV: 701      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEPGGAAGRSHPEDGSASEGEKEGNNESHMVSPPEKDDGQKGEEAVGSTEHPEEVTTQAEAAIEEGEVETEGEAAVEGEEEAVSYGDAESEEEYYYTET 100
BenignSAV:            P                   G                                                                        
gnomAD_SAV:       L  #G GA L  RL#         K    LL  QG  K    D SR    KK A  VK SV  # GKI E T    V  TA C    IQKQ* C  I
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111002111121221110211111111111111111111111111111111011011111111111
SS_PSIPRED:                         HHH                    HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH 
SS_SPIDER3:                                                         HHHHHHHHHHHHH    H   HHHHHHHHH                 
SS_PSSPRED:                                                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSPEGQISAADTTYPYFSPPQELPGEEAYDSVSGEAGLQGFQQEATGPPESRERRVTSPEPSHGVLGPSEQMGQVTSGPAVGRLTGSTEEPQGQVLPMGV 200
BenignSAV:                                                             I                                           
gnomAD_SAV:    * L    GS  AS L   TS    R #  N INR T V*S  H  IS  A   K AIF  S  R   LLG  R   P    D      KA  VRL QVRI
Conservation:  0010110100100100121101010110111111111111111111111111111111111111111111000211001000000000010110111011
SS_PSIPRED:                                        HHHHHHH       HHH                                              H
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                     HHH    HHH                                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QHRFRLSHGSDIESSDLEEFVSQEPVIPPGVPDAHPREGDLPVFQDQIQQPSTEEGAMAERVESEGSDEEAEDEGSQLVVLDPDHPLMVRFQAALKNYLN 300
BenignSAV:               N                                                                                         
gnomAD_SAV:      GL# T # N Q    GD AL  S N # E N    KE V    N       KQ V#  T   K N K  D KE        ## P     DS      
Conservation:  1111012012110111012011111111111111111111111111111111111111111112312141123111244464535774264525541471
SS_PSIPRED:    HHHHH           HHHHHH                    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HH    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       H           HHHHH                      HHHH       HHHHHHHHHH      HHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHH            HHHHHH                   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH   EE     HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D  D  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                  
MODRES_P:                                                         S                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RQIEKLKLDLQELVVATKQSRAQRQELGVNLYEVQQHLVHLQKLLEKSHDRHAMASSERRQKEEELQAARALYTKTCAAANEERKKLAALQTEMENLALH 400
BenignSAV:                    T                                    T                     Q  T   K                  
gnomAD_SAV:    Q  K   M H K A TIER *  W * EAT CD  KR  QRR V  R  #GYTV LRKHG        TCT H QS TGG#K HQQ V   A LKS   #
Conservation:  4445332345344011140111214333204323632743441174214211204211333242372125114102011111422144256343623233
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBBB  D                        D DDDDDD      DDDDD  DDDDDDDDD     D
DO_SPOTD:        D  D   D  DDDDD  D                                                                                
DO_IUPRED2A:                             D                     DDDDDDDDDDDDDD  DD                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFYMQNIDQDMRDDIRVMTQVVKKAETERIRAEIEKKKQDLYVDQLTTRAQQLEEDIALFEAQYLAQAEDTRILRKAVSEACTEIDAISVEKRRIMQQWA 500
BenignSAV:     V     T                           K                      T                              I           
gnomAD_SAV:    VC V  TN NVC N HLT * L E KM   Q #MQ  *H      FA Q  K   NS# Y P     V GIQL   GG  SS K NT#IM  SHM#  * 
Conservation:  5354634235434351334332374144514651362599556747523222636333435371057334632443533880344456143443542472
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                      D   DDDDDDDDDDDDDDD   D                              D DDD D       D  D   D DDD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSLVGMKHRDEAHRAVLEALRGCQHQAKSTDGEIEAYKKSIMKEEEKNEKLASILNRTETEATLLQKLTTQCLTKQVALQSQFNTYRLTLQDTEDALSQD 600
BenignSAV:               #                                                                                         
gnomAD_SAV:    N  LD#M CNKVQGV   TPTV  Q   TANSK KG ET     K   KT V    QR M GA  *     R P E#  R#            Q     E
Conservation:  2462344344743143452341223431544264344464513666488194127462324223246642443233657523445514473455124222
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:   D                                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                    DDDDDDD         DDDDD                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLEQMILTEELQAIRQAIQGELELRRKTDAAIREKLQEHMTSNKTTKYFNQLILRLQKEKTNMMTHLSKINGDIAQTTLDITHTSSRLDAHQKTLVELDQ 700
BenignSAV:                                  V                                                                      
gnomAD_SAV:       *T  M     SC T   K A TKNM D #Q    K I  I  AR LSK       K  TVT R     SN # I  HV YIG K  TYR IVM P H
Conservation:  1151221224511424233231114124522532356453544545444136216411233352154233645232416423231133226212513753
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                               D   DDDDDD                            DD            D                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DVKKVNELITNSQSEISRRTILIERKQGLINFLNKQLERMVSELGGEEVGPLELEIKRLSKLIDEHDGKAVQAQVTWLRLQQEMVKVTQEQEEQLASLDA 800
BenignSAV:                                                        P                      M   H                     
gnomAD_SAV:     M   DK N      M QHML MK  L   T       QI  K       TPAF # K     #K ND VI   M   C *  #IN#   RQKRVG PNT
Conservation:  6322132353125323451124434742352034455215452484364596553522512336412114111520751363354234333523211311
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                  DD                                                      
DO_IUPRED2A:                                                                                             DDDD D DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKKELHIMEQKKLRVESKIEQEKKEQKEIEHHMKDLDNDLKKLNMLMNKNRCSSEELEQNNRVTENEFVRSLKASERETIKMQDKLNQLSEEKATLLNQL 900
PathogenicSAV:                                                                  S                                  
BenignSAV:                                                                          C                              
gnomAD_SAV:     E  F  TK    #I  QTK## E K   KRQV  P  N  NV K     WR LQ   #  W  D  LMHL N  K   FR #EE    #KVR#I  S P
Conservation:  3343144345434423322214024223343324161276248327324511212283113234534732266245443323423221114552233236
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD             D DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD DDDDD DDDDDDDDDDDD DDDD DD    DD    DDDDDDD DD           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEAEHQIMLWEKKIQLAKEMRSSVDSEIGQTEIRAMKGEIHRMKVRLGQLLKQQEKMIRAMELAVARRETVTTQAEGQRKMDRKALTRTDFHHKQLELRR 1000
BenignSAV:                                 S   S                                 L                                 
gnomAD_SAV:     G K#  VR KE S      #F    KMS RKSQ  N K P  TI  RH  E#PK   C #  VATLGD IAN  Q  CMI # V #CPN  R H   HW
Conservation:  4544335578587456368643445331242533146146554543313836445264445523534763421434331412240143224322113835
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                       DD  DDDDDDDDDDDD  D                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDD             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIRDVRKATDECTKTVLELEETQRNVSSSLLEKQEKLSVIQADFDTLEADLTRLGALKRQNLSEIVALQTRLKHLQAVKEGRYVFLFRSKQSLVLERQRL 1100
gnomAD_SAV:        IP   N Y   #P       I NNF P  E E L     INI KVEVIQP P  *  VL SM   SH  Y HTM #RH M   CF  YPG #PR#P
Conservation:  4623333122232223045412411321141344115102211211321321141215225421443262515364351552722223311221132224
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                   DD     D           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40  
AA:            DKRLALIATILDRVRDEYPQFQEALHKVSQMIANKLESPGPS 1142
BenignSAV:                  M  K                        P
gnomAD_SAV:    H * V  T    CMQEK*S CRK   Q  E VTI# * L  P
Conservation:  115511322452331252743223832413132122111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:           DD D           DDDD  DDDDDD DDDDD
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                      D  DDDD