Q5HYW3  RTL5_HUMAN

Gene name: RTL5   Description: Retrotransposon Gag-like protein 5

Length: 569    GTS: 1.143e-06   GTS percentile: 0.287     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 234      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSEASGNLNSLRMANVALREELNALRGENANLGLQLGRALAEVNSLRGNVSSYIRWPVPIVPVLAEENLEFALSEIEVIPGGELPFLCRPPPRAEPDCIS 100
gnomAD_SAV:       V       H    S S       W  TI  F   K         VSF I VL    V    G DY  # FG       **PS      Q     Y  
Conservation:  4234212542163355346213300123231342421111212323333112211521251322334241321232121349412020112561215333
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH                                                     
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH                       H                             
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHH                          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD     D          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                         D  DDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDLLINVIQDRSTPDGPADPPLLPIPPPPALPPPASKEPPPQPPLAPLERPEIEPFSGDPVYLAEFLMQLETFIADHEVHFPGGAERVAFLISFFTGEAK 200
gnomAD_SAV:    #    K    GRI  RS  L# P  L #    Q  L  Q R  S  Q  Q K Q SP    F     K   I   H   Y L DDKQ    # L   K  
Conservation:  1112142111323766436324711321111112011012001101111111121011110100212011111886656758502323341433345853
SS_PSIPRED:     HHH                                                       HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH  HH
SS_SPIDER3:                                                               HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH   HHHHHHHHHH    HHH
SS_PSSPRED:                                                               HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                  
DO_IUPRED2A:            DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DWAISVTQEGSPLHANFPRFLDEIRKEFCGPIPPRVAKKAIRKLKQGHCTLGSYADAFQFLAQFLSWDDCRLQNQFLKGLSEFFRKELLWSTEMADLDEL 300
gnomAD_SAV:         I RDR LFYS LL   N ML       S#HM#T      R                TR VACNA C  # #    L  YC   F   K  H    
Conservation:  1443221131111225155677777946579399376777443201116242463544355655664564535312235669111168119421865556
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHHHHHH        HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHH       HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ILECVEIERKVRVPKPIPLPGVRNIIFPFAPSPNEEESEDEEYYSEDEDQEARRHRLHSKDQRKRMRAFQQEMKEKEEEEMKKEEEMKKKEEKEEEEEEE 400
gnomAD_SAV:      Q  GM K    L  L  A  * T     A RS K   Y            #K S    NPGNLL     DIQ E  DK        N# G   K    
Conservation:  5434362417228874366534325268269752641443234733261643545664345455868654635265214332115734231120011112
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH                                   HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                                   HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKQKEEEEEIRNKNEEEGESKDEEDEDEDGGQKPEGEPQQDPGTEETYGEVEEEPLDEAQDDDLDELMEMEPTFVHASSQTSGPTSGYHAENFLGASPPI 500
BenignSAV:                        R                                                                                
gnomAD_SAV:        G            V R HK    D  C Q K G *  S   K C K Q  SVHKT    VE   A  LP   V          S PQ    S    
Conservation:  0121410031223222221232231142532747486967821112101012101212533544244788889389874654443324221131231353
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH                                               HHHHHH   EEE               HHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH                                               HHHH                      HHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                                                  HHH                                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              D D    D               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        7
AA:            IQPSRRRNQNRVPLLEGLPGTNSPFYSSPQLIRRTGRLGQRQVRRRPPVLFRLTPRQGGHRAARGRIRV 569
gnomAD_SAV:     KSGTP    *    A   SN     G R   CC  H V H I#SH    LH  L L RLQ  C # * 
Conservation:  522212544465556444437241629646765485787791111111633463110210111111111
SS_PSIPRED:                                 HHHH               EEEEE                
SS_SPIDER3:                                 HHHH               EEEEE       EHH    E 
SS_PSSPRED:                                HHHHHHH             EEEEE                
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDD                                                DDDDDDDD D 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD