Q53GD3  CTL4_HUMAN

Gene name: SLC44A4   Description: Choline transporter-like protein 4

Length: 710    GTS: 1.703e-06   GTS percentile: 0.538     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 356      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGGKQRDEDDEAYGKPVKYDPSFRGPIKNRSCTDVICCVLFLLFILGYIVVGIVAWLYGDPRQVLYPRNSTGAYCGMGENKDKPYLLYFNIFSCILSSNI 100
BenignSAV:          L                                                                                              
gnomAD_SAV:    RRVE WEK  DP R   T NA  Q S  S      #Y I L V V S  ML TA R#H ESWK FF      V G      H L I    N   M   ST
Conservation:  1111111111111201001210312220121244222224212132132132135623665434345435161355110411321445343316212222
STMI:                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                             
SS_PSIPRED:                                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH                           HHHH      
SS_SPIDER3:                                      HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HH          E           E     HHH    HH
SS_PSSPRED:                                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE   HHH                                     
DO_DISOPRED3:  BBBBDDDDDDDDDDDD                         D     DD                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD DDDDDDDD  DD                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDD     D                                                                                        
CARBOHYD:                                                                          N                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISVAENGLQCPTPQVCVSSCPEDPWTVGKNEFSQTVGEVFYTKNRNFCLPGVPWNMTVITSLQQELCPSFLLPSAPALGRCFPWTNVTPPALPGITNDTT 200
PathogenicSAV:                                                        V                                            
BenignSAV:                           V    E               SS                                         I             
gnomAD_SAV:      IG KS *    R R  FFLGE   A   KSL     I C  SG#  PSRIL   MAVI  *       FFT T    H   #A II # H   NK  I
Conservation:  3111111316452547622961021230000000111000011221392112000102023301227613224423132564611001030111513020
SS_PSIPRED:      HHH         EEE           HHHH     HHHHH                  HHH                                     
SS_SPIDER3:    HHHHH        EEEE              E     HHHHH                  H      HHH           EE                H
SS_PSSPRED:                 EEEE                     HHHH                 HHHHH          HHH                       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                            N                                         N   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQQGISGLIDSLNARDISVKIFEDFAQSWYWILVALGVALVLSLLFILLLRLVAGPLVLVLILGVLGVLAYGIYYCWEEYRVLRDKGASISQLGFTTNLS 300
gnomAD_SAV:    TH  MGS     S G       Q  TKYRF FPFS E V           HV   T  P   Q    M  CS C R AK Q PQ#  TCTC #C II  C
Conservation:  2012020100133141423552574314404642452354337325536674251344423323451324463238304500510020240334532432
STMI:                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HH
SS_PSSPRED:    EEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                                       N  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AYQSVQETWLAALIVLAVLEAILLLMLIFLRQRIRIAIALLKEASKAVGQMMSTMFYPLVTFVLLLICIAYWAMTALYLATSGQPQYVLWASNISSPGCE 400
BenignSAV:                              V                                                           E          S   
gnomAD_SAV:    D   M KI P TVTA V        V    Q Q #  VT  N      E       *L        T   C  I#  H   L   EF F PF    SS #
Conservation:  3631245573233424222622433343354144023415437456553342254368328626524642743235348677504372412111100190
STMI:                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE           
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                                  N       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVPINTSCNPTAHLVNSSCPGLMCVFQGYSSKGLIQRSVFNLQIYGVLGLFWTLNWVLALGQCVLAGAFASFYWAFHKPQDIPTFPLISAFIRTLRYHTG 500
BenignSAV:                                                                                                 C       
gnomAD_SAV:         A *  M     AL # QI I R     AP  #F  S  T# I EF   V  I D D YI         *    A      L FF   C  HH A 
Conservation:  0111202916111011117102081711832140242231177325343669439833665555668695579961185145612651265134335636
STMI:                                                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        
SS_PSIPRED:                          EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                          EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                           EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:          N          N                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLAFGALILTLVQIARVILEYIDHKLRGVQNPVARCIMCCFKCCLWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGKNFCVSAKNAFMLLMRNIVRVVVLDKVTDLLLF 600
gnomAD_SAV:       LET T   M T W T     Y    G   IVCF L       #   T VR   CSVH T STDR  C A   SV I  TG  A   I HEL      
Conservation:  4356445565134224323454214231114012454116324535334225333423334447458235514422530723343357344735523452
STMI:           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FGKLLVVGGVGVLSFFFFSGRIPGLGKDFKSPHLNYYWLPIMTSILGAYVIASGFFSVFGMCVDTLFLCFLEDLERNNGSLDRPYYMSKSLLKILGKKNE 700
gnomAD_SAV:      E   ARCM F  S  L SC LA #    I        A I #   SC  T S  GI SL   M# VR      # H     RS VC   P F      
Conservation:  4564563523733554566233101101102107753649445113453344255444523653544564324542438611433332104212201111
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH            HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H H            HHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHEEEEEEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                   DDD
DO_SPOTD:                                                                                                       DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10
AA:            APPDNKKRKK 710
gnomAD_SAV:    ESS K MK  
Conservation:  1110111111
SS_PSIPRED:        HHHH  
SS_SPIDER3:              
SS_PSSPRED:        HHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDBB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDD