Q5SQQ9  VAX1_HUMAN

Gene name: VAX1   Description: Ventral anterior homeobox 1

Length: 334    GTS: 7.815e-07   GTS percentile: 0.132     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 117      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MFGKPDKMDVRCHSDAEAARVSKNAHKESRESKGAEGNLPAAFLKEPQGAFSASGAAEDCNKSKSNSAADPDYCRRILVRDAKGSIREIILPKGLDLDRP 100
gnomAD_SAV:      R LG   GQ #W VG  # #  P #G Q#  #T R  RGTL  QQH    VLDPT #F     SFV ELN   G  GLN   FTQ L   N       
Conservation:  8201011302183363110102203033345235424313111113013222133100120111022122342434564459695477957778677696
SS_PSIPRED:                  HHHHHH                    HHH             HHH           HHHH HHHH      HHHHH          
SS_SPIDER3:                  H HHH                     HHHH                            HHHHHHHE                    
SS_PSSPRED:                   HHHHH                                                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D   DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDD                                 D
DNA_BIND:                                                                                                         P

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KRTRTSFTAEQLYRLEMEFQRCQYVVGRERTELARQLNLSETQVKVWFQNRRTKQKKDQGKDSELRSVVSETAATCSVLRLLEQGRLLSPPGLPALLPPC 200
PathogenicSAV:                                                    S                                                
gnomAD_SAV:    R M     V  F    #V  CR   A     #  W    PDI              R  D                    M      F   S        
Conservation:  6858767775775685555656446589874244326254533303313133111423222111112202321524422223324341233422211132
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HH  HH      HHH          HHHHHH                 
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHEHHHH                            HHHHHH                  
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH       EEEE                              HHH                   
DO_DISOPRED3:                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD     D                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        D       
DNA_BIND:      KRTRTSFTAEQLYRLEMEFQRCQYVVGRERTELARQLNLSETQVKVWFQNRRTKQKKDQ                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATGALGSALRGPSLPALGAGAAAGSAAAAAAAAPGPAGAASPHPPAVGGAPGPGPAGPGGLHAGAPAAGHSLFSLPVPSLLGSVASRLSSAPLTMAGSLA 300
BenignSAV:                                  T                                                                      
gnomAD_SAV:    TRR PD     #                                           #     Y  TR       T  MHL  RC  GL    R AV     
Conservation:  1021120203321221111111111111111111121111111111111111111111111111111111211222111111122221210121121101
SS_PSIPRED:                            HHHHHH                                                HHH                   
SS_SPIDER3:                              HHH                                                                       
SS_PSSPRED:                          HHHHHHHH                                                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                              D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    

                       10        20        30    
AA:            GNLQELSARYLSSSAFEPYSRTNNKEGAEKKALD 334
gnomAD_SAV:          AP          *      D      M 
Conservation:  2111222121232223352132323211244211
SS_PSIPRED:      HHHH                        HH  
SS_SPIDER3:      HHH                             
SS_PSSPRED:      HHHH                      HHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDD