Q5T7N2  LITD1_HUMAN

Gene name: L1TD1   Description: LINE-1 type transposase domain-containing protein 1

Length: 865    GTS: 1.237e-06   GTS percentile: 0.327     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 458      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSDVSTSVQSKFARLAKKKENITYMKREQLTETDKDIAPVLDLKCKDVSAIMNKFKVLMEIQDLMFEEMRETLKNDLKAVLGGKATIPEVKNSENSSSRT 100
BenignSAV:                               S                                                                         
gnomAD_SAV:    ITG  #    R  K #   QDTN*  S   R  V H  LL A   EN LT  SQIM   #VE   L  L   #  VP SAV    ITL   D  SCGG  
Conservation:  1111121356422442532422212312463344343233465644346424223224452561442526554547535354222334324122322222
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH HH    HH
SS_SPIDER3:         H HHHHHHHH H      HHHHHH    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH       HH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH      HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                          D DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D                        D  D                                                       D  DDDDDDDDDDDD 
MODRES_P:       S                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EFQQIINLALQKTGMVGKIEGENSKIGDDNENLTFKLEVNELSGKLDNTNEYNSNDGKKLPQGESRSYEVMGSMEETLCNIDDRDGNRNVHLEFTERESR 200
gnomAD_SAV:    G R  VSS  R AR A       # TC  K  V  T     PR #I  S * SR#  N  #    *  * TR I   S  VVGK   C  R    AS NG
Conservation:  3134333213112211321211022011336555242442442354421321422264545255632334243344122021311432112133251111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHH  HHHHHH           EEEE      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH           EEEE      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHH HHHHHHHH          EEE HHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DD  DDDDDDD
DO_IUPRED2A:                     DDDDDDDD D DD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D DDDDD     DDDDDDDDD   
MODRES_P:                                                      T    S                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KDGEDEFVKEMREERKFQKLKNKEEVLKASREEKVLMDEGAVLTLVADLSSATLDISKQWSNVFNILRENDFEPKFLCEVKLAFKCDGEIKTFSDLQSLR 300
BenignSAV:                                                  A                                                      
gnomAD_SAV:        G  FTKI   G V  F T GDI  P     MFI   #L   A E#L V      R*C I H  T   L   L  KI  T   #V M     Q N K
Conservation:  3114221232044221001102332122223212011313222143343424352122112132234352344523340336563245322243362475
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    EE   EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEEE  EEEEE  HHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  EEEE  EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE EEEEEEEE  EEEEE  HHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEEEE  EEE    HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDD                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KFASQKSSVKELLKDVLPQKEEINQGGRKYGIQEKRDKTLIDSKHRAGEITSDGLSFLFLKEVKVAKPEEMKNLETQEEEFSELEELDEEASGMEDDEDT 400
BenignSAV:             M                   N                                                                       
gnomAD_SAV:     #     CM  FP E  SE  GRSKE  NFENK  TV  V N  Y V  V N S N        IV   DTE  Q    KC K    EG T* T EED I
Conservation:  3412221031222223112132021345322324513433224624234232644437534562433323324182156536613113473533726633
SS_PSIPRED:    HHHH  HHHHHHHHHH    HHH                                   EEEEEE   HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHH                                        EEEEEEEEE  HHHH   HH HHHHHHHHHHHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH                                 EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                         DDDDDBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:           DD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                          DD DDDD          DDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGLEEEEEEPSGLEEEEEEEASGLEEDEASGLEEEEEQTSEQDSTFQGHTLVDAKHEVEITSDGMETTFIDSVEDSESEEEEEGKSSETGKVKTTSLTEK 500
gnomAD_SAV:         KQ DS      K  DV #  KVDS R QK     *K ET  ESD S VV DQA   G DV    T     A  KV #G  TCK AE  AA   QR
Conservation:  3226163211643434354414343544111112443302222625333325213243542122232132313244737545953265343343363355
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH         EEEE    EEEE     EEEEEEEEE                      HHHH
SS_SPIDER3:                  HHHH H             HHHH            EEE    EEEE     EEEEEE E     HH H         E        
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH          EE     EEEE     EEEEE                           HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                             S   S S                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KASRRQKEIPFSYLVGDSGKKKLVKHQVVHKTQEEEETAVPTSQGTGTPCLTLCLASPSKSLEMSHDEHKKHSHTNLSISTGVTKLKKTEEKKHRTLHTE 600
BenignSAV:                                                     T                                                   
gnomAD_SAV:     V C #  TS    A  F  E #  YRLLP  HKKK  VA SN  A IT  #FR V L#EL   G   Q  Q Y     LA I   Q  K*   T  Q  
Conservation:  5351344643134541554465436343114243323342223642425623422363355532424316224333362354332322244442435232
SS_PSIPRED:    H                   EEEEEEEEEE  HHHH                       HHH                           HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                           EE EE                       HHH                                   HHHH HHH  H
SS_PSSPRED:    H                     EEEE       HHH                                                     HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                       S                                          S           S                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELTSKEADLTEETEENLRSSVINSIREIKEEIGNLKSSHSGVLEIENSVDDLSSRMDILEERIDSLEDQIEEFSKDTMQMTKQIISKERQRDIEERSRSC 700
BenignSAV:                 I                                                                                       
gnomAD_SAV:       C   GFPAKIK    NI    L GR Q T      Y*# S M   #AVV    G PKKK#N   G*V  LCR  I   E V R   *  TQ K *  
Conservation:  3232444452233543443343213533445434362133131232322011022210163312033020211112212234121133322414232561
SS_PSIPRED:    HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDD D                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DD  DD  D   D  DD D  DD  D                                                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDD    DD                      DDDDD  DDDDDD DDDDDDDD         
MODRES_P:                                             S       S                S                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NIRLIGIPEKESYENRAEDIIKEIIDENFAELKKGSSLEIVSACRVPSKIDEKRLTPRHILVKFWNSSDKEKIIRASRERREITYQGTRIRLTADLSLDT 800
gnomAD_SAV:      H M     AN    V    NGMT  S S    #  P    V G  G   K   ST R#F   *S T    KVS  #D G       ST  I  *PV#K
Conservation:  4543264592031231111120431033342220010224114262421241000456245324130026326313341211222250222232332212
SS_PSIPRED:     EEEE           HHHHHHHHHHHHH        EEEEEEE              EEEEEE    HHHHHHHHHHH    EE   EEEE     HHH
SS_SPIDER3:     EEEE          HHHHHHHHHHHHH H       EEEEEEEEE           EEEEEEE     HHHHHHHHHH   EEE  EEEEEE    HHH
SS_PSSPRED:     EEEE          HHHHHHHHHHHHH         EEEEEE               EEEEE     HHHHHHHHHHH   EEE    EEE     HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60     
AA:            LDARSKWSNVFKVLLEKGFNPRILYPAKMAFDFRGKTKVFLSIEEFRDYVLHMPTLRELLGNNIP 865
BenignSAV:                                                                V     
gnomAD_SAV:     E   T*RS L     E   R    L    YV W EP ILPGT  LT D FYV I   F R DTS
Conservation:  23152220111203232430234224313142404121150313521143202414232421011
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEEE  EEEEE  HHHHHHHHH  HHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH     EE   EEEEEEE  EEEEE  HHHHHHHHH    HHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEE  EEEE   HHHHHHHHHH  HHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                  D
DO_SPOTD:                                                                       
DO_IUPRED2A: