Q5KU26  COL12_HUMAN

Gene name: COLEC12   Description: Collectin-12

Length: 742    GTS: 1.071e-06   GTS percentile: 0.256     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 329      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKDDFAEEEEVQSFGYKRFGIQEGTQCTKCKNNWALKFSIILLYILCALLTITVAILGYKVVEKMDNVTGGMETSRQTYDDKLTAVESDLKKLGDQTGKK 100
BenignSAV:                                    D                   V                                      E         
gnomAD_SAV:       N T #     CS RQ        FAE TK      YV     F#    VIL # VC  L#E NS  SR  # C            #REN  H    E
Conservation:  4222312113122233112676764575666548486367268667836746465597568755553663643296327136514881567676545627
STMI:                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                          
SS_PSIPRED:                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:           HHH            E       H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH  HHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE           HHH HHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                              DDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                          DDD    D                     
CARBOHYD:                                                                        N                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AISTNSELSTFRSDILDLRQQLREITEKTSKNKDTLEKLQASGDALVDRQSQLKETLENNSFLITTVNKTLQAYNGYVTNLQQDTSVLQGNLQNQMYSHN 200
gnomAD_SAV:    TM      PI TTH    H*  H V   I  KE M KR  VRRHS   S   F   S  I  F#NS S    VHD  AMD   G GM HD     IH ##
Conservation:  3155545422862251175366125214312622182283124214131713432153274225114827814443141275156105712561821143
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHEHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEHHE HHHHHHHHH H   HHHHHHHH HHH  HHHH  
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEHHHHHHHHHHHH        HHHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                           D                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                             D     DDDD             DD                                      D          
CARBOHYD:                                                                N        N                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVIMNLNNLNLTQVQQRNLITNLQRSVDDTSQAIQRIKNDFQNLQQVFLQAKKDTDWLKEKVQSLQTLAANNSALAKANNDTLEDMNSQLNSFTGQMENI 300
gnomAD_SAV:    AFVI F K    H E  K  M   L     G S  *   GS D H   R     MV      #   MMD S PV      NI     G FS   D     
Conservation:  1223344298278178324422884545344344344556452757223432253486548523761352946434148353645523973243343383
SS_PSIPRED:    HHHHHHH     HHHH  HHHHHHH      HHHHH   HHHHHHHH HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHEEEEEEH
SS_SPIDER3:    HHEEEE   EEEEEE     HHHE    H  HHEH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH  H  E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH           HHHH       HHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                 D                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                        D                                                     DDDDDDD   DDDDDD         
CARBOHYD:                                                                            N                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TTISQANEQNLKDLQDLHKDAENRTAIKFNQLEERFQLFETDIVNIISNISYTAHHLRTLTSNLNEVRTTCTDTLTKHTDDLTSLNNTLANIRLDSVSLR 400
gnomAD_SAV:    NITP GKK      H SL # D  RPV  S    HS   KM  M N #  T I R  WM  N  H    S #AI    A      S    D H   L   
Conservation:  7224423344643425155222516413831391643028024326558484544296264248535864955562394618106616413331541185
SS_PSIPRED:    HHH     HHHHHHHHH           HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHH          HHHH
SS_SPIDER3:     HH HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                       HH
SS_PSSPRED:    E     HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH                                       
DO_DISOPRED3:                                                                       D         DDDDDD D DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDD    DDDDDDDD      D                                     DD   DDDDDDDDDDDDDDDD DDDD    DD D    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQQDLMRSRLDTEVANLSVIMEEMKLVDSKHGQLIKNFTILQGPPGPRGPRGDRGSQGPPGPTGNKGQKGEKGEPGPPGPAGERGPIGPAGPPGERGGKG 500
BenignSAV:                                                                                           V             
gnomAD_SAV:          KLK  A                # R        V    L    S      # HL #A   V      K   S  V     V SV HA QH S  
Conservation:  2694262267729836983596889489458597849997969999869569669329219219179339449229039328548209329229239019
SS_PSIPRED:    HH  HHHH                                                                                            
SS_SPIDER3:    HHHHHHH                                                                                             
SS_PSSPRED:                 HHHH                                                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKGSQGPKGSRGSPGKPGPQGSSGDPGPPGPPGKEGLPGPQGPPGFQGLQGTVGEPGVPGPRGLPGLPGVPGMPGPKGPPGPPGPSGAVVPLALQNEPTP 600
BenignSAV:                          P                                                                              
gnomAD_SAV:    P      R  C      D   CI #L  R Q     F  S  R A    R  I    MS  QR   F      L    #LS A LLRG      K    L
Conservation:  2391482783684386391382494592392392591392293383492491192391293392295292592293384583721112103131102111
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APEDNGCPPHWKNFTDKCYYFSVEKEIFEDAKLFCEDKSSHLVFINTREEQQWIKKQMVGRESHWIGLTDSERENEWKWLDGTSPDYKNWKAGQPDNWGH 700
BenignSAV:          S                                                                                              
gnomAD_SAV:     #QH S L Q         H      M    Q      F       A  QEE M  R      Y     NLKC     R  EK LE  D  V  L    Y
Conservation:  1241268501512323398444021016334100721125175483504771543233133234857857131621747568404151283297986722
SS_PSIPRED:                                 HHHHHH            HHHHHHHHHHH     EEEEEE      EEE                      
SS_SPIDER3:                               HHHHHHH H           HHHHHHHHHHH     EEEEEEE      EE     E   E            
SS_PSSPRED:                               HHHHHHH             HHHHHHHHHHHH    EEE          EEE                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD D         DD DDDDD DDDDDD DDD                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD DD                                                                                 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD                                             DDD       DDD        DD D          DDDDDDDDDDD
BINDING:                                                                                                 K  Q D    
METAL:                                                    F N   E                   D   E                   Q DN   
DISULFID:            C          C                C                                                                 

                       10        20        30        40  
AA:            GHGPGEDCAGLIYAGQWNDFQCEDVNNFICEKDRETVLSSAL 742
gnomAD_SAV:    DR T         D   DN  R EI   V    #    L   
Conservation:  122088776654205287662825142378631020120221
SS_PSIPRED:            EEEE              EEEEE   HHHH    
SS_SPIDER3:           HHEEEE   EE      EEEEEEEEE    EE   
SS_PSSPRED:            EEE               EEE             
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                           DDDDD
DO_IUPRED2A:   DD                                        
BINDING:            E           ND                       
METAL:              ED          ND           E           
DISULFID:             C             C       C