Q5SXM2  SNPC4_HUMAN

Gene name: SNAPC4   Description: snRNA-activating protein complex subunit 4

Length: 1469    GTS: 1.384e-06   GTS percentile: 0.395     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 973      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDVDAEREKITQEIKELERILDPGSSGSHVEISESSLESDSEADSLPSEDLDPADPPISEEERWGEASNDEDDPKDKTLPEDPETCLQLNMVYQEVIQEK 100
BenignSAV:                                                N                                                        
gnomAD_SAV:     E GVK       M K K   Y S LS QM ML  NVKAGC  NLR #D   L N#RML  #T  K G EK  R N  HS    S VR  V   K     
Conservation:  0220233224224322432140210111111131111111100312225320021121322402211434332213115314365765563658375376
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EE                            HHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHH           E                             HH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHH        EEE                                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD          
MODRES_P:                                                                         S                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAEANLLLAQNREQQEELMRDLAGSKGTKVKDGKSLPPSTYMGHFMKPYFKDKVTGVGPPANEDTREKAAQGIKAFEELLVTKWKNWEKALLRKSVVSDR 200
gnomAD_SAV:     #DT   RV* W   KK  KYM      R   SRG RSGI L   V   IR  IM ME  P KHI*A  TE NT  KK F I##RKR  V FLQA    C
Conservation:  6134216623942692442114141301211121012122558484499966424536775636353521233223224222472223414601562452
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  EE                    HHHHHHHHHH   HHHH      HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E           E        EE           HHHHHHHH     HHHH      HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                       HHHHHHHHHH   HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQRLLQPKLLKLEYLHQKQSKVSSELERQALEKQGREAEKEIQDINQLPEEALLGNRLDSHDWEKISNINFEGSRSAEEIRKFWQNSEHPSINKQEWSRE 300
gnomAD_SAV:      Q    T    K SD RHG   N  K #V  N ST  GE  R VK*   QV    #     *V    S  Q NC  KQM#NL R L   GV N Q#I K
Conservation:  6453458644545742272124213145215227310352552153142321728252525783575744755161523432585625683745118212
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH     HHHHH         HHHHHHHHHH            HH
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHE         HHHHHHHHH    HH       HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHHH        HHHHHHHHHH            HH
DO_DISOPRED3:                     D DDDDDDDDDD  D   D  D                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D                                              DDDDDD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEERLQAIAAAHGHLEWQKIAEELGTSRSAFQCLQKFQQHNKALKRKEWTEEEDRMLTQLVQEMRVGSHIPYRRIVYYMEGRDSMQLIYRWTKSLDPGLK 400
gnomAD_SAV:    VQKQ  # VT  SQ G L    #VRA HTT      L   K V  CQ RR  D HT MK  RDTHIS  V  C   HCV R G  R  C*R R  NR   
Conservation:  7312611451242123831562474426445486735711312565317411871262347245568355984564876559432963589413558265
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHH HH       HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH     HHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHH     HHHHHHHHHHH HHH      HHHHHHHHHHHHH        HHHHHH      HHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH    HHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:     DD                                        D  DD                                                   
DNA_BIND:                      WQKIAEELGTSRSAFQCLQKFQQHN                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGYWAPEEDAKLLQAVAKYGEQDWFKIREEVPGRSDAQCRDRYLRRLHFSLKKGRWNLKEEEQLIELIEKYGVGHWAKIASELPHRSGSQCLSKWKIMMG 500
gnomAD_SAV:         L K GN  R F  *RGR  Y  Q     #RNTK * W   K#YLR #  WR V KK     FVK C       T      Q  P     *RT  #
Conservation:  5918432883476375356613184766158868361375498433920336663630382136217428683838456645544723375433830526
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                          DDDDDD         D
DO_IUPRED2A:                                                                                                D      
DNA_BIND:                             WFKIREEVPGRSDAQCRDRYLRRL                            WAKIASELPHRSGSQCLSKWKIMM 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKQGLRRRRRRARHSVRWSSTSSSGSSSGSSGGSSSSSSSSSEEDEPEQAQAGEGDRALLSPQYMVPDMDLWVPARQSTSQPWRGGAGAWLGGPAASLSP 600
gnomAD_SAV:     R  VQ WQW  HN IG  PA  GS# #        T        D   V TR #H V RCAR # LAV   L P ECA  AR     TRP   V#   L
Conservation:  1110021211211000101331222110002000020000111220032010110010101001025141274811000010000000010000011001
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH                                    HHHHH                 HHH                        HH   
SS_SPIDER3:     HH HHHHH                                     HHH                    HH                             
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                                   HHH                                                   
DO_DISOPRED3:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                        S 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKGSSASQGGSKEASTTAAAPGEETSPVQVPARAHGPVPRSAQASHSADTRPAGAEKQALEGGRRLLTVPVETVLRVLRANTAARSCTQKEQLRQPPLPT 700
gnomAD_SAV:        TP   SN  TFI  T  A  A AM#FA# VDVAA#   * FY VVSCLV T R T D   C    SM  M K FG K# SQR IR        PAI
Conservation:  0011100010001000101000100100000000013121102030111101011011000131121243111320231011000001110101021000
SS_PSIPRED:         HHH                               HHH            HHHHH           HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:                                           HHH            HHHHHH          HHHHHHHHHH    H H             
SS_PSSPRED:                                                          HHHHH                       HHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D             D D  DDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                               S                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSPGVSSGDSVARSHVQWLRHRATQSGQRRWRHALHRRLLNRRLLLAVTPWVGDVVVPCTQASQRPAVVQTQADGLREQLQQARLASTPVFTLFTQLFHI 800
BenignSAV:                                                                                                       Q 
gnomAD_SAV:    L  AF    NMGP Q   VWPTVIRN  QH  RT RG   D#   V M # A  L MA  R C   TILHNEVH   KP    # G I M   L R  DV
Conservation:  0000001100011000202221100022220200200004111732442473522123111000211102433213212220114136447355533335
SS_PSIPRED:                    HHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH                       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHH       HHHHHHHHHH     H  E  E      E               HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                              HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH                        HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  D         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D   D
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD  DDDDD DDD  DDDDDDD                                 DDDDDDDDDD  DD                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DTAGCLEVVRERKALPPRLPQAGARDPPVHLLQASSSAQSTPGHLFPNVPAQEASKSASHKGSRRLASSRVERTLPQASLLASTGPRPKPKTVSELLQEK 900
gnomAD_SAV:    NAPS SD I#Q     LG   V  Q   I#F   F G  G L   C HMR   VL      VTQ  V  WMKC    V   TLAS W R   LL*     
Conservation:  6306942353233121110111010011100002321210032000110111120111001111111101100100111121210132123352346133
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH               HHHH                 HHHHHH                                    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHH                                      HHHH                                      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHH                                                                               HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLQEARAREATRGPVVLPSQLLVSSSVILQPPLPHTPHGRPAPGPTVLNVPLSGPGAPAAAKPGTSGSWQEAGTSAKDKRLSTMQALPLAPVFSEAEGTA 1000
gnomAD_SAV:    WF#GV# MKT W L   LPHP  FLF  F SAV   L S#SVLDSSI  AL     #STV TL      *Q#   V G SP  # T  FDL  #DTKA  
Conservation:  3112110111000001212221121122213212121101112111000001212112111120110210000110100111110111001001101001
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH           EE                                                                             
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH             E                       E                                                     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH             EE                                                                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAASQAPALGPGQISVSCPESGLGQSQAPAASRKQGLPEAPPFLPAAPSPTPLPVQPLSLTHIGGPHVATSVPLPVTWVLTAQGLLPVPVPAVVSLPRPA 1100
gnomAD_SAV:    R          S # M   *   R    ST TW   V  VS   LEG  L S  I S NVMY   S# V G   S  CM    RFFA#TIS MA     V
Conservation:  2011012110111121111011112111112111222211211121111110000121010100112113110221111121222111201101221111
SS_PSIPRED:     HHH                                                                        EEEE            EE      
SS_SPIDER3:                                                                               EEEEE       EE   EE      
SS_PSSPRED:                                                                                EEEEE           EE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D                DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTPGPAGLLATLLPPLTETRAAQGPRAPALSSSWQPPANMNREPEPSCRTDTPAPPTHALSQSPAEADGSVAFVPGEAQVAREIPEPRTSSHADPPEAEP 1200
gnomAD_SAV:       DLS Q  I   S I#SQE   # # P    S  S  ISWKAKLT TI PSVL PQ VFR    VV      #   *L    T # MFFQG #    S
Conservation:  1110111101111110101110101111002111111110111001121211000110112013211001011112110010011120110111030001
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                    H                                                            HHH                    
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                              T                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PWSGRLPAFGGVIPATEPRGTPGSPSGTQEPRGPLGLEKLPLRQPGPEKGALDLEKPPLPQPGPEKGALDLGLLSQEGEAATQQWLGGQRGVRVPLLGSR 1300
gnomAD_SAV:    T  EK L #DS T  S AT MLRFL   EDLSER    #   HHSR    T   QELS S A S   V E #  P  DKGTA *  E *W#MCM#H   K
Conservation:  0001002101011110030111120000011000000000000000000000000022111211310033227441412213128315127504313101
SS_PSIPRED:                                                                                  HHHHHHHH     EE       
SS_SPIDER3:                                                                             H    HHHHHHHH     EE       
SS_PSSPRED:                                                                                  HHHHHHHH     EEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDD         DD   
MODRES_P:                             S                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPYQPPALCSLRALSGLLLHKKALEHKATSLVVGGEAERPAGALQASLGLVRGQLQDNPAYLLLRARFLAAFTLPALLATLAPQGVRTTLSVPSRVGSES 1400
BenignSAV:                Q                                                                                        
gnomAD_SAV:     HC S #    *G FSFR R #VP  TV FPMGRSK  QL RTV VLVRV LRHF   L  FP WSW MVV AF#VF    V KSIC  V  SL     N
Conservation:  4565872335524631882162273015306310000101110213321262226226677577649987385387499542702102221010000112
SS_PSIPRED:           HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH       EEEE         
SS_SPIDER3:              HHHHHHHH  HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHH       E E E         
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE           
DO_DISOPRED3:  D                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                       DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                 DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                DDDD DD       D    D                                       DDDDDDDDDD D
MODRES_P:                                                                                                       S S

                       10        20        30        40        50        60        7
AA:            EDEDLLSELELADRDGQPGCTTATCPIQGAPDSGKCSASSCLDTSNDPDDLDVLRTRHARHTRKRRRLV 1469
BenignSAV:                                                    S                     
gnomAD_SAV:    DGD HVN# QFG   R LD AITA    VDAEC#   D P   ACD A N EMH  W  G  Q WKQ  
Conservation:  125221110100110000000000000311011100111101220000121200131210101213110
SS_PSIPRED:      HHHHHHH                                      HHH HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:       HHHHHHHH                                      H HH HH  H  HHH     
SS_PSSPRED:                                                              HHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDDDDD       DDDDDDDD        D DDDDD         DDDDDDD      DDDD 
MODRES_P:                                             S